MUC3B havaitaan. (7q22.1)

MUC3  Gene 7q22.1.

MUC3A ja MUC3B-geenien löytövaiheesta

MUC3B (7q22)  

Official Symbol  MUC3 Bprovided by HGNC
Official Full Name   mucin 3B, cell surface associated   provided by HGNC
Also known as  MUC3; MUC3A Annotation information not in current annotation release. Preferred Names   mucin-3B Names   MUC-3B, intestinal mucin  MUC3B, intestinal mucin-3B
 

 2003

Initiation of transcription of the MUC3A human intestinal mucin from a TATA-less promoter and comparison with the MUC3B amino terminus. Gum JR Jr, et al. J Biol Chem, 2003 Dec 5. PMID 1295831..

Human intestinal mucin genes MUC3A and MUC3B are members of a membrane mucin gene family residing at chromosome 7q22. In this paper, we utilized genomic and cDNA cloning to elucidate the sequence of the 5'-region of the MUC3A gene including the gene promoter and the amino terminus coding sequence. Following its 21-residue signal peptide, the amino terminus of the mucin consists of a 233-residue Thr-, Ser-, and Pro-rich nonrepetitive sequence that is contiguous with its hypervariable domain of 375-residue repeats. RNase protection analysis and 5'-GeneRacer PCR indicated that MUC3A gene transcripts initiate from multiple start sites along a region spanning approximately 180 bases. The 5'-flanking region of the gene had promoter activity when fused to a luciferase reporter gene in all of the tested cell lines. This region contained binding sites for several transcription factors, including those implicated in the regulation of intestinal genes, but lacked a cognate TATA box. These features of the gene promoter may enable the gene to be expressed at variable levels in several cell types with different repertoires of transcription factors. We also utilized 5'-GeneRacer PCR to determine the sequence of the 5'-terminus of the MUC3B message. The amino termini of the MUC3A and MUC3B mucins are 91% conserved at the amino acid level. Thus, MUC3A and MUC3B have highly conserved amino and carboxyl termini, suggesting a recent duplication of the entire ancestral gene. It remains to be determined whether other members of the 7q22 membrane mucin gene family have amino-terminal domains similar to MUC3A and MUC3B.

(Finnish)

 Ihmisen suoliston MUC3A ja MUC3B geenit ovat musiinigeeniperheen jäseniä ja sijaitsevat kromosomissa 7q22. Tutkijat selvittivät MUC3A-geenin 5´-alueen sekvenssin sekä geenipromoottorin ja N-terminaalia koodaavan sekvenssin. Signaalipeptidin pituus on 21 aminohappoa. Sen jälkeen seuraa musiinin N-terminaali, jossa on 233 aminohappoa , runsaasti treoniineja, seriineja ja proliineja ei-toistuvassa järjestyksessä, ja sitten tuli 375- aminohapon hypervariabeli domeeni. MUC3A geenin transkriptit alkoivat monista alkukohdista noin 180 emäsparin laajuiselta alueelta . 5´-päädyn viereisissä kohdissa oli promoottoriaktiivisuus. Alue käsitti sitoutumiskohtia useille transkriptiotekijöille mukaanluettuna niitä, jotka osallistuvat suolistogeenien säätelyyn, mutta joista puuttuu vastaavat TATA-boksit. Tämä geenipromoottorin piirre tehnee geenin kykeneväksi ilmentymään vaihtelevan tasoisesti useissa solutyypeissä erilaisin transkriptiofaktorirepertuaarein. Selvitettiin myös MUC3B:n 5´-terminaalisen sanoman sekvenssi.

MUC3A ja MUC3B-musiinien aminoterminaalit ovat 91%.sti konservoituja aminohappotasossaan. Täten MUC3A ja MUC3B omaavat hyvin konservoituneet N-terminaalit ja

C-terminaalit , mikä viittaisi koko esigeenin äskettäiseen duplikaatioon. On vielä määrittämättä, omaavatko toiset 7q22-kalvomusiinigeeniperheen jäsenet samanlaiset aminoterminaaliset domeenit kuin MUC3A ja MUC3B.

2001

Associations of distinct variants of the intestinal mucin gene MUC3A with ulcerative colitis and Crohn's disease. Kyo K, et al. J Hum Genet, 2001. PMID 11289722

Ulcerative colitis (UC) and Crohn's disease (CD), the major forms of inflammatory bowel diseases (IBDs). are multifactorial disorders of unknown etiology. We reported a possible association of rare variable number of tandem repeat (VNTR) alleles of the "MUC3" gene with a susceptibility to UC. However, an entire structure of "MUC3" is still unknown because the long stretches of tandem repeats in this "gene" make its cloning extraordinarily difficult. In this study, we report evidence that "MUC3" consists of two genes, MUC3A and MUC3B, both of which encode membrane-bound mucins with two epidermal growth factor(EGF)-like motifs, and we describe the complete 3'-terminal structures of these two genes. We have also analyzed the single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the exonic sequences of the 3' portions of these two genes to investigate whether sequence variations in these regions can cause person-to-person differences in the susceptibility to IBDs, and report here that non-synonymous SNPs of MUC3A, involving a tyrosine (Y)  residue with a proposed role in cell signaling, may confer genetic predisposition to CD  (P = 0.0132). Our findings suggest that variants of MUC3A may be involved in the occurrence of UC and CD in distinct manners.

(Finnish)

 Haavainen paksunsuolentulehdus (UC) ja Crohnin tauti ovat tulehduksellisten suolisotautien päämuotoja ja ne ovat monitekijäisiä häriöitä, joiden etiologia on tuntematon. Tutkijat raportoivat erään mahdollisen assosiaation MUC3-geenialleelien harvinaisen toistojaksoluvun (VNTR) ja ulseratiivisen koliitin (UC) kesken. Mutta koko MUC3- geenin rakennekin oli vielä 2001 tuntematon, koska pitkät pätkät toistojaksoja tässä geenissä tekivät sen kloonaamisen erittäin vaikeaksi.

Tässä artikkelissa tutkijat raportoivat , että ”MUC3” geeni on itseasiassa kaksi geeniä MUC3A ja MUC3B, joista molemmat koodaavat kalvoonsitoutunutta musiinia, joilla molemmilla on kaksi epidermaalisen kasvutekijän (EGF) motiivia rakenteessaan.

 Lisäksi he kuvaavat molemmista geeneistä 3´ -terminaalisen rakenteen ( 3´. Lue: kolme-prim päädyn).

He analysoivat myös yksittäisiä nukleotidipolymorfioita (SNP) geenien 3´-osuuden exonisekvensseistä. He halusivat selvittää, voisivatko näiden alueiden sekvenssivariaatiot aiheuttaa henkilöiden keskeisiä eroja alttiudessa tulehduksellisille suolistotaudeille (IBD) . He raportoivat eräästä tyrosiinia koskevasta pistemutaatiosta MUC3A:ssa. Tällä tyrosiinilla (Y) arvellaaan olevan osuutta solusignaloinnissa; mutaatio siinä saattaa johtaa geneettiseen alttiuteen Crohnin taudille. Löydöt viitaavat siihen, että MUC3A-variantit voivat olla osallisia ulseratiivisessa koliitissa (UC) ja Crohnin taudissa (CD) erotettavin tavoin. 

2000
 

Multiple transcripts of MUC3: evidence for two genes, MUC3A and MUC3B. Pratt WS, et al. Biochem Biophys Res Commun, 2000 Sep 7. PMID 1097382
The MUC3 gene encodes a transmembrane mucin-type glycoprotein. A number of consistent single nucleotide changes were observed in different MUC3 cDNAs from a single individual, suggesting the presence of at least three different transcripts per individual. This transcript heterogeneity is due both to the existence of a second copy of the MUC3 gene and to allelic changes. Sequencing of the second MUC3 shows that it has the same C-terminal domain and intron/exon structure as the previously described MUC3. The tandem repeat domain has the same amino acid consensus sequence but shows more substitutions. The unique exonic sequences range from 94 to 100% identity at the nucleotide level and correspondingly few amino acid changes have been identified. The introns show around 95% identity. We propose to name this second gene MUC3B, MUC3A being reserved for the first MUC3 gene. MUC3B, like MUC3A, is expressed in intestine and Caco-2 cells.

MUC3- geeni koodaa musiinityyppistä transmembraanista glykoproteiinia . Yksittäiseltä henkilöltä oli havaittavissa lukuisia konsistentteja yhden nukleotidin vaihtumisia MUC3 :tä koodaavassa DNA.ssa cDNA. Saatiin viitettä vähintäin kolmen erilaisen transkriptin esiintymisestä yksittäisessä yksilössä. Tämä transkriptien heterogeenisyys johtuu sekä toisen MUC3-geenikopion olemassaolosta että alleelivaihtumisista. Toisen MUC3:n sekvensoiminen osoittaa, että sillä on sama C-terminaalinen domeeni ja introni/extroni-rakenne kuin edellä kuvatulla MUC3:lla. Toistojakso (TR)- domeeni omaa myös samaa aminohappokonsensusta, mutta susbtituutioita näyttää olevan enemmän. Ainutlaatuiset exonisekvenssien ovat vaihtelultaan 94% - 100% :n identtisiä nukleotiditasossa ja vastaavasti on havaittu vain harvoja aminohappovaihteluita . Intronit ovat 95%:n identtiset. 

Tutkijat ehdottavat toiselle geenille nimen MUC3B ja säilyttäisivät ensimmäsielle geenille nimen MUC3A. MUC3B kuten MUC3A ilmenee suolistossa ja Caco-2-soluissa (colorektaali adenocarsinoomasolulinja) .

  1997

MUC3 human intestinal mucin. Analysis of gene structure, the carboxyl terminus, and a novel upstream repetitive region. Gum JR Jr, et al. J Biol Chem, 1997 Oct 17. PMID 9334251 

Tämä artikkeli kuvaa MUC3 C-terminaalin selvitelyä.

Muistiin 4.11. 2018