Leta i den här bloggen


onsdag 16 maj 2018

ESCRT malli Abskissiovaiheen tekijöistä

https://www.researchgate.net/profile/Mark_Van_der_Giezen/publication/49784933/figure/fig1/AS:601633838878722@1520452093285/Model-of-ESCRT-complex-assembly-The-diagram-is-based-loosely-upon-one-previously.png

  • Fig. 1. Model of ESCRT complex assembly. The diagram is based loosely upon one previously published (Raiborg and Stenmark, 2009) incorporating information from other sources (Hurley, 2008; Im et al., 2009; Kostelansky et al., 2007; Prag et al., 2007; Shestakova et al., 2010; Xiao et al., 2008). The complexes are marked as follows: ESCRT 0 components in red, ESCRT I in green, ESCRT II in orange, ESCRT III in purple, and ESCRT III-associated in blue. Relevant domains are identified. The GAT domain of ESCRT 0 is a heterodimer due to domainswapping. The multicoloured pyramids indicate binding sites of ubiquitylated cargo, and the 'lipids' (yellow circles with tails) indicate phosphatidylinositol 3-phosphate binding sites. The Tom1 complex marked in grey is based on the ancestral complex proposed previously (Blanc et al., 2009). 

Tässä kuvassa on ESCRT:iin assosioituneet tekijät oikalla siniseksi värjättyjä ja nisisä nähdään VSP4 "Escort Dissambly factor Vacuolar Protein Sorting 4).

Siten nähdään hiivan  geenituote Vta1, joka ihmisellä on LIP5 =LYST-interacting protein 5. Se on VPS4.n kofaktori. VPS4/SKD1 AAA ATPaasi yhdessä  Vta1/LIP5:n kanssa  katalysoivat ESCRT-hajoitamista ATP:stä riippuvassa reaktiossa.  Nmä VPS4 ja LIP5 ovat  multivesikulaaristen kappaleiden biogeneesissa ratkaisevat tekijät.

 (ESCRT III:n   VPS60 joka kuvasas tekee interaktion  VPS4.n kanssa , on ihmisellä CHMP5. 

Samoin VPS46 on ihmisellä CHMP1B, ja se  sitoutuu VPS4A:n MIT-domaaniin  (microtubule interacting and transport domain) . Näkyy myös tekijä IST1 (Increased Sodium Tolerance). Se muodostaa  kopolymeerin IST-1-CHMP1B.

Kuten näkyy, ESCRT-III- tekijät yhteistyössä  ovat muodostanut pitkiä filamentteja, jotka se voi kiertää  pussinvahvisteeksi exosomiin sijoitettavalle  kuormalle. VPS4 ja sen kanssa vaikuttavat tekijät  taas pystyvät hajoittamaan nämä  legot erikseen uudestaan käytettäväksi. Kysehän on koneistosta ESCART- machinery- joka koostuu ja hajoaa  dynaamisesti. Ongelmaa tulee siitä, että nämä filamentit eivät oikealla hetkellä hajoa, kuten esim  mitoosin jälkeen tytärsolujen tulee pystyä irtoamaan toisistaan sytokineesissä. Virukset kohtelevat kaltoin tätä hienoa koneistoa. 

Model of ESCRT complex assembly. The diagram is based loosely upon one previously published (Raiborg and Stenmark, 2009) incorporating information from other sources (Hurley, 2008; Im et al., 2009; Kostelansky et al., 2007; Prag et al., 2007; Shestakova et al., 2010; Xiao et al., 2008). The complexes are marked as follows: ESCRT 0 components in red, ESCRT I in green, ESCRT II in orange, ESCRT III in purple, and ESCRT III-associated in blue. Relevant domains are identified. The GAT domain of ESCRT 0 is a heterodimer due to domainswapping. The multicoloured pyramids indicate binding sites of ubiquitylated cargo, and the 'lipids' (yellow circles with tails) indicate phosphatidylinositol 3-phosphate binding sites. The Tom1 complex marked in grey is based on the ancestral complex proposed previously (Blanc et al., 2009). 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar