Androgeenisessa signaloinnissa on havaittu toistuvia muuntumisia, samoin DNA-korjaantumisessa ja PI3K-signaloinnissa ym. Kuitenkin laajemmissa ja uniformisissa genomisissa analyyseissä saatetaan tunnistaa lisää toistuvasti mutatoituneita geenejä alemmin frekvenssein. Tässä artikkelissa on aggrekoitu ja uniformisesti analysoitu exomisekvenssitietoa 1013 PC.stä. Tutkijat tunnistavat ja arvioivat uuden ETS-fuusionegatiivisten tuumorien luokan epigeneettisten säätelijöitten mutaatioitten ja aiemmin PC:n liittymättömiksi katsottujen teitten kuten spliseosomien (pleissaustapojen) avulla. He havaitsivat , että merkitsevästi mutatoituneitten geenien (SMG) jakauma muodostaa long-tail käyrän, jossa moni geeni on mutatoitunut alle 3%.ssa tapauksista. Tunnistetaan yhteensä 97 SMG:tä, joista 70:ää ei ole aiemmin liitetty eturauhassyöpään (PC) - näitä ovat ubikitiiniligaasu CU3L ja transkriptiofaktori SPEN. Lopuksi vertailtaessa primääristä ja metastaattista prostatasyöpää, tunnistetaan setti genomisia merkitsijöitä, jotka voivat antaa tietoa riskin kerrostumisesta
- Comprehensive genomic characterization of prostate cancer has identified recurrent alterations in genes involved in androgen signaling, DNA repair, and PI3K signaling, among others. However, larger and uniform genomic analysis may identify additional recurrently mutated genes at lower frequencies. Here we aggregate and uniformly analyze exome sequencing data from 1,013 prostate cancers. We identify and validate a new class of E26 transformation-specific (ETS)-fusion-negative tumors defined by mutations in epigenetic regulators, as well as alterations in pathways not previously implicated in prostate cancer, such as the spliceosome pathway. We find that the incidence of significantly mutated genes (SMGs) follows a long-tail distribution, with many genes mutated in less than 3% of cases. We identify a total of 97 SMGs, including 70 not previously implicated in prostate cancer, such as the ubiquitin ligase CUL3 and the transcription factor SPEN. Finally, comparing primary and metastatic prostate cancer identifies a set of genomic markers that may inform risk stratification.
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar