Leta i den här bloggen


måndag 28 maj 2018

Transposonit

Etsin välillä suomalisia  selityksiä transposoneille. 

TRANSPOSONES (Transportable Elements, TEs)

http://jultika.oulu.fi/files/nbnfioulu-201606032237.pdf
Tämä työ kuvaa kasvikunnan kannalta näitä  genomisia asioita. 

 Transposonit, hyppivät geenit,   ovat sekvenssielementtejä, joille on kehittynyt kyky omatoimisesti liikkua ja monistaa genomisisältöä.
Niitä on kaksi pääluokkaa,  ja ne jakautuvat heimoihin ja perheisiin.
 Luokka I  on retrotransposoneita ja ne koodaavat mRNA:ta,  joka käänteiskopioijaentsyymin katalysoimana tekee uuden identtisen kopion sekvenssistä satunnaiseen kohtaan genomia.  Usein itse entsyymi on retrotransposonin koodaama tämä muistuttaa retroviruksen kopiointimekanismia.
Luokka II on DNA-transposoneja  ja ne toimivat "leikkaa-liitä" periaatteella. Avustava entsyymi  on transposaasi.  2

LTR = Long Terminal Repeat- tyyppisiä
Non-LTR, ei LTR-tyyppisiä
Tästä asiasta löysin hyvän opetusvideon viime yönä. pidän tämän tiedemiehen videoista.  niiden jälkeen tosiaan saa jonkin mitä insiktiksi kutsutaan.
https://www.youtube.com/watch?v=PErzQijx0ds
Tämän videon jälkeen ymmärtää muita transposonivideoita paremmin
......

Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(1):396-416. doi: 10.1093/nar/gkt898. Epub 2013 Oct 7.
Human LINE-1 restriction by APOBEC3C is deaminase independent and mediated by an ORF1p interaction that affects LINE reverse transcriptase activity.





Inga kommentarer:

Skicka en kommentar