APOBEC perheestä

APOBEC

https://en.wikipedia.org/wiki/APOBEC

LÄHDE

Trends Biochem Sci. Author manuscript; available in PMC 2017 Jul 1.

Published in final edited form as:

Trends Biochem Sci. 2016 Jul; 41(7): 578–594.

Published online 2016 Jun 6. doi:  10.1016/j.tibs.2016.05.001

The APOBEC Protein Family: United by Structure, Divergent in Function

Jason D. Salter,¹ Ryan P. Bennett et al 

Yhteenveto (suomennosta)_  Summary

APOBEC on Apolipoproteiini B mRNA:ta muovaava katalyyttisen polypeptidin kaltainen proteiiniperhe, jolla on monenlaisia ja tärkeitä funktioita ihmisen terveydessä ja taudissa. Näillä proteiineilla on sisäinen kykynsä sitoa sekä RNA:ta että yksisäikeistä DNA:ta. Jokaisen APOBEC-proteiinin toiminta ja kudosspesifisyys eroaä toisistaan suuresti. On alettu ymmärtää, että APOBEC-proteiinien säätely tapahtuu geneettisillä muuntumilla, niiden transkription ja mRNA-protessoinnin vaihteluilla ja solun muiden makromolekyylien kanssa tapahtuvilla vuorovaikutuksilla. Jos solu menettää kyvyn kontrolloida APOBEC-aktiivisuuksia, seuraa DNA-hypermutaatioita ja sattumanvaraisia RNA-muovauksia ja niihin taas liittyy syövän kehittymistä tai viruslääkeresistenssiä, minkä takia on tärkeä tietää, miten APOBEC-proteiinit säätyvät.

• The APOBEC (Apolipoprotein B mRNA Editing Catalytic Polypeptide-like) family of proteins has diverse and important functions in human health and disease. These proteins have an intrinsic ability to bind to both RNA and single-stranded (ss)DNA. Both function and tissue-specific expression varies widely for each APOBEC protein. We are beginning to understand that the activity of APOBEC proteins is regulated through genetic alterations, changes in their transcription and mRNA processing, and through their interactions with other macromolecules in the cell. Loss of cellular control of APOBEC activities leads to DNA hypermutation and promiscuous RNA editing associated with the development of cancer or viral drug resistance, underscoring the importance of understanding how APOBEC proteins are regulated.
  

Avainsanoja, Keywords:

APOBEC, proteiiniperhe

cytidine deaminase; entsyymi, joka poistaa aminoryhmän sytidiinistä

disease mechanisms, tautimekanismi

DNA mutation, perimäaineksen muuttuminen

epigenetics, epigenetiikka

RNA editing, RNA muovaus