Leta i den här bloggen


lördag 10 november 2018

TFF1 (21q22.3) , BCEI, Gastrisen mukoosan peptidi


TTF1 MISTÄ PROTEIINISTA ON KYSYMYS?

Kolmilehtinen faktori TTF1, Geeni 21q22.3. Geeni tunnetaan myös nimillä pS2, BCE1, HPS2, HPLA, pNR-2 ja D21S21. Nimien paljos viittaa sen moniin merkityksiin.
Yhteenveto: Kolmilehtisen proteiiniperheen TTF jäsenille on tyypillistä, että niillä on ainakin yksi kopio kolmilehtimotiivia, 40-aminohapon domeeni, jossa on kolme konservoitunutta disulfidia. Ne ovat stabiileja sekretorisia proteiineja, joita gastrointestinaalinen limakalvo ilmentää. Niiden funktiot eivät ole määriteltyjä, mutta ne saattavat suojata limakalvoa vaurioilta, stabiloida mukoosikerrosta ja vaikuttaa epiteelin parantumiseen. Tätä myös mahalaukun limakalvossa ilmenevää geeniä on tutkittu , koska sitä ilmenee ihmisen kasvannaisissa. Tämä geeni ja kaksi sen kaltaista kolmilehtisperheen geenijäsentä löytyy geeniklusterissa kromosomissta 21. (2008) . Geenin ilmenemä rajoittuu mahalaukkuun. Proteiinin ensisijainen nimi on Trefoil factor 1 TTF1. Kolmilehtinen faktori 1. Sillä on myös nimiä: Rintasyövän estrogeenista indusoituva proteiini (BCEI), rintasyövän estrogeenista indusoituva sekvenssi , gastrointestinaalinen kolmilehtinen proteiini pS2, polypeptidi PLA (HPLA), , proteiini pS2.
  • Trefoil factor 1, geeni TTF1 (21q22.3)  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7031

  • Also known as pS2; BCEI; HPS2; HP1.A; pNR-2; D21S21
  • Summary. Members of the trefoil family(TTF)  are characterized by having at least one copy of the trefoil motif, a 40-amino acid domain that contains three conserved disulfides. They are stable secretory proteins expressed in gastrointestinal mucosa. Their functions are not defined, but they may protect the mucosa from insults, stabilize the mucus layer, and affect healing of the epithelium. This gene, which is expressed in the gastric mucosa, has also been studied because of its expression in human tumors. This gene and two other related trefoil family member genes are found in a cluster on chromosome 21. [provided by RefSeq, Jul 2008] Expression  Restricted expression toward stomach (RPKM 2677.
  • Preferred Names trefoil factor 1
  • Names breast cancer estrogen-inducible protein; breast cancer estrogen-inducible sequence; gastrointestinal trefoil protein pS2; polypeptide P1.A; protein pS2.

PubMEd artikkeleita tästä proteiinista
Artikkeli 1.
  TTF1 säätynee autoinduktiivisesti synergisesti HIF-1alfan kanssa. Se vaikuttaa EMT epiteliaalisesta mesenkymaaliseen siirtymistä (EMT) lähinnä tarkoituksena limakalvovaurion korjaantuminen.
Artikkeli 2.
 Varhaisessa ruokatorven epiteelin syövässä (ESCC) TTF1 on mahdollinen biomerkitsijä varhaisessa diagnostiikassa, jopa tuumorialatyypin erottamisessa, koska sitä ei havaita alkavassa ESCC-tuumorissa eikä sen ympärilla submukosassa kuten normaaliesofaguksessa. Decitabine, joka vähentää promoottorihypermetylaatiota säätää ylös TTF1 geenin ja mRNA:n . TTF1 kato on ESCC:lle tyypillinen, mutta sitä ei tapahdu esofageaalisessa adenokarsinoomassa.
Artikkeli 3. 
 Rikkisinappikaasulle altistuneessa keuhkossa TFF1 ylisäätynyt ja osallistuu hengitystie-epiteelin uudelleen muovautumsieen ja funktion ylläpitämiseen.
Artikkeli 4.
TFF1 kohoaa (niukasti differentioituneen) musinoosin ovariaalikarsinooman malignissa fenotyypissä Wnt/beta-kateniinisignalointiteitse.
Artikkeli 5.
TFF peptidit edistävät mukoosiepiteelin korjautumista ja niitä on runsaasti virtsateissä. Kroonisessa munuaistaudissa alkuvaiheessa asteissa 1-4 nousee TFF1 ja laskee loppuvaiheessa. TFF3 nousee 4-5 vaiheessa. Täten TFF peptidit heijastavat kroonsien munuaistaudin vaihetta. Ja ne säätyvät eri tavoilla.
Artikkeli 6.
TFF1 on gastrisista mukussoluista erittyvä musiiniin liittyvä peptidi. Helikobakteeri-infektion alussa sitä indusoituu antrumosassa ja samalla indusoituvat IL-1beta ja IL-6. Infektion edetessä TFF1- ilmenemä laskee, kun infektio pääsee kronisoitumaan ja IFNgamma, CXCL5 ja CXL15 pitoisuudet kohoavat. TFF1 saattaisi auttaa vastustamaan bakteerin kolonisoitumista ja infektion kronisoitumista.

(Artikkeli 7.
 kertoo TFF1 ja GKN2 heterotrimeeristä jota normaalimahalaukun mukussolut muodostavat. Tästä erikseen). 

  1. TFF1 Promotes EMT-Like Changes through an Auto-Induction Mechanism. Romano E, et al. Int J Mol Sci, 2018 Jul 11. PMID 29997345, Free PMC Article
  2. Trefoil Factor Family 1 Is Involved in Airway Remodeling of Mustard Lung. Nourani MR, et al. Iran J Allergy Asthma Immunol, 2016 Aug. PMID 27921407
  3. Trefoil factor 1 elevates the malignant phenotype of mucinous ovarian cancer cell through Wnt/β-catenin signaling. Zhao S, et al. Int J Clin Exp Pathol, 2015. PMID 26617749, Free PMC Article (TFF1 has oncogenic role).
  4. Trefoil Factor 1 Excretion Is Increased in Early Stages of Chronic Kidney Disease. Lebherz-Eichinger D, et al. PLoS One, 2015. PMID 26390128, Free PMC Article
  5. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29085807 Microbiol. 2017 Oct 9;7:434. doi: 10.3389/fcimb.2017.00434. ECollection 2017. Acute to Chronic Helicobacter Infection.Esposito R1, Morello S1,et al.

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_003216.1
Kuva esittää teoriaa  TFF1signaloinnista joka ei ole täysin selvitetty asia. 


Inga kommentarer:

Skicka en kommentar