Leta i den här bloggen

tisdag 24 april 2018

TRIM69(Kr.15q21.1), Trif, RNF36 (C_IV PRY)




Tässä TRIM67 -molekyylissä on N-terminaalinen RING finger -motiivi ja PRY domeeni sekä C-terminaalinen SPRY. TRIM69 kuuluu C_IV_ PRY  alaluokaan. Tästä geenistä on tietoa koe-eläimistä, joissa se ilmenee erityisesti germinaalisissa soluissa spermatidin ollessa pyöreässä vaiheessa spermatogeneesin aikana. Jos geeni yli-ilmenee se aiheuttaa apoptoosia. Alternatiivipleissauksella koodautuu erilaisia isoformeja. Tätä ilmenee testiksessä ja vähän myös aivoissa.

Trif; HSD34; RNF36; HSD-34 Summary This gene encodes a member of the RING-B-box-coiled-coil (RBCC) family and encodes a protein with an N-terminal RING finger motif, a PRY domain and a C-terminal SPRY domain. The mouse ortholog of this gene is specifically expressed in germ cells at the round spermatid stages during spermatogenesis and, when overexpressed, induces apoptosis. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] Expression Biased expression in testis (RPKM 19.8) and brain (RPKM 1.8) See more

(Suomennosta) RNF36 alias Trif ilmenee germinaalisoluissa pyöreän spermatidin asteella spermatogeneesin aikana. Koska germinaalisia solulinjoja ei ollut saatavilla RNF36- tutkimuksiin, tässä työssä ekspressoitiin RNF36 lyhennetyssä muodossa ja täyspitkänä proteiinina COS-7 ja HEK-293 solulinjoissa ja tutkittiin RNF36 vaikutuksia somaattisiin soluihin.  Lyhennetty RNF36-1 oletettuine tumalokalisaatiosignaaleineen pysyi  tuman sisälla, mutta menetti täplikkään mallinsa. PML- proteiinia ( toinen TRIMproteiini) oli aiemmin osoitettu tumasta täplikkäänä esiintymänä. Tutkimukset osoittivat, että RNF36 asettuu samoihin kohtiin kuin PML ja tekee sen kanssa interaktion. RNF36:n tumaan lokalisoituminen on fosforylaation kontrolloimaa- mahdollisesti p38:n välittämänä. Jos käytettiin p38-inhibiittoria, RNF36 translokoitui sytoplasmaan. Jos täyspitkä RNF36 asetettiin soluissa yliekspressioon, puolet transfektoiduista soluissa kävi läpi apotoottisen kuoleman. Tutkittaessa RNF36-indusoimaa apoptoosia, havaittiin että Bax, kaspaasi-2 ja reseptori–interaktioproteiini olivat koholla testatuissa soluissa RNF36 induktiosta. Tulokset osoittavat, etä RNF36 tekee interaktion PML:n kanssa ja indusoi apoptoosia. Tutkijat arvelevat, että RNF36:lla voi olla osuutta germinaalisten solujen homeostaasissa spermatogeneesin aikana,

  • RNF36 (ring finger protein 36; alias Trif), a member of the RING zinc finger protein family, is expressed in germ cells at round spermatid stages during spermatogenesis. RING finger proteins have been implicated in a variety of functions including oncogenesis, viral replication, and developmental processes. Since no germ cell line is presently available to study the function of RNF36, in this research, we expressed RNF36 truncated and full-length proteins in COS-7 and HEK-293 cell lines to study the effect of RNF36 in somatic cells. The full-length RNF36 protein in both cell lines showed a speckled pattern in the nucleus. Truncated RNF36-1 protein with its putative nuclear localization signal (NLS) remained within the nucleus but lost the speckled pattern. The promyelocytic leukemia (PML) protein, another RING finger protein, was previously identified as present in the nucleus with a speckled pattern. Double-staining and coimmunoprecipitation analyses suggested that RNF36 colocalizes and interacts with PML. In vitro phosphorylation analysis further suggested that RNF36 nuclear localization is under the control of phosphorylation, which might be mediated by p38. Treatment with the p38 inhibitor SB203580 resulted in the cytoplasmic translocation of RNF36. Overexpression of full-length RNF36 in cells induced about half of the transfected cells to undergo cell death. The results of DNA fragmentation assays, flow cytometry assay, and TUNEL staining suggest that the death of RNF36-transfected cells was caused by apoptosis. Following further characterization of the molecular mechanism of RNF36-induced apoptosis, we found that the expression of Bax, caspase-2, and receptor-interacting protein were elevated upon RNF36 induction in test cells. These results suggest that RNF36 may interact with PML and induce cell apoptosis. We suspect that RNF36 may play a role in germ cell homeostasis during spermatogenesis.
(Suomennosta) Tutkittiin TRIM69 geenin  E3ubikitiiniligasiaktiivisuutta ja subsellulaarita sijaintia ihmisellä.  Havaittiin että TRIM69 välitti ubikitinaatiota  E2-konjugoivan  entsyymin selektiiviseen tapaan  in vitro  ja prosesissa oli intakti RING finger domeeni välttämätön. Edelleen osoitettiin in vivo, että TRIM69  pystyy välittämään ubikitinaatiota, joka saattoi lisääntyä proteosomi-inhibiittorista. TRIM69 sijoittui sekä sytoplasmaan että tumaan täplikkäinä aggrekaatteina- mikä myös vaati intaktia RINGfinger domeenia. Yhteenvetona: TRIM69 on uusi E3 ubikitiiniligaasi, joka on identifioitu ihmisen testiksestä ja se saataa uikitinoida erityisiä substraatteja  spermatogeneesin aikana.
  •  The E3 ubiquitin ligase activity and subcellular localisation of human TRIM69 (hTRIM69) gene were studied. It was found that hTRIM69 mediated ubiquitination in an E2 conjugating enzyme selective fashion in vitro and an intact RING finger domain was indispensible for the process. Further evidences showed that hTRIM69 could mediate ubiquitination in vivo, which could be enhanced by a proteasome inhibitor. hTRIM69 was found to localise in both the cytoplasm and the nucleus in a speckled aggregating pattern, which also required an intact RING finger domain. Collectively, hTRIM69 is a novel E3 ubiquitin ligase identified from human testis and may function to ubiquitinate its particular substrates during spermatogenesis.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_001288073.1
Eräs isoformeista .


Muistiin 24.4. 2018 



Upplagd av kl.
Etiketter: , , ,

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar

Prenumerera på: Kommentarer till inlägget (Atom)