Tämä kuten TRIM50 kuuluva niihin 3´25 WBS klusterigeeniin tuossa kr.7q11.23 kohdassa.
Tätä geeniä
esiintyy eniten testiksessä ja mahalaukussa ja sitten 24 muussa
kudoksessa.
1-250 aminohapon
peptidi.Alaluokka C_V .
Asemassa 15-60
RING-domeeni.
Asemassa 90-125 Bbox
tyyppinen sinkkisormimotiivi, CHC3H2.
Tämä TRIm on E3 ubikitiiniligaasifunktioinen.
Williams-Beuren
syndrome TRIM50 encodes an E3 ubiquitin ligase. Micale L, et
al. Eur J Hum Genet, 2008 Sep. PMID 18398435, Free
PMC Article
(Suomennosta).
Tässä oireyhtymässä, josta on a on aiemmin mainittu, on
geeniklusteri kr.7q11.23 kohdalla ja niistä 25 geenistä on
kolmen TRIMgeenejä: TRIM50, TRIM73 ja TRIM74. Tämä TRIM73 on
mainittu myös TRIM50B-geeniksi aluksi.
Williams-Beuren
syndrome (WBS) is a neurodevelopmental and multisystemic disease
that results from hemizygosity of approximately 25 genes mapping to
chromosomal region 7q11.23. We report here the preliminary
description of eight novel genes mapping within the WBS critical
region and/or its synenic mouse region. Three of these genes,
TRIM50, TRIM73 and TRIM74, belong to the TRIpartite motif gene
family, members of which were shown to be associated to several
human genetic diseases. We describe the preliminary functional
characterization of these genes and show that Trim50 encodes an E3
ubiquitin ligase, opening the interesting hypothesis that the
ubiquitin-mediated proteasome pathway might be involved in the WBS
phenotype.
Quantitative
analysis of HSP90-client interactions reveals principles of
substrate recognition. Taipale M, et al. Cell, 2012 Aug
31. PMID 22939624, Free
PMC Article
The
DNA sequence of human chromosome 7. Hillier LW, et al.
Nature, 2003 Jul 10. PMID 12853948 Abstract
Yleistietoa
kromosomista 7. Tätä kromosomia on tutkittu paljon kun selviteltiin
kystisen fibroosin geenitaustaa ja niitä useita sytogeneettisiä
muutoksia, jota on liittynyt eri syöpämuotoihin. 153 miljoonaa emäsparia
esitetään. Ne edustavat 99.4% kromosomi7:n eukromaattisesta
sekvenssistä. Ensimmäinen metasentrinen kromosomi, joka on täysin
selvitetty. Sekvenssi on johdonmukainen aiemmin selviteltyjen
fysikaalisten ja geneettisten karttojen suhteen ja siinä on
epätavallinen määrä kaksinkertaistuneita segmenttejä (8.2 %) ja
erot ovat huomattavat kahden eri haaran kesken. On identifioitu
1150 proteiinia koodaavaa geeniä, joista 605 on varmistettu
komplementaarisin DNA-sekvenssein ja lisäksi on 941 pseudogeeniä.
Transkriptisekvenssein varmistetuista geeneistä jotkut ovat
polymorfisia mutaatioitten suhteejotka katkaisevat luennan.
Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Kimura K, et al. Genome Res, 2006 Jan. PMID 16344560, Free PMC Article
Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. Ota T, et al. Nat Genet, 2004 Jan. PMID 14702039
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar