- MUC5AC. Kllo 15:10
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/4586
- Geeni tunnetaan myös nimella TBM, trakeobronkiaalinen musiini, leB, MUC5 ja musiini. Ilmentymä on rajoittunut mahalaukkuun.
- Proteiinin ensisijainen nimi on musiini-5AC, mutta sillä on muina niminä
- gastrinen musiini,
- lewis B veriryhmäantigeeni,
- hengitysteitten pääglykoproteiineja, major airway glyckoprotein,
- musiini 5, alatyypit A ja C, trakeobronkiaalinen/gastrinen
-
Expression Restricted expression toward stomach (RPKM 226.0).
Preferred Names mucin-5AC
Names
gastric mucin
lewis B blood group antigen
major airway glycoprotein
mucin 5, subtypes A and C, tracheobronchial/gastric
mucin 5AC, oligomeric mucus/gel-forming pseudogene
mucin-5 subtype AC, tracheobronchial
tracheobronchial mucin
- (Finnish) Tietoja rakenteesta
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_001291288.1
- Konservoituneissa domeeneissa mainitaan CT,
- terminaalinen kystiinisolmunkaltainen kohta (CTCK),
- VWD, von Willebrand-faktorin D-tyypin domeeni ,
- C8- domeeni jossa on kahdeksan konservoitua kysteiiniä,
- TIL- domeeni joka on trypsiini-inhibiittorin kaltainen kysteiinipitoinen domeeni,
- toinen C8 - domeeni sekä
- musiini2proteiinin WxxW- toistodomeeni
-
- Conserved Domains (6) summary
-
The domain is non-globular and little is conserved among these presumed homologues except for their cysteine residues. CT domains are predicted to form homodimers.
Location:5534 → 5616 -
CT; C-terminal cystine knot-like domain
(CTCK)
-
Von Willebrand factor contains several type D domains: D1 and D2 are present within the N-terminal propeptide whereas the remaining D domains are required for multimerisation.
-
Location:4911 → 5079
-
VWD; von Willebrand factor (vWF) type D
domain
-
smart00832
Location:624 → 694 -
C8; This domain contains 8 conserved cysteine residues
-
Not all of the conserved cysteines have been
included in the alignment model. It is found in disease-related
proteins including von Willebrand factor, Alpha tectorin, Zonadhesin
and Mucin.
-
pfam01826
Location:338 → 394 -
TIL; Trypsin Inhibitor like cysteine rich domain
-
This family contains trypsin inhibitors as well as
a domain found in many extracellular proteins. The domain typically
contains ten cysteine residues that form five disulphide bonds. The
cysteine residues that form the disulphide bonds are 1-7, 2-6, 3-5,
4-10 and 8-9.
-
pfam08742
Location:265 → 334 -
C8; C8 domain
-
pfam13330
Location:1389 → 1475 -
Mucin2_WxxW; Mucin-2 protein WxxW repeating region. This
family is repeating region found on mucins 2 and 5. The
function is not known, but the repeat can be present in
up to 32 copies, as in a member from Branchiostoma floridae. The
region carries a highly conserved WxxW sequence motif and also has
at least six well conserved cysteine residues.
- Mitä tämän proteiinin löytymishistoriaan kuuluu?
- (Finnish): 2018 Referenssi 1.
- kertoo uusinta tietoa Helikobakteeri pyloriin virulenssitekijän CagA ja ammoniumjonin vaikutuksesta musiineihin AGS-soluissa, joissa säätyy ylös MUC5AC, MUC2 ja MUC5B ilmenemiset, mutta beta-kadheriinin eikä MUC6 -geenin ilmenemät eivät vaikuttuneet.
REFERENCE 1 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Zhang X, Shi D, Liu YP, Chen WJ and Wu D.
TITLE Effects of the Helicobacter pylori Virulence Factor CagA and
Ammonium Ion on Mucins in AGS Cells
JOURNAL Yonsei Med. J. 59 (5), 633-642 (2018) PUBMED 29869461
REMARK GeneRIF: Helicobacter pylori (H. pylori)-CagA significantly
upregulated MUC5AC, MUC2, and MUC5B expression in AGS cells, but
did not affect E-cadherin and MUC6 expression.
- (Finnish): 2018 Referenssi 2
- on myös tuoreista tutkimuksista:
- Munc134 välittää ihmisen neutrofiilielastaasin ( hNE) indusoiman hengitystiemusiinin MUC5AC hypersekretiota tekemällä interaktion syntaksiini2:n kanssa. Munc134 saattaa olla basaalisen MUC5AC-eksosytoosin essentielli säätelijä, kun taas Munc134 näyttää olevan puolestaan Munc13-proteiinin alatyyppi ja saattaa olla herkkä hNE-stimulaatiolle hengitysteiden MUC5AC-hypersekretion aikana.
- (Tärkeä lisätieto munc134- proteiinista ja sen merkityksestä,varsinkin sen muutaation merkityksestä luonnollisessa immuunivasteessa esim viruksia vastaan https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14622600 . tästä asiasta kirjoitan suomennosta Uutta viruksista blogiin: HLH)
2 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Xu R, Zhou J, Zhou XD, Li Q, Perelman JM and Kolosov VP.
TITLE Munc134 mediates human neutrophil elastase induced airway mucin5AC
hypersecretion by interacting with syntaxin2
JOURNAL Mol Med Rep 18 (1), 1015-1024 (2018)
PUBMED 29767240
REMARK GeneRIF: The results of the present study indicate that Munc132 may
be an essential regulator of basal MUC5AC exocytosis, while Munc134
appears to be a Munc13 protein subtype that may to be sensitive to
hNE stimulation during airway MUC5AC hypersecretion.
- (Finnish): 2018 Referenssi 3
- kertoo myös tämän vuoden tuoreesta tiedosta, jossa keskitytään haimasyöpäasiaan: On saatu analysoitu MUC5AC ja MUC1- musiinien epitooppi: sialyl -Lewis x haimasyöpäkudoksista. Tutkijat ovat selvittäneet kasvannaiseen assosioituvia antigeenejä SLeX ja STn haiman adenokarsinoomakudoksen musiineista 5AC ja C1. Yhteenvedossa mainitaan ,että MUC5AC-SLe(x) saattaisi toimia biomerkitsijänä, koska sen glykoformia esiintyy haiman adenokarsinoomassa (PDAC).
REFERENCE 3 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Balmana M, Duran A, Gomes C, Llop E, Lopez-Martos R, Ortiz MR,
Barrabes S, Reis CA and Peracaula R.
TITLE Analysis of sialyl-Lewis x on MUC5AC and MUC1 mucins in pancreatic
cancer tissues
JOURNAL Int. J. Biol. Macromol. 112, 33-45 (2018)
PUBMED 29408556
REMARK GeneRIF: We have analysed the tumour-associated carbohydrate
antigens sialyl-Lewis x (SLe(x)) and sialyl-Tn (STn) on MUC1 and
MUC5AC in Pancreatic adenocarcinoma (PDAC)tissues.
immunoprecipitation of MUC5AC from positive PDAC tissues and
subsequent SLe(x) immunodetection confirmed the presence of SLe(x)
on MUC5AC. Altogether, MUC5AC-SLe(x) glycoform is present in PDAC
and can be regarded as potential biomarker.
- (Finnish): 2018 Referenssi 4
- edelleen on vuoden tuoretta artikkelia. Resistiini säätää ylös MUC5AC/B musiinigeenien ilmenemän ihmisen hengitysteiden epiteliaalisissa soluissa. Erilaisten signaaliteitten kautta resistiini indusoi MUC5 geenien ylössäätymisen hengitysteitten epiteelisoluissa.
REFERENCE 4 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Kwak S, Kim YD, Na HG, Bae CH, Song SY and Choi YS.
TITLE Resistin upregulates MUC5AC/B mucin gene expression in human airway
epithelial cells
JOURNAL Biochem. Biophys. Res. Commun. 499 (3), 655-661 (2018)
PUBMED 29604272
REMARK GeneRIF: resistin induced MUC5AC and MUC5B expression via
activation of different signaling pathways in human airway
epithelial cells.
- (Finnish): 2018 Referenssi 5
- on vielä tältä vuodelta. Sinkin puute aiheuttaa kystiseen fibroosiin assosioituvan MUC5AC-musiinin hypersekretion ilmateiden epiteelisoluissa ja tämä tapahtuu sinkin sisäänkuljettajan ZIP2/SLC38A2 pleissauksen vaihteesta. Pleissauksen vaihde DeltaC-Zip -muotoon ja muiden ZIP-ilmenemien vähenemä aiheuttaa sinkkivajetta, mikä riittää indusoimaan MUC5AC:n
REFERENCE 5 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Kamei S, Fujikawa H, Nohara H, Ueno-Shuto K, Maruta K, Nakashima R,
Kawakami T, Matsumoto C, Sakaguchi Y, Ono T, Suico MA, Boucher RC,
Gruenert DC, Takeo T, Nakagata N, Li JD, Kai H and Shuto T.
TITLE Zinc Deficiency via a Splice Switch in Zinc Importer ZIP2/SLC39A2
Causes Cystic Fibrosis-Associated MUC5AC Hypersecretion in Airway
Epithelial Cells .
JOURNAL EBioMedicine 27, 304-316 (2018)
PUBMED 29289532
REMARK GeneRIF: the splice switch to DeltaC-ZIP2 as well as decreased
expression of other ZIPs caused zinc deficiency, which is
sufficient for induction of MUC5AC.
- (Finnish): 1998 Referenssi 6 .
- Artikkeli 20 vuoden takaa. Isojen lähettiRNA-molekyylien analyysitekniikka oli parantunut ja nyt pystyttiin analysoimaan ihmisen musiinigeenit MUC2, MUC3, MUC4, MUC5AC, MUC5B ja MUC6. ja todettiin, että niiden ilmenemä on stabiilia ja niiden mRNA valtavan suuri ja niissä ilmenee vaihtelevaa pituuspolymorfiaa.
REFERENCE 6 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Debailleul V, Laine A, Huet G, Mathon P, d'Hooghe MC, Aubert JP and
Porchet N.
TITLE Human mucin genes MUC2, MUC3, MUC4, MUC5AC, MUC5B, and MUC6 express
stable and extremely large mRNAs and exhibit a variable length
polymorphism. An improved method to analyze large mRNAs
JOURNAL J. Biol. Chem. 273 (2), 881-890 (1998)
PUBMED 9422745
- (Finnish) : 1995 Referenssi 7.
- Gastrisen musiinin komplementaarisen DNA:n ilmenemän kloonausta ja musiinigeenin ilmenemän lokalisoitumista.
REFERENCE 7 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Ho SB, Roberton AM, Shekels LL, Lyftogt CT, Niehans GA and Toribara
NW.
TITLE Expression cloning of gastric mucin complementary DNA and
localization of mucin gene expression
JOURNAL Gastroenterology 109 (3), 735-747 (1995)
PUBMED 7657101
- (Finnish): 1995 Referenssi 8.
- Luonnehditaan musiinin cDNA-klooni, joka on eristetty HT-29 musiinia erittävistä soluista. Tämä 3´ (kolme prim ) pääty on ehkä MUC5AC(?).
REFERENCE 8 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Lesuffleur T, Roche F, Hill AS, Lacasa M, Fox M, Swallow DM,
Zweibaum A and Real FX.
TITLE Characterization of a mucin cDNA clone isolated from HT-29
mucus-secreting cells. The 3' end of MUC5AC?
JOURNAL J. Biol. Chem. 270 (23), 13665-13673 (1995)
- (Finnish): 1995 Referenssi 9.
- Karakterisoidaan ihmisen musiinigeeni MUC5AC. Konsensus kysteiinipitoisesta domeenista 11p15-musiinigeeneissä?
REFERENCE 9 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Guyonnet Duperat V, Audie JP, Debailleul V, Laine A, Buisine MP,
Galiegue-Zouitina S, Pigny P, Degand P, Aubert JP and Porchet N.
TITLE Characterization of the human mucin gene MUC5AC: a consensus
cysteine-rich domain for 11p15 mucin genes?
JOURNAL Biochem. J. 305 (Pt 1), 211-219 (1995)
PUBMED 7826332
- (Finnish): 1994 Referenssi 10.
- On saatu kloonattua ja analysoitua cDNA, joka koodaa erästä suurta hengitysteiden glykoproteiinia, ihmisen trakeobronkiaalista musiinia (MUC5)
REFERENCE 10 (residues 1 to 5654)
AUTHORS Meezaman D, Charles P, Daskal E, Polymeropoulos MH, Martin BM and
Rose MC.
TITLE Cloning and analysis of cDNA encoding a major airway glycoprotein,
human tracheobronchial mucin (MUC5)
JOURNAL J. Biol. Chem. 269 (17), 12932-12939 (1994)
PUBMED 7513696
- (Finnish) Sitten seuraa peptidin rakenne, josta saa tarkempaa tietoa linkistä alla. Tässä peptidissä on 5654 aminohappoa. Tämä on musiini 5AC -prekursorin rakennetta.
FEATURES Location/Qualifiers source 1..5654 /organism="Homo sapiens" /db_xref="taxon:9606" /chromosome="11" /map="11p15.5" Protein 1..5654 /product="mucin-5AC precursor" /note="mucin 5, subtypes A and C, tracheobronchial/gastric; tracheobronchial mucin; gastric mucin; major airway glycoprotein; lewis B blood group antigen; mucin-5 subtype AC, tracheobronchial; mucin 5AC, oligomeric mucus/gel-forming pseudogene" /calculated_mol_wt=582674
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_001291288.1
- Muistiin 5.11. 2018, 15:12
-
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar