Leta i den här bloggen


tisdag 6 november 2018

MUC5B (11p15.5), Salivaarinen MG1, trakeobronkiaalinen musiini-5B

 MUC5B on  vahvasti glykosyloitunut makromolekyyli,  salivaarinen MG1 musiini ja trankeobronkiaalinen MUC5B.

(Finnish)  
 Tämä geeni kuuluu samaan kromosomiin 11p15.5 kuin edellinenkin MUC5AC. 
MUC5B koodaa MUC5 -musiinierityksen  erittäin glykosyloituneita  makromolekulaarisia komponentteja . Tämä musiiniperheenjäsen on limakalvoliman  pääasiallinen   geeliä muodostava  musiini.
// Limakalvo on mukoosa. (MUCOSA)
Lima  = MUCUS.
Nämä glykoproteiinit  ovat musiineita tai suomeksi myös mukiineita ( MUCINS). 
Geeninimi on lyhennys MUC.//

Musiini-5B   antaa  sekä kokosylkeen että   normaaliin keuhkolimaan ja kervikaaliseen limaan   lubrikaatio - ja viskoelastisia ominaisuuksia.  Tämän geenin on havaittu säätyvän ylös    joissain taudeissa . Niihin kuuluu  sivuonteloitten mukosan taudit kroonisessa rinosinuiitissa ja     nasaalisessa  polypoosissa, krooninen obstruktiivinen keuhkosairaus (COPD) ja  mahalaukun pyloriseen (mahaporttiosaan) osaan  assosioitunut  helikobakteeri-tauti.   Ehkä  MUC5B on osallinen näiden tautien patogeneesiin. 
Geeniä ilmenee  sappirakossa , paksusuolessa ja kolmessa muussa kudoksessa. 
 
 Geenin koodaman proteiinin  ensisijaiseksi nimeksi on annettu  musiini-5B.
Muita nimiä ovat.
kervikaalinen musiini MUCB5; 
korkeamolekyylipainoinen syljen musiini MG1;
musiini 5, alatyyppi B, trakeobronkiaalinen;
kielenalussylkirauhasen  musiini.
 
  • Gene MUC5B
  • Also known as
MG1; MUC5; MUC9; MUC-5B
Summary
This gene encodes a member of the mucin family of proteins, which are highly glycosylated macromolecular components of mucus secretions. This family member is the major gel-forming mucin in mucus. It is a major contributor to the lubricating and viscoelastic properties of whole saliva, normal lung mucus and cervical mucus. This gene has been found to be up-regulated in some human diseases, including sinus mucosa of chronic rhinosinusitis (CRS), CRS with nasal polyposis, chronic obstructive pulmonary disease (COPD) and H. pylori-associated gastric disease, and it may be involved in the pathogenesis of these diseases. [provided by RefSeq, Jul 2010]
Expression
Biased expression in gall bladder (RPKM 56.3), colon (RPKM 19.6) and 3 other tissues See more
Orthologs
  • Preferred Names of this glycoprotein
mucin-5B
  • Names
cervical mucin MUC5B
high molecular weight salivary mucin MG1
mucin 5, subtype B, tracheobronchial
sublingual gland mucin

PEPTIDIRAKENTEESTA: KONSERVOIDUT DOMEENIT
Conserved Domains (9) summary
smart00041
Location:56605742
CT; C-terminal cystine knot-like domain (CTCK)
smart00214
Location:55235586
VWC; von Willebrand factor (vWF) type C domain
smart00215
Location:387432
VWC_out; von Willebrand factor (vWF) type C domain
smart00216
Location:8841041
VWD; von Willebrand factor (vWF) type D domain
smart00832
Location:615685
C8; This domain contains 8 conserved cysteine residues
pfam01826
Location:329385
TIL; Trypsin Inhibitor like cysteine rich domain
pfam08742
Location:52905351
C8; C8 domain
pfam13330
Location:17891878
Mucin2_WxxW; Mucin-2 protein WxxW repeating region
pfam17061
Location:26752860
PARM; PARM
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=293666

(PARM=prostatic androgen repressed mesage-1,
Human PARM-1 is a mucin-like, androgen-regulated transmembrane protein that is present in most tissues, with high levels in the heart, kidney and placenta. It has been shown to be induced and expressed in prostate after castration and may have a role in cell proliferation and immortalization in prostate cancer).

PubMed Related articles (Artikkeleita tästä musiinista -5B). 

  • 2018  Galarmiini,  kondrosarkoma  ja luonnollisen immuunivasteen komponentit

Ihmisen kondrosarkoomassa on todettu  sytostaattisen proliinipitoiseen polypeptidi-1:n (PRP-1) kiinnityspartneriksi  Tollin reseptorien kaltaiset reseptorit  TLR1/2, TLR6 ja  MUC5B.   Metastaattinen kondrosarkooma  on luunpahanlaatuinen tauti, joka ei vataa konventionelliin trapiaan.  Sen takia koetetaan löytää uusia lähestymistapoja ja terapioita kiireellisesti. Aiemmin  tutkijat ovat raportoineet  mTORC1-inhibiittorista (PRP1:stä) , galarmiini- nimeltään,  joka  sääti  merkitsevästi ylös tulehdukseen osallistuvia   tuumorisuppressoreita ja toisaalta sääti alas  onkoproteiineja ja  embryonaalista  kantasolun merkitsijää (miR-302-c) ja sen kohteita  (Nanog, c-Myc ja Bmi-1)  ihmisen kondrosarkoomassa. he halusivat tietää, mihin reseptoriin  galarmiini sitoutuu. Ne eivät olleet G-proteiiniin kytkeytyneitä eivätkä ne kuuluneet NR- eikä orporeseptoreihin, vaan ne kuuluivat luonnolliseen immuniteettiin PAMP ja MAMP- tunnistusjärjetelmään( TLR1/2 ja TLR6  sekä  geeliä muodostava sekretorinen musiini MUC5B.  Ihmisen kondrosarkoomassa MUC5B oli  se reseptori, joka sitoi PRP-1 ( galarmiinia).  Immunosytokemialliset tutkimukset vahvistivat PRP-1 reseptorien lokalisoituvan tuumorin tumaan. Kondrosarkoomassa  mainitut TLR- reseptorit ja MUC5B olivat  alassäätyneitä ja PRP-1 sääti  ne ylös annoksesta riippuvalla tavalla. Kokeellisesti oli  näin osoitettu mainituilla reseptoreilla olevan tuumoria vaimentava vaikutus. ( siis kohentamalla luonnollista  immuunivastetta).

  • Toll like receptors TLR1/2, TLR6 and MUC5B as binding interaction partners with cytostatic proline rich polypeptide 1 in human chondrosarcoma. Galoian K, et al. Int J Oncol, 2018 Jan. PMID 29138803, Free PMC Article Metastatic chondrosarcoma is a bone malignancy not responsive to conventional therapies; new approaches and therapies are urgently needed. We have previously reported that mTORC1 inhibitor, antitumorigenic cytostatic proline rich polypeptide 1 (PRP-1), galarmin caused a significant upregulation of tumor suppressors including TET1/2 and SOCS3 (known to be involved in inflammatory processes), downregulation of oncoproteins and embryonic stem cell marker miR-302C and its targets Nanog, c-Myc and Bmi-1 in human chondrosarcoma. To understand better the mechanism of PRP-1 action it was very important to identify the receptor it binds to. Nuclear pathway receptor and GPCR assays indicated that PRP-1 receptors are not G protein coupled, neither do they belong to family of nuclear or orphan receptors. In the present study, we have demonstrated that PRP-1 binding interacting partners belong to innate immunity pattern recognition toll like receptors TLR1/2 and TLR6 and gel forming secreted mucin MUC5B. MUC5B was identified as PRP-1 receptor in human chondrosarcoma JJ012 cell line using Ligand-receptor capture technology. Toll like receptors TLR1/2 and TLR6 were identified as binding interaction partners with PRP-1 by western blot analysis in human chondrosarcoma JJ012 cell line lysates. Immunocytochemistry experiments confirmed the finding and indicated the localization of PRP-1 receptors in the tumor nucleus predominantly. TLR1/2, TLR6 and MUC5B were downregulated in human chondrosarcoma and upregulated in dose-response manner upon PRP-1 treatment. Experimental data indicated that in this cellular context the mentioned receptors had tumor suppressive function.
 
  
  • (Finnish) Jos  tapahtuu geneettistä muuntumista  MUC5B - geenissä ja  ja proteiinisa, tämä vaikuttaa kariestilanteeseen.
 


  •  Hypersensitiivisessä pneumoniitssia  on riskiä keuhkofibroosin kehittymisestä, ja sehän kaventaa elinikää. Jos suvuissa on useita   smaa vaivaa potevia, saattaa  kyse olla idiopaattisesta keuhkofibroosista (IPF)  tai koronisesta( fibroottisesta) hypersensitiivisestä pneumoniitista, mikä viittaa näiden häiriöiden  omaavan  samoja riskitekijöitä. Tutkijat testasivat  niitä genomisia riskitekijöitä, jotka assosioituivat  IPF.n kehittymiseen ja progredioitumsieen ja  selvittivät, olivatko ne myös assosioituneita  fibroosin kehitykseen ja kaventuvaan elossapysymiseen  kroonista hypersensitiivistä pneumoniittia potevilla henkilöillä.  Assioitumiset  MUC5B promoottoripolymorfian  ja  lyhyiden  telomeerien  kesken  fibroosin ja tavallisen interstitiellin pneumonian histopatologisten piirteiden  edetessä  ja eliniän kavetessa   kroonista hypersensitiivistä pneumoniittia potevilla   viittaavat  samankaltaiseen patobiologiaan IPF:n kanssa  ja tästä saadaan riskin kumuloimiseen  apua.
  • Patients with hypersensitivity pneumonitis are at risk of developing pulmonary fibrosis, which is associated with reduced survival. In families with multiple affected members, individuals might be diagnosed as having idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) or chronic (fibrotic) hypersensitivity pneumonitis, which suggests these disorders share risk factors. We aimed to test whether the genomic risk factors associated with the development and progression of IPF are also associated with the development of fibrosis and reduced survival in people with chronic hypersensitivity pneumonitis.The associations between MUC5B rs35705950 and short telomere length with extent of fibrosis, histopathological features of usual interstitial pneumonia, and reduced survival in patients with chronic hypersensitivity pneumonitis suggest shared pathobiology with IPF, and might help to stratify risk.
 https://www.atsjournals.org/doi/10.1165/rcmb.2017-0250LE

Päivitystä 8.11. 2018

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar