Leta i den här bloggen

tisdag 3 april 2018

TRIM52 (Kr.5q35.3) RNF102

TRIM52, Kr.5q35.2, RNF107. Class V.

Tämä TRIM52 on TRIM-rakenteitten minimalisteja.  267 aminohappoa. Siinä on vain RING ja B-Box2-domaanit, tosin RING on ainutlaatuisesti laajentunut. Se kuuluu luokkaan CV.  Sitä ilmenee yleisesti 25 kudoksessa ja eniten imusolmukkeissa ja pernassa, siten  testiksessä ja umpilisäkkeessä. Geenistä saadut tiedot viittaavat siihen, että tuman TRIM52- proteiini säätelee positiivisesti NF-kB-signalointitietä. evolutionaalisesti se on  myöhäisiä TRIM-geenejä. 
(Suomennosta tiivistelmästä:)  Monilla TRIMperheen proteiineilla on kriittistä osuutta NF-kB-tien säätelyyn.  TRIM52 on perheensä uusi nonkanoninen antivirusgeeni, jossa on ainutlaatuisesti laajentunut RING-domaani. Tieto TRIM52-geenin biologisesta funktiosta on rajallista. Tässä artikkelissa on osoitettu, että se osallistuu NF-kB aktivaatioon. Tutkijat havaitsivat, että erityisesti TRIM52:n yliesiintymä aktivoi NF-kB-signaalin. TRIM52:n ylimääräinen esiintymä voi merkitsevästi indusoida tuumorinekroosifaktori alfan (TNFalfa) ja interleukiinin IL-6 ilmenemät ( Nämä ovat proinflammatorisia sytokiineja) . Lisäksi he havaitsivat, että TRIM52:n RING-domaanilla oli essentielli merkitys NF-kB-signaalin aktivoimisessa. Jatkotutkimuksisa todettiin, että TRIM52:n ylimääräinen esiintymä ei vaikuttanut IkB alfan ja fosforyloidun p65 proteiinin pitoisuuksiin. Lisäksi havaittiin, että tulehdusta edistävät sytokiinit TNFalfa ja IL-6 voivat indusoida TRIM52:n ilmenemää. Yhteenvetona oli, että TRIM52 on NF-kB-tien positiivinen säätelijä.
  • Abstract Emerging evidence suggests that TRIM family proteins play a crucial role in regulating the NF-κB signaling pathway. TRIM52 is a novel noncanonical antiviral TRIM gene with a unique expanded RING domain. Information on the biological function of TRIM52 is limited. Herein, we demonstrated TRIM52 involvement in NF-κB activation. We found that TRIM52 overexpression specifically activated the NF-κB signal. TRIM52 overexpression can significantly induce TNFα and IL-6 expression. We also found that the RING domain of TRIM52 was essential for its activation of the NF-κB signal. Further study showed that TRIM52 overexpression did not affect the protein level of IκBα and phosphorylated p65 protein. We found that the pro-inflammatory cytokines TNFα and IL-6 could induce TRIM52 expression. Overall, these data suggested that TRIM52 was positive regulator of the NF-κB pathway. KEYWORDS: Nuclear factor-kappa B (NF-κB); r]
(Suomennosta: ) Toistuva viruspaine on vaikuttanut isäntäkehon antivirusgeeneihin  kädellisten ja imettäväisten evoluution aikana. Tämä valintapaine on tuottanut isäntäkehon antivirusgeeneissä dramaattisia sopeutumisepisodeja ja  usein ne tulevat havaittaviksi  positiivisen valiutumisen tietä. Nämä evolutionaaliset adaptaation ”sormenjäljet” voivat valaista aiemmin tunnistamattomia antivirusgeenejä ( joita sanotaan myös restriktiotekijöiksi). Vaikka TRIM:ien multigeeninen perhe tunnistetaan siitä, että se koodaa useita bona fide restriktiotekijöitä ( esim TRIM5alfa), kuitenkin suurin osa näistä tekijöistä on vielä luonnehtimattomia. Tässä artikkelin työssä tutkijat selvittivät TRIM:ien multigeeniperheestä positiivisen selektion merkkejä löytääkseen uusia antivirusgeenikandidaatteja. Tutkijoitten työn tuloksena 17 TRIM-geenissä löytyi aiemmin tunnistamattomia merkkejä positiivisesta selektiosta. Näistä 10 edustaa uusia kandidaatteja restriktiotekijöitten joukkoon. Näissä on epätavallinen TRIM52-geeni, joka on kehittynyt vahvan positiivisen selektiopaineen alaisena huolimatta siitä, että sen koodamasta proteiinista puuttuu virusta tunnistavaksi oletettu B30.2 domeeni. Tutkijat osoittavat, että TRIM52 on muodostunut TRIM41-geenin duplikaatiosta. Sekä TRIM 41 että TRIM 52 omaavat vahvasti laajentuneet RING- domaanit verrattuna muihin TRIM-multigeeniperheen jäseniin. Kuitenkin tämä domeeni on kehittynyt vain kädellisten TRIM52:ssa ja tämä viittaa sen edustavan  isäntäkehon ja viruksen välisen vuorovaikutuksen uutta  interfaasia. Tämä evoluutioon perustuva geeniseulonta dokumentoi sekä tunnettujen TRIM-restriktiofaktoreiden positiivista valintaa että esittää uusia restriktiotekijäkandidaatteja ja tästä saataneen oivallusta isäntäkeho- patogeeni-vuorovaikutusten interfaasista, joita monigeeninen TRIM- perhe välittää.
    Recurrent viral pressure has acted on host-encoded antiviral genes during primate and mammalian evolution. This selective pressure has resulted in dramatic episodes of adaptation in host antiviral genes, often detected via positive selection. These evolutionary signatures of adaptation have the potential to highlight previously unrecognized antiviral genes (also called restriction factors). Although the TRIM multigene family is recognized for encoding several bona fide restriction factors (e.g., TRIM5alpha), most members of this expansive gene family remain uncharacterized. Here, we investigated the TRIM multigene family for signatures of positive selection to identify novel candidate antiviral genes. Our analysis reveals previously undocumented signatures of positive selection in 17 TRIM genes, 10 of which represent novel candidate restriction factors. These include the unusual TRIM52 gene, which has evolved under strong positive selection despite its encoded protein lacking a putative viral recognition (B30.2) domain. We show that TRIM52 arose via gene duplication from the TRIM41 gene. Both TRIM52 and TRIM41 have dramatically expanded RING domains compared with the rest of the TRIM multigene family, yet this domain has evolved under positive selection only in primate TRIM52, suggesting that it represents a novel host-virus interaction interface. Our evolutionary-based screen not only documents positive selection in known TRIM restriction factors but also highlights candidate novel restriction factors, providing insight into the interfaces of host-pathogen interactions mediated by the TRIM multigene family.

Syöpäalasta: 

(Suomennosta) TRIM52 geeni on evolutionaalisesti äskettäin ilmentynyt, joten on epätodennäköistä, että se olisi tarpeellinen normaalien solujen perustoiminnoille. Kuitenkin tuoreet (ablaatio-seulonta-) tutkimukset viittaavat siihen, että joissain geneettisissä syövissä TRIM52 voisi olla syövän optimaaliselle kasvulle tai ylläpidolle välttämätön. Tällaisten syövän kunnolle olennaisten geenien löytäminen olisi tärkeää, jotta voidaan kohdentaa niihin tuumorispesifistä terapiaa. Tutkijat raportoivat, että TRIM52:n ablaatio pienensi merkitsevästi spesifisen glioblastoomasolulinjan proliferaatiota soluviljelmässä ja hiiren xenograftissa kompromittoimalla niiden solusykli p53:sta riippuvalla tavalla. Tutkimukset osoittavat TRIM52:n optimaalille proliferaatiolle tarpeellista funktiota.
  • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29568378 Tripartite motif (TRIM) proteins have been shown to play important roles in cancer development and progression by modulating cell proliferation or resistance from cell death during non-homeostatic stress conditions found in tumor micro-environments. In this study, we set out to investigate the importance for cellular fitness of the virtually uncharacterized family member TRIM52. The human TRIM52 gene has arisen recently in evolution, making it unlikely that TRIM52 is required for basic cellular functions in normal cells. However, a recent genome-wide ablation screening study has suggested that TRIM52 may be essential for optimal proliferation or survival in certain genetic cancer backgrounds. Identifying genes which fit this concept of genetic context-dependent fitness in cancer cells is of interest as they are promising targets for tumor-specific therapy. We report here that TRIM52 ablation significantly diminished the proliferation of specific glioblastoma cell lines in cell culture and mouse xenografts by compromising their cell cycle progression in a p53-dependent manner. Together, our findings point to a non-redundant TRIM52 function that is required for optimal proliferatio

Upplagd av kl.
Etiketter: , ,

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar

Prenumerera på: Kommentarer till inlägget (Atom)