Leta i den här bloggen


fredag 27 april 2018

TRIM37 (Kr.17q22), MUL, POB1, TEF3,(C_VIII MATH)

TRIM37 (Kr.17q22 ), MUL, POB1, Tef3 , (C_VIII Math)
Modifioitunut RING-finger, HC-alaluokkaa( C4C4-tyyppiä) TRIM37. Tämä geeni kuuluu ryhmään ”Novel TRIMs”. Se osallistuu RBCC-TRIMien tapaan erilaisiin solufunktioihin, kehityksellisiin tapahtumiin ja onkogeneesiin. MATH-TRIM on peroxisomaalinen E3 ubikitiiniligaasi. RING finger ja B-box omaavat monta kohtaa sinkille ja sanotaan aivan että se ”kelaa sinkkiä” ja saattaa osallistua proteiini-proteiini-interaktioihin ja proteiini-nukleiinihappointeraktioihin. TRIM37 monoubikitinoi histonin H2A, ja tämä kromatiinimodifikaatio assosioituu transkriptionaaliseen repressioon. Lisäksi TRIM37 omaa anti-HIV-1 aktiivisuutta ja sekaantuu virusDNA:n synteesiin.
TRIM37 on osatekijänä useissa syövissä kuten haimatiehytkarsinoomassa (PDAC) , maksasolusyövässä (HCC), rintasyövässä ja sporadisesa fibrothecomassa.
Tämän geenin mutaatiot liittyvät peroksisomaaliseen tautiin lihas-maksa- aivo- silmä- nanismiin (mulibrey nanism), josta geenin vaihtoehtoinen nimi MUL johtuu. Mainittu mutaatio on autosomaali resessiivinen häiriö, joka koskee useita mesodermaalista alkuperää olevia kudoksia. 
Geeniä ilmentyy useissa kudoksissa: testiksessä, aivossa ja 23 muussa kudoksessa.
  • TRIM37 Also known as MUL; POB1; TEF3 Summary This gene encodes a member of the tripartite motif (TRIM) family, whose members are involved in diverse cellular functions such as developmental patterning and oncogenesis. The TRIM motif includes zinc-binding domains, a RING finger region, a B-box motif and a coiled-coil domain. The RING finger and B-box domains chelate zinc and might be involved in protein-protein and/or protein-nucleic acid interactions. The gene mutations are associated with mulibrey (muscle-liver-brain-eye) nanism, an autosomal recessive disorder that involves several tissues of mesodermal origin. [provided by RefSeq, Mar 2016] Expression Broad expression in testis (RPKM 19.8), brain (RPKM 14.1) and 23 other tissues See more Orthologs mouse all

TRIM37 rakenteesta

  • Isoformi a rakenne

        Koservoidut domeenit

Conserved Domains (4) summary smart00502
Location:132 → 254
BBC; B-Box C-terminal domain
cd00162
Location:15 → 58
RING; RING-finger (Really Interesting New Gene) domain, a specialized type of Zn-finger of 40 to 60 residues that binds two atoms of zinc; defined by the 'cross-brace' motif C-X2-C-X(9-39)-C-X(1-3)- H-X(2-3)-(N/C/H)-X2-C-X(4-48)C-X2-C; probably involved in ...
cd03773
Location:273 → 406
MATH_TRIM37; Tripartite motif containing protein 37 (TRIM37) family, MATH domain; TRIM37 is a peroxisomal protein and is a member of the tripartite motif (TRIM) protein subfamily, also known as the RING-B-box-coiled-coil (RBCC) subfamily of zinc-finger proteins. ...
pfam00643
Location:90 → 132
zf-B_box; B-box zinc finger
  • It mono-ubiquitinates histone H2A, a chromatin modification associated with transcriptional repression. Moreover, TRIM37 possesses anti-HIV-1 activity, and interferes with viral DNA synthesis. Mutations in the human TRIM37 gene (also known as MUL) cause Mulibrey (muscle-liver-brain-eye) nanism, a rare growth disorder of prenatal onset characterized by dysmorphic features, pericardial constriction, and hepatomegaly.


TRIM37 kuuluu C_VIII alaluokkaan, jossa on N-terminaalinen RBCC (RING Bbox ja coiled coil) domaanit ja kolme peräkkäistä sinkkiä sitovaa domaania :
Terminaalisesti sijaitsee MATH ( mepriini ja TRAF-C homologi) -domeeni. Tämä MATH domaani tekee interaktion kuuden tunnetun TRAF proteiinin kanssa in vitro ( TRAF = TNF-reseptoriin assosioitunut faktori)
  • TRIM37 belongs to the C-VIII subclass of TRIM (tripartite motif) family of proteins that are defined by their N-terminal RBCC (RING, Bbox, and coiled coil) domains, including three consecutive zinc-binding domains, a C4C4-type RING finger, whose overall folding is similar to that of the typical C3HC4-type RING-HC finger, Bbox1 and Bbox2, and a coiled coil region, as well as a MATH (meprin and TRAF-C homology) domain positioned C-terminal to the RBCC domain. Its MATH domain has been shown to interact with the TRAF (TNF-Receptor-Associated Factor) domain of six known TRAFs in vitro.
Artikkelita  TRIM37:stä PubMed lähteestä _ Related articles

TRIM37 poistogeenisyys inaktivoi Wnt/beta-cateniinisignaloinnin CRC-soluissa

(Suomennosta)
TRIM37:n  ( uuden TRIM proteiinin  tässä RBCC-alaperheessä) on havaittu osallistuvan usean syövän kehitykseen ja progredioitumiseen. Tässä on selvitelty sen osuutta CRC:ssä (kolorektaalisyövässä) ja CRC tuumorin progredioitumisessa. TRIM37 oli tässä syövässä ylössäätyneenä. TRIM37-poistogeenisyys esti CRC-solun proliferaatiota ja tuumorin kasvua in vivo. Poistogeenisyys myös esti beta-kateniinin, sykliiniD1:n ja c-Myc proteiinien pitoisuuksien ilmenemisen. Yhteenvetona nämä tulokset osoittivat, että TRIM37 saattaa omata osaa CRC solujen proliferaatiossa, invaasiossa ja tumorigeenisyydessä. Täten TRIM37 saattaa olla ptentiaalinen terapeuttinen kohde CRC (kolorektaalisyövän) hoidossa.
  • Tripartite motif-containing protein 37 (TRIM37), a new member of the RING-B-box-coiled-coil (RBCC) subfamily of zinc finger proteins, was found to be involved in the development and progression of several cancers. However, the expression pattern and biological functions of TRIM37 in colorectal cancer (CRC) remain unknown. Therefore, in the present study, we examined the expression pattern of TRIM37 in CRC and investigated the function of TRIM37 in the progression of CRC. Our results showed that TRIM37 expression was upregulated in CRC cell lines. Knockdown of TRIM37 inhibited CRC cell proliferation and tumor growth in vivo. Furthermore, knockdown of TRIM37 inhibited the migration and invasion in CRC cells. Last, knockdown of TRIM37 inhibited the protein level expression of β-catenin, cyclin D1, and c-Myc in CRC cells. In conclusion, these results demonstrate that TRIM37 may play an important role in the proliferation, invasion, and tumorigenesis of CRC cells. Thus, TRIM37 may be a potential therapeutic target for the treatment of CRC.

TRIM37 vikasäädössä haimatiehyeitten adenokarsinoomassa . Wnt/betakateniini signalointi aktivoituu

(Suomennosta)
 On lisääntyvää näyttöä TRIM37:n osuudesta useiden syöpätyyppien kanserogeneesissä. Kuitenkaan aiemmin ei ole selvitettys sen osuutta haimatiehyeiden adenokarsinoomassa (PDAC), jota tämä artikkeli koskee. Tutkittiin TRIM37 haimasyöpäkudoksessa ja miten se toimii syöpäsolussa. Katsottiin TRIM37-säätely betakateniini/TCF signaloinnissa. Havaittiin että TRIM37-ilmentymä oli merkitsevästi korkeampi syöpäkudoksessa kuin sen viereisessä normaalikudoksessa. Funktioanalyysit viittasivat siihen, että TRIM37:n yli-ilmentyminen edisti kasvua ja migraatiota haimasyöpäsoluissa. Molekulaarimekanistisesti TRIM37 teki interaktion betakateniinin kanssa ja viritti esiin betakateniini/TCFkompleksin transkriptioaktiivisuuden ja alavirran kohdegeenien ilmenemän. Yhteenvetona tutkimukset osoittivat TRIM37:n onkogeeniset ominaisuudet haimasyövässä ja se saattakin olla lupaava kohde haimasyövän hoidossa.
  • Increasing evidence indicated that tripartite motif containing 37 (TRIM37) was involved in the tumorigenesis of several cancer types. However, its expression pattern and biological functions in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) remained unknown. In this study, real-time PCR, Western blot and immunohistochemistry was performed to examine the expression of TRIM37 in the pancreatic cancerous tissues. Colony formation assay and cell migration assay were performed to study the functions of TRIM37 in pancreatic cancer cells. Dual-luciferase assay was performed to study the regulation of TRIM37 on beta-catenin/TCF signaling. It was found that the expression level of TRIM37 was significantly higher in pancreatic cancerous tissues compared with the adjacent normal tissues. Function analysis indicated that overexpression of TRIM37 promoted the growth and migration of the pancreatic cancer cells, while knocking down the expression of TRIM37 inhibited the growth and migration of the pancreatic cancer cells. The molecular mechanism study suggested that TRIM37 interacted with beta-catenin and activated the transcriptional activity of beta-catenin/TCF complex as well as the expression of its downstream target genes. Taken together, our study showed the oncogenic roles of TRIM37 in pancreatic cancer, and TRIM37 might be a promising target for pancreatic cancer treatment.

Wnt/betakateniinisignalointi tulevaisuudessa terapeuttinen kohde

TRIM37 vikasäädössä maksasyöpäsolussa. Wnt/betakateniini signalointi aktivoituu.

(Suomennosta)
 Maksasolusyöpä on tavallisimpia syöpiä maailmassa, erityisesti Itä-Aasiassa ja Afrikassa. Pitkälle-edenneessä taudissa, etäpesäkkeiten muodostuttua ja useiden huononemisvaiheiden ilmetessä taudin ennuste ei ole hyvä. Kuitenkin taustamekanismit maksasolusyövässä ovat pysyneet selvittämättöminä. On kiirehditty patologisten prosessien tarkan mekanismin ja maksasolusyövässä esiintyvien relevanttien molekyylien tunnistamista. TRIM37 on E3-ubikitiiniligaasi, jonka ilmentyminen on havaittu vikasäätöiseksi useissa tuumoreissa. Tuoreet TRIM37-tutkimukset ovat viitanneet siihen, että TRIM37:llä on kriittinen osuus soluproliferaatiossa ja muissa prosesseissa. Tässä tutkimuksessa osoitettiin, että TRIM37 oli merkillepantavasti ylössäätynyt maksasyöpänäytteissä ja assosioitui pitkälle edenneeseen syöpävaiheeseen ja tuumorin volyymiin, mitkä kaikki viittaavat huonoon prognoosiin. TRIM37 voisi toimia riippumattomana prognostisena faktorina HCC:ssä. In vitro ja in vivo tutkimukset osoittivat, että TRIM37 edisti HCC- solujen migraatiota ja metastaasia indusoimalla EMT:n eli epiteliaalisesta mesenkymaaliseen transition. Lisäksi paljastui, että TRIM37-vaikutus välitti maksassyöpäsolujen EMT:n aktivoimalla Wnt/betakateniinisignaloinnin. Näistä löydöistä saa oivallusta TRIM37:stä maksasolusyövän yhtenä uutena kriittisenä tekijänä ja HCC-hoidon kohdekandidaattina.
  • Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common cancer in the world especially in East Asia and Africa. Advanced stage, metastasis and frequent relapse are responsible for the poor prognosis of HCC. However, the precise mechanisms underlying HCC remained unclear. So it is urgent to identify the pathological processes and relevant molecules of HCC. TRIM37 is an E3 ligase and has been observed deregulated expression in various tumors. Recent studies of TRIM37 have implicated that TRIM37 played critical roles in cell proliferation and other processes. In the present study, we demonstrated that TRIM37 expression was notably up-regulated in HCC samples and was associated with advanced stage and tumor volume, which all indicating the poor outcomes. We also found that TRIM37 could serve as an independent prognostic factor of HCC. During the course of in vitro and in vivo work, we showed that TRIM37 promoted HCC cells migration and metastasis by inducing EMT. Furthermore, we revealed that the effect of TRIM37 mediated EMT in HCC cells was achieved by the activation of Wnt/β-catenin signaling. These finding may provide insight into the understanding of TRIM37 as a novel critical factor of HCC and a candidate target for HCC treatment.

TRIM37 ja anti-HIV-1 aktiivisuus

(Suomennosta)
 Kaikista löydetyistä TRIM-proteiineista havaittiin TRIM5alfa ensiksi sellaiseksi, että se pystyi aiheuttamaan restriktiota HIV-1 viruksen replikaatiolle. TRIM-proteiinien antiviruskirjon laajuus on aktiivin tutkimuksen kohteena . Tässä artikkelissa raportoidaan, että TRIM37 omaa myös anti-HIV-1 aktiivisuutta. Miten se ilmenee?
a) Jos TRIM37 ohimenevästi yli-ilmennetään, viruksen replikoituminen vähenee virusta tuottavissa soluissa.
b) Viruksen infektiivisyyden lasku korreloi TRIM37:n inkorporoitumiseen  mukaan virioniin.
c) HIV-1 replikaatio lisääntyi sinä aikana, kun TRIM37 hiljennettiin siRNA:lla.
d) Viruksen DNA:n synteesi väheni, kun TRIM37 ohimenevästi yli-ilmennettiin.
Nämä löydöt ovat ensimmäinen demonstraatio ihmisen TRIM37:n vahvasta antivirusaktiviteetista ja viittaavat antiviraaliseen mekanismiin, jolla TRIM37 puuttuu virus- DNA:n synteesiin.
  • Trim 5α was the first member of the tripartite motif (TRIM) family of proteins that was identified to potently restrict human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) replication. The breadth of antiretroviral activity of TRIM family members is an active area of investigation. In this study, we demonstrate that human Trim 37 possesses anti-HIV-1 activity. This antiretroviral activity and the manner in which it was displayed were implicated by (1) decreased viral replication upon Trim 37 transient overexpression in virus-producing cells, (2) correlation of the reduction of viral infectivity with Trim 37 virion incorporation, (3) increased HIV-1 replication during siRNA depletion of Trim 37 expression, and (4) reduction in viral DNA synthesis upon Trim 37 transient overexpression. Our findings provide the first demonstration, to our knowledge, of the potent antiviral activity of human Trim 37, and implicate an antiviral mechanism whereby Trim 37 interferes with viral DNA synthesis
Muistiin 27.4. 2018

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar