TRIM10 (Kr.6p22.1) RNF9, RFB30, HERF1 (hematopoieettinen RING finger1) . Alaluokka CIV,PRY/SPRY)

TRIM10 (Kr.6p22.1 ), RNF9, HERF1, RFB30 , Hematopoietic RING finger 1.

Tässä TRIM10 proteiinissa on 3 sinkkiä sitovaa domeenia, RING, B-Box1(?) ja B-Box2 sekä CC ( coiled coil )-domeeni. Joissain lähteissä mainitaan rakenteessa olevan vain yksi B-Box (B-Box2) . Proteiinin rakenne ja sen konservoituneet domeenit: 481 aminohapon sekvenssi. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_006769.2

Aminohapoissa 16-60 RING-finger domaani.

Aminohapoissa 94-135 BBOX, B-Box tyyppinen Zn-finger.

Aminohapoissa 143- 217 helikaalinen domeeni luokan IA PI3K- sääteinen alayksikkö (iSH2_PI3K_IA_R) .

Aminohapoissa 309-480 SPRY_PRY_TRIM10, eli PRY/SPRY domeeni (Hematopoietic RING finger1) .

Tämä TRIM10-proteiini lokalisoituu sytoplasmisiin kappaleisiin. Hiirikokeissa on todettu sen olevan tärkeä erytroidisten solujen terminaalisesassaerilaistumisessa. Vaihtoehtoispleissauksella tulee kaksi varianttia, jotka koodaavat eri isoformeja. TRIM10 alfa ja TRIM10 beta. Geeniä ilmenee luuytimessä, munuaisessa ja kuudessa muussa kudoksessa. Se sijaitsee hemokromatoosialueen välittömässä läheisyydessä.

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/10107.RNF9; HERF1; RFB30 Summary The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. This protein localizes to cytoplasmic bodies. Studies in mice suggest that this protein plays a role in terminal differentiation of erythroid cells. Alternate splicing of this gene generates two transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] Expression Biased expression in bone marrow (RPKM 6.5), kidney (RPKM 1.8) and 6 other tissues See more

Related articles in PubMed

• Cloning, structural analysis, and mapping of the B30 and B7 multigenic families to the major histocompatibility complex (MHC) and other chromosomal regions. Henry J, et al. Immunogenetics, 1997. PMID 9271628

• Isolation of novel non-HLA gene fragments from the hemochromatosis region (6p21.3) by cDNA hybridization selection.

• Goei VL, et al. Am J Hum Genet, 1994 Feb. PMID 8304341, Free PMC Article

• Molecular cloning of testis-abundant finger Protein/Ring finger protein 23 (RNF23), a novel RING-B box-coiled coil-B30.2 protein on the class I region of the human MHC. Orimo A, et al. Biochem Biophys

• Res Commun, 2000 Sep 16. PMID 11006080

• HERF1, a novel hematopoiesis-specific RING finger protein, is required for terminal differentiation of erythroid cells. Harada H, et al. Mol Cell Biol, 1999 May. PMID 10207104, Free PMC Article

• Genome-wide association study of proneness to anger. Mick E, et al. PLoS One, 2014. PMID 24489884, Free PMC
  

See all (16) citations in PubMed

Related articles in PubMed

• Cloning, structural analysis, and mapping of the B30 and B7 multigenic families to the major histocompatibility complex (MHC) and other chromosomal regions. Henry J, et al. Immunogenetics, 1997. PMID 9271628

• Isolation of novel non-HLA gene fragments from the hemochromatosis region (6p21.3) by cDNA hybridization selection.

• Goei VL, et al. Am J Hum Genet, 1994 Feb. PMID 8304341, Free PMC Article

• Molecular cloning of testis-abundant finger Protein/Ring finger protein 23 (RNF23), a novel RING-B box-coiled coil-B30.2 protein on the class I region of the human MHC. Orimo A, et al. Biochem Biophys Res Commun, 2000 Sep 16. PMID 11006080

• HERF1, a novel hematopoiesis-specific RING finger protein, is required for terminal differentiation of erythroid cells. Harada H, et al. Mol Cell Biol, 1999 May. PMID 10207104, Free PMC Article (Suomennosta tiivistelmästä) Hematopoieesissa on ratkaisevana transkriptiotekijänä AML1/CBF, mutta kuitenkin alavirran signaalitie, jonka kautta se toimii, on aiemmin ollut epätäydellisesti määritelty. Tutkijat määrittivät näitä tekijöitä kloonausteitse ja tunnistivat HERF1:ksi nimittämänsä tekijän (hematopoietic RING finger1) ja että sen ilmenemä kehityksen kuluessa riippuu funktionaalisen AML/CBFbetan läsnäolosta. HERF1- proteiini sisältää N-terminaalisen RBCC-domeenin ja C-terminaalisen alueen, jossa sijaitsee ret-proto-onkogeenille homologinen finger-proteiini. Alkionkehityken aikana HERF1 ilmenee samaan aikaan, kun tulee esiin määräytynyt erytropoieesi; aikuishiirillä vastaava ilmenemä rajoittuu erytroideihin soluihin ja lisääntyy 30-kertaiseksi terminaalisen erilaistumisen aikana. Tärkeä huomata, että HERF1-ilmenemän esto aiheutti blokeerautumisen terminaalisessa erytroidierilaistumisessa hiiren erytroleukemiasolulinjassa (MEL), mutta sen yliesiintymä puolestaan indusoi erytroidin kypsymisen. Näistä tuloksista päätellen tällä proteiinilla on tärkeä osa erytropoieesissa.
• Abstract The AML1/core binding factor beta (CBFbeta) transcription factor is essential for definitive hematopoiesis; however, the downstream pathways through which it functions remain incompletely defined. Using a differential cloning approach to define components of this pathway, we have identified a novel gene designated HERF1 (for hematopoietic RING finger 1), whose expression during development is dependent on the presence of functional AML1/CBFbeta. HERF1 contains a tripartite RING finger-B box-alpha-helical coiled-coil domain and a C-terminal region homologous to the ret proto-oncogene-encoded finger protein. Expression of HERF1 during embryogenesis coincides with the appearance of definitive erythropoiesis and in adult mice is restricted to erythroid cells, increasing 30-fold during terminal differentiation. Importantly, inhibition of HERF1 expression blocked terminal erythroid differentiation of the murine erythroleukemia cell line MEL, whereas its overexpression induced erythroid maturation. These results suggest an important role for this protein in erythropoiesis.

• Genome-wide association study of proneness to aner. Mick E, et al. PLoS One, 2014. PMID 24489884, Free PMC
  

See all (16) citations in PubMed

Muistiin 6.2.2018. Päivitys 4.4. 2018