Näissä RING finger proteiineissa TRIM-superperhe on alaluokka, jolla on RBCC-motiivi tunnusomainen ( Tripartite).
RING finger domain: In molecular biology, a RING
(Really Interesting New Gene) finger domain is a protein structural
domain of zinc finger type which contains a Cys 3 HisCys 4 amino acid
motif which binds two zinc cations. This protein domain contains from 40
to 60 amino acids. Many proteins containing a RING finger play a key
role in the ubiquitination pathway.
[Source: Wikipedia]
The mapped domains of Q9Y3C5, encoded by the RNF11 gene, an example gene within the family. [Source: Pfam & UniProt]
Genes contained within the family: 304
Jo NNR 2012 mainitsi, että kehossa on runsasti sinkkipitoisia entsyymejä- Näitä RNF- nimellä kulkevia on kaiketi yli 227 , tässä taulukossa 227 on niiden suurin luku. Muuten taulukko sisältää 304 geeniä. TRIM-proteiineja mainitaan kliinisesti ainakin 70-80 tarkemmin tutkittuna.
Lie muitakin sinkkipitoisia entsyymiproteiineja.
Keräsin tästä taulukosta eri kromosomien RNF proteiiit ruudukkoon.
Katson ensinnäkin niitä kromosomeja, joissa ei ole proteiiniksi koodautuvien TRIMien -alaryhmää, mitä RNF-proteiineja niissä ilmenee. Jokaisesta näistä on enemmänkin tietoa ja niistä voi saada selvielle, mikä osuus niillä on immuunivasteessa ja karsinogeneesissä.
Kromosomit 12, 18, 20, 21, 22, Y
Kromosomi 12
RNF10, 34, 41, 52,116, 140, 154, 179.
Kromosomi 18:
RNF 125,138, 152, 165, 167, 194.
Kromosomi 20
RNF23, 37, 50, 54, 116.
Kromosomi 22
RNF75, 78, 79, 120, 185, 203, 215.
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar