https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_872342.2
Gastrokiini-2 (GKN-2) on mahalimakalvopinnan limasoluista erittyvä proteiini ja se pystyy sitoutumaan näissä limasoluissa TFF-1 tekijään tai toiseen gastrokiiniin, joka on GKN1.
Arvellaan tämän geenin olevan tuumorisuppressorigeeni, koska se on huomattavasti vähentynyt mahasyöpäkudoksesta Koodautunut proteiini tekee interaktioita gastrokiini-2:n kanssa ja säätelee mahalimakalvon homeostaasia. Tieto on vuodelta 2015. Koodautuneen proteiinin nimet ovat: ensisijaisesti gastrokiini-2- prekursoeri.
Muita nimiä: "Down-regulated in gastric cancer, " Alassäätynyt mahasyövässä" (GDDR );
blottin ( blottiini);
trefoil factor interactions(z), TFF1- proteiinin kanssa interaktioita tekevä proteiini (z) 1;
"BRICHOS domain contaiing 1B", BRICHOS-domeenin sisältävä 1B.
Peptidissä oleva konservatiivinen domeeni BRICHOS on havaittavissa monenlaisissa proteiineissa, jotka osallistuvat dementiaan, hengitysteitten ahdistumaan ja syöpään. Sen tarkkaa funktiota ei tunneta: on ehdotettu erilaisia osia tälle proteiinille, joka on noin 100 aminohappoa pitkä , kuten (a) proteiinin kohdentaminen sekretoriseen järjestelmään, (b) intramolekulaarinen kaitsijaproteiinin (chaperone) tapainen funktio ja (c) erikoistuneen intrasellulaarisen proteaasin avustaminen prosessoivassa järjestelmässä. Tämä C-terminaalinen domeeni on petautuneena endoplasmisen verkoston (ER) onteloon ja sitoutuu N-terminaaliin, se on transmembraaninen , SP_C, pfam08999 edellyttäen, että se ei ole helikaalisessa konformaatiossa. Täten proSP-C BRICHOS-domeeni on kaitsijaporteiini, chaperone, joka indusoi alfa-helikaalisen muodon aggrekoitumaan pyrkivässä TM- alueessa.
- The BRICHOS domain is found in a variety of proteins implicated in dementia, respiratory distress and cancer. Its exact function is unknown; roles that have been proposed for the domain, which is about 100 amino acids long, include (a) targeting of the protein to the secretory pathway, (b) intramolecular chaperone-like function, and (c) assisting the specialised intracellular protease processing system. This C-terminal domain is embedded in the endoplasmic reticulum lumen, and binds to the N-terminal, transmembrane, SP_C, pfam08999 provided that it is in non-helical conformation. Thus the BRICHOS- domain of proSP-C is a chaperone that induces alpha-helix formation of an aggregation-prone TM region.
Proteiinin rakenteesta, 10 referenssiä GKN2:n merkityksestä.
2017. Ref.1.GKN2- ja TFF1- proteiinien välinen heteromeerinen interaktio tuottaa antiproliferatiivisia ja proapoptoottisia vaikutuksia mahasyöpää kohtaan. GKN2:n ja TFF1:n samanaikaisesiintymä vaimensi massiivisesti solusyklin positiivisten säätelijöiden ilmentymistä ja indusoi solusyklin G1/S- vaiheen pysähtymän, synergistisesti lisäten maksasyöpäsolun elinkykyisyyden ja proliferoitumisen estovaikutusta.
2016. Ref.2.
Gastrokiini-2 supressoi (vaimentaa) mahakarsinoomassa epiteliaalismesenkymaalista transitiota PI3K/AKT/GSK3beeta-signalointiteitse. GKN2 vaimensi EMT- muutoksen SNAIL- alasssäätelyllä signaloimalla PI3K/AKT/GSKbeta3-tietä.
2016. Ref.3.
GDDR omaa mahdollista osuutta helikobakteeriin (H. pylorii) assosioituvan mahasyövän kehittymiseen. Tutkijoiden tulokset osoittavat tässä ensimmäisen kerran, että asteittaiset muuntumiset GDDR:n ilmentymisessä eivät ole ainoastaan suoraan suhteessa H. pylori- infektioon, vaan ne ovat myös yhtenä molekyläärisenä varhaistapahtumana mahasyövän kehityksessä .
2016. Ref. 4.
Gastrointestinaalinen tekijä GDDR vaimentaa epiteelismesenkymaalista transitiota (EMT) mahasyövässä estämällä AKT-signalointia. Löydöt viittaavat siihen, että GDDR:n ilmenemä liittyy mahasyövän progredioitumiseen ja GDDR saattaa toimia tuumorisuppressorina estämällä EMT-tapahtumaa, epiteelismesenkymaalista transitiota.
2016. Ref. 5.
GKN-2:n (gastrokiini-2) puuttuma vaikuttaa premalignia gastrista tulehdusta ja tuumorin progredioitumista (etenemistä). Näistä tuloksista selviää , että GKN-2 omaa anti-inflammatorista tehtävää ja samalla on saatu in vivo- näyttöä , mikä linkitsee GKN2:n menetyksen mahasyövän patogeneesiin ja viittaa siihen ,että GKN :n palauttaminen on eräs strategia pidätellä mahasyöpää etenemästä.
2016. Ref.6.
Löydöt viitaavat siihen, että GDDR (GKN-2):n ilmenemä assoioituu mahasyövän progredioitumsien ja GDDR saataa toimia tuumori suppressorina estäen EMT:tä, epiteliaalismesenkymaalista transitiota. Gastrisessa syövässä TFF1- ilmenemä TFIZ1:n puuttuessa assosioituu imusolmukemetastaasiin. .
2008. Ref.7.
Mahasyövässä on gastrokiini-1:n (GKN-1) ja TFF1:n kanssa interaktiota tekevän proteiinin TFIZ1/GKN2:n ilmenemä alentunut: tämä vaikuttaa tuumorin histologiaan ja on suhteessa prognoosiin. GKN1 ja GKN2 ilmeenevät usein mahan adenokarsinoomassa, erityisesti diffuusissa alatyypissä.
2007. Ref.8.
Gastrokiini-2:n (GKN-2) biosynteesi ihmisen gastrisessa mukoosassa: rajoittunut tilavuudellinen ilmenemä on mahanportin rauhasten akselilla ja erilaista interaktiota TFF1 ja TFF2-proteiinien ja musiinien kanssa havaitaan. TFF1- GKN-2 heterodimeeri ja TFF2 eroavat luonteeltaan sitoutumisessaan gastriseen limakalvoon.
2006. Ref. 9.
Tunnistetaan blottiini, uusi gastrista TFF-2-proteiinia sitova proteiini
2005. Ref. 10.
Interaktio gastrisen tuumorisoppressorin, kolmilehtiproteiinin TFF1, ja TFIZ1:n , BRICHOS- domeenin, SP-C-surfaktanttin kanssa homologiaa omaavan proteiinin kesken. TFF1:een sitoutuva partneri on 18.31 kDa kokoinen normaalin mahalimakalvon proteiini. Siinä on noin 100 aminohapon brichos-domeeni ja sillä on homologiaa surfaktanttiproteiiniin-C, (SP-C).
gastrokine-2 precursor [Homo sapiens]
NCBI Reference Sequence: NP_872342.2
LOCUS NP_872342 184 aa linear PRI 15-JUL-2018 DEFINITION gastrokine-2 precursor [Homo sapiens]. ACCESSION NP_872342 VERSION NP_872342.2 DBSOURCE REFSEQ: accession NM_182536.2 KEYWORDS RefSeq. SOURCE Homo sapiens (human) ORGANISM Homo sapiens Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo. REFERENCE 1 (residues 1 to 184) AUTHORS Kim O, Yoon JH, Choi WS, Ashktorab H, Smoot DT, Nam SW, Lee JY and Park WS. TITLE Heterodimeric interaction between GKN2 and TFF1 entails synergistic antiproliferative and pro-apoptotic effects on gastric cancer cells JOURNAL Gastric Cancer 20 (5), 772-783 (2017) PUBMED 28150071 REMARK GeneRIF: Co-expression of GKN2 and TFF1 massively suppressed the expression of positive cell cycle regulators and induced G1/S arrest, synergistically enhancing the inhibition of cell viability and proliferation of gastric cancer cells REFERENCE 2 (residues 1 to 184) AUTHORS Dai J, Qian C, Su M, Chen M and Chen J. TITLE Gastrokine-2 suppresses epithelial mesenchymal transition through PI3K/AKT/GSK3beta signaling in gastric cancer JOURNAL Tumour Biol. 37 (9), 12403-12410 (2016) PUBMED 27323966 REMARK GeneRIF: GKN2 suppressed epithelial mesenchymal transition of gastric cancer cells by downregulation of snail through PI3K/AKT/GSK3beta signaling pathway. REFERENCE 3 (residues 1 to 184) AUTHORS Zhao Z, Wang F, Fang C, Wang G, Shuang J, Chu G, Hu S, Chen L and Du J. TITLE A possible role of GDDR in the development of Helicobacter pylori-associated gastric cancer JOURNAL Tumour Biol. 37 (8), 10303-10315 (2016) PUBMED 26842925 REMARK GeneRIF: Our results suggested, for the first time, that the gradual change in GDDR expression might not only be directly related to H. pylori infection but also be an early molecular event in the development of gastric carcinoma. REFERENCE 4 (residues 1 to 184) AUTHORS Fang C, Zhang Z, Liu C, Wang G, Wang F, Zhao Z, Li W, Hua J, Shuang J and Du J. TITLE Gastrointestinal Factor GDDR Attenuates Epithelial-Mesenchymal Transition in Gastric Cancer via Inhibiting AKT Signal JOURNAL Dig. Dis. Sci. 61 (7), 1941-1949 (2016) PUBMED 27017226 REMARK GeneRIF: These findings suggested that GDDR expression was significantly associated with the progression of gastric cancer and GDDR may function as a tumor suppressor via inhibiting the epithelial-mesenchymal transition. REFERENCE 5 (residues 1 to 184) AUTHORS Menheniott,T.R., O'Connor,L., Chionh,Y.T., Dabritz,J., Scurr,M., Rollo,B.N., Ng,G.Z., Jacobs,S., Catubig,A., Kurklu,B., Mercer,S., Minamoto,T., Ong,D.E., Ferrero,R.L., Fox,J.G., Wang,T.C., Sutton,P., Judd,L.M. and Giraud,A.S. TITLE Loss of gastrokine-2 drives premalignant gastric inflammation and tumor progression JOURNAL J. Clin. Invest. 126 (4), 1383-1400 (2016) PUBMED 26974160 REMARK GeneRIF: these results reveal an antiinflammatory role for GKN2, provide in vivo evidence that links GKN2 loss to GC pathogenesis, and suggest GKN restoration as a strategy to restrain GC progression. REFERENCE 6 (residues 1 to 184) AUTHORS May FE, Griffin SM and Westley BR. TITLE The trefoil factor interacting protein TFIZ1 binds the trefoil protein TFF1 preferentially in normal gastric mucosal cells but the co-expression of these proteins is deregulated in gastric cancer JOURNAL Int. J. Biochem. Cell Biol. 41 (3), 632-640 (2009) PUBMED 18722547 REMARK GeneRIF: in gastric cancer, expression of TFF1 in the absence of TFIZ1 is associated with lymph node metastasis REFERENCE 7 (residues 1 to 184) AUTHORS Moss SF, Lee JW, Sabo E, Rubin AK, Rommel J, Westley BR, May FE, Gao J, Meitner PA, Tavares R and Resnick MB. TITLE Decreased expression of gastrokine 1 and the trefoil factor interacting protein TFIZ1/GKN2 in gastric cancer: influence of tumor histology and relationship to prognosis JOURNAL Clin. Cancer Res. 14 (13), 4161-4167 (2008) PUBMED 18593995 REMARK GeneRIF: GKN1 and GKN2 expression occurs frequently in gastric adenocarcinomas, especially in the diffuse subtype REFERENCE 8 (residues 1 to 184) AUTHORS Kouznetsova I, Laubinger W, Kalbacher H, Kalinski T, Meyer F, Roessner A and Hoffmann W. TITLE Biosynthesis of gastrokine-2 in the human gastric mucosa: restricted spatial expression along the antral gland axis and differential interaction with TFF1, TFF2 and mucins JOURNAL Cell. Physiol. Biochem. 20 (6), 899-908 (2007) PUBMED 17982272 REMARK GeneRIF: The TFF1-GKN2 heterodimer and TFF2 differ characteristically by their binding to gastric mucins. REFERENCE 9 (residues 1 to 184) AUTHORS Otto WR, Patel K, McKinnell I, Evans MD, Lee CY, Frith D, Hanrahan S, Blight K, Blin N, Kayademir T, Poulsom R, Jeffery R, Hunt T, Wright NA, McGregor F and Oien KA. TITLE Identification of blottin: a novel gastric trefoil factor family-2 binding protein JOURNAL Proteomics 6 (15), 4235-4245 (2006) PUBMED 16888721 REFERENCE 10 (residues 1 to 184) AUTHORS Westley BR, Griffin SM and May FE. TITLE Interaction between TFF1, a gastric tumor suppressor trefoil protein, and TFIZ1, a brichos domain-containing protein with homology to SP-C JOURNAL Biochemistry 44 (22), 7967-7975 (2005) PUBMED 15924415 REMARK GeneRIF: TFIZ1 is an 18.31 kDa binding partner of trefoil factor 1 (TFF1) protein in normal gastric mucosa; it contains an approximately 100 amino acid brichos domain and has homology with surfactant protein C. (TFIZ1; trefoil factor interactions 1) COMMENT REVIEWED REFSEQ: This record has been curated by NCBI staff. The reference sequence was derived from AF494509.2. On Feb 16, 2005 this sequence version replaced NP_872342.1. Summary: The secretory protein encoded by this gene is produced in gastric surface mucous cells, where it can bind trefoil factor family peptide 1 or gastrokine-1. This gene may be a tumor suppressor gene, as its expression is markedly decreased in gastric cancer tissues. The encoded protein interacts with gastrokine-1 and regulates homeostasis of the gastric mucosa. [provided by RefSeq, Dec 2015]. Publication Note: This RefSeq record includes a subset of the publications that are available for this gene. Please see the Gene record to access additional publications. ##Evidence-Data-START## Transcript exon combination :: AF494509.2, ERR279832.1826.1 [ECO:0000332] RNAseq introns :: single sample supports all introns SAMEA2142586, SAMEA2147920 [ECO:0000348] ##Evidence-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 1..184 /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxon:9606" /chromosome="2" /map="2p13.3" Protein 1..184 /product="gastrokine-2 precursor" /note="down-regulated in gastric cancer GDDR; blottin; trefoil factor interactions(z) 1; BRICHOS domain containing 1B" /calculated_mol_wt=18318 sig_peptide 1..20 /inference="COORDINATES: ab initio prediction:SignalP:4.0" /calculated_mol_wt=2187 Region 54..150 /region_name="BRICHOS" /note="The BRICHOS domain is found in a variety of proteins implicated in dementia, respiratory distress and cancer; smart01039" /db_xref="CDD:198107" CDS 1..184 /gene="GKN2" /gene_synonym="BRICD1B; GDDR; PRO813; TFIZ1; VLTI465" /coded_by="NM_182536.2:110..664" /db_xref="CCDS:CCDS33215.1" /db_xref="GeneID:200504" /db_xref="HGNC:HGNC:24588" ORIGIN 1 mkilvaflvv ltifgiqshg yevfniisps nnggnvqetv tidnekntai inihagscss 61 ttifdykhgy iasrvlsrra cfilkmdhqn ipplnnlqwy iyekqaldnm fsskytwvky 121 npleslikdv dwfllgspie klckhiplyk gevventhnv gaggcakagl lgilgisica 181 dihv //
Muistiin 10.11.2018
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar