Kertailtu sinkkiproteiinien lueteloa. ZNHIT geenejä on kuusi

 ZNHIT geeniryhmä. Onko siitä jotain uutista ? Katsotaan. 

Tässä on  n. 20 v  vanha artikkeli ajoista, kun HIT-motiivin  sinkkisormiproteiinin funktiota alettiin hahmottaa. eri yhteyksistä. Kysyin  suomeksi AI:lta ja sain hyvän ja valaisevan  vastauksen, mutta koska on keskiyö, jatkan noteerausta myöhemmin.  Tiedettiin, ettei ne säädä DNA:ta suoraan ja että niiden sinkkisormirakennelma on ainutlaatuinen. 

A zinc finger HIT domain-containing protein, ZNHIT-1, interacts with orphan nuclear hormone receptor Rev-erbbeta and removes Rev-erbbeta-induced inhibition of apoCIII transcription

Jiadong Wang 1, Yang Li, Min Zhang, Zhongle Liu, Cong Wu, Hanying Yuan, Yu-Yang Li, Xin Zhao, Hong Lu

Affiliations 

• PMID: 17892483
• DOI: 10.1111/j.1742-4658.2007.06062.x

ZNF LIM-tyyppiset sinkkisormiproteiinit (53 geeniä) joista mainitaan 4 alaryhmää

 LIM domain LIM domains are protein structural domains, composed of two contiguous zinc finger domains, separated by a two- amino acid residue hydrophobic linker. They are named after their initial discovery in the proteins L in11, I sl-1 & M ec-3.

Group contains the following subgroups 

• LIM class homeoboxes 12 genes 
• Ajuba family 3 genes 

• LIMS zinc finger family (LIMS) 4 genes 
• Zyxin family 3 genes
• 
  

ZNF PCLO- tyyppiset, 2 geeniä, piccolo-tyyppiset sinkkisormet

 Zinc fingers, piccolo-type Piccolo zinc fingers were found to interact with the dual prenylated rab3A and VAMP2/Synaptobrevin II receptor PRA1. There are eight conserved cysteines in Piccolo-type zinc fingers, suggesting that they coordinate two zinc ligands. [Source: InterPro] 

ZNF TRAF-tyyppiset. 13 jäsentä ryhmässä (HUGO)

 Zinc fingers, TRAF-type This gene group contains genes that encode proteins with a TRAF-type zinc finger domain. Some of the proteins that have this domain are mammalian signal transducers associated with the cytoplasmic domain of the 75kDa tumour necrosis factor receptor. A heterocomplex, homodimer or heterodimer of TRAF1 and TRAF2, binds to the N-terminal of the inhibitor of apoptosis proteins 1 and 2 (IAPS) and recruits them to the tumour necrosis factor receptor 2. [Source: InterPro]

 Genes contained within the group: 13

Tarkistan sinkkisormiproteiinien HUGO ryhmät nyt 11.2.2026. Poimin esiin uusia nimettyjä tai lisättyjä ryhmiä)

 

Group contains the following subgroups 

• LIM domain containing
• GATA zinc finger domain containing (GATAD)
• Nuclear hormone receptors (NR)
• PHD finger proteins (PHF)
• Ring finger proteins (RNF)
• THAP domain family (THAP)
• Zinc fingers AN1-type (ZFAND)
• Zinc fingers A20-type
• Zinc fingers BED-type (ZBED)
• Zinc fingers CCCH-type (ZC3H)
• Zinc fingers CCHC-type (ZCCHC)
• Zinc fingers CW-type (ZCW)
• Zinc fingers C2HC-type (ZC2HC)
• Zinc fingers C2H2-type (ZNF)
• Zinc fingers C2H2C-type
• Zinc fingers DBF-type (ZDBF)
• Zinc fingers DHHC-type (ZDHHC)
• Zinc fingers FYVE-type (ZFYVE)
• Zinc fingers GRF-type (ZGRF)
• Zinc fingers HIT-type (ZNHIT)
• Zinc fingers matrin-type (ZMAT)
• Zinc fingers MIZ-type (ZMIZ)
• Zinc fingers MYM-type (ZMYM)
• Zinc fingers MYND-type (ZMYND)
• Zinc fingers NFX1-type
• Zinc fingers PARP-type
• Zinc fingers PCLO-type
• Zinc fingers RANBP2-type (ZRANB)
• Zinc fingers SWIM-type (ZSWIM)
• Zinc fingers TRAF-type
• Zinc fingers U11-48K-like CHHC-type
• Zinc fingers ZZ-type (ZZZ)
• Zinc fingers 3CxxC-type (Z3CXXC)
• Zinc fingers CXXC-type (CXXC)