Leta i den här bloggen


tisdag 9 juli 2019

ZBED3 (5q13.3), BED. domeenin omaava ZNF, axiinin kanssa inrteraktion tekevä proteiini,

 https://www.genenames.org/data/genegroup/#!/group/64

BED ZNF rakenne peruskaava   C-x-C-x-H-x-H.

(Suomennosta) tämä ZBED3-geeni kuuluu siihen geeniluokkaan, joka muodostui  humaani AT DNA transpositiosta ja koodaa säätelyllisiä proteiineja. Tämä geeni on säätynyt ylös keuhkosyöpäkudoksessa, jossa  koodautunut proteiini aiheuttaa beta-kateniinin akkumuloitumista ja  vauhdittaa keuhkosyöpäsolun invasoitumista,  joten tämä geeni  on otettava huomioon.
 Lisäksi geenin koodaamaa  proteiinia voi erittyä ja se osallistuu insuliiniresistenssiin. Geeniä ilmenee rasvakudoksessa  ja munuaisessa eniten.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/84327
Official Symbol
ZBED3
Official Full Name
zinc finger BED-type containing 3
Summary: This gene belongs to a class of genes that arose through hAT DNA transposition and that encode regulatory proteins. This gene is upregulated in lung cancer tissues, where the encoded protein causes an accumulation of beta-catenin and enhanced lung cancer cell invasion. In addition, the encoded protein can be secreted and be involved in resistance to insulin. [provided by RefSeq, Jul 2016]
Expression Ubiquitous expression in fat (RPKM 5.0), kidney (RPKM 4.8) and 25 other tissues See more Orthologs  mouse all.
Preferred Names
zinc finger BED domain-containing protein 3
Names
2610005H11Rik
axin-interacting protein
zinc finger, BED domain containing 3
NM_001329564.2NP_001316493.1  zinc finger BED domain-containing protein 3
Conserved Domains (1) summary
smart00614
Location:47100
ZnF_BED; BED zinc finger
  DNA-binding domain in chromatin-boundary-element-binding proteins and transposases

ORIGIN      
        1 mrsgepactm dqarglddaa arggqcpglg paptptppgr lgapyseawg yfHlapgrpg
       61 HpsgHwatCr lCgeqvgrgp gfHagtsalw rHlrsaHrre lessgagssp paapcppppg
      121 paaapegdwa rlleqmgala vrgsrrerel errelaveqg eralerrrra lqeeeraaaq
      181 arrelqaere alqarlrdvs rregalgwap aappplkddp egdrdgcvit kvll
//


x6-H-x7-H-x3-H-x3-C-xx-C-x10-H- x8-H-x4-H-x3
Related articles in PubMed

(Suom.  1). Ihmisen synoviaalinesteen  mesenkymaalisissa  kantasoluissa indusoituu  ruston muodostus  eli  chondrogeneesi  lncRNA ZBED3-AS1 vaikutuksesta  ( ZBED3 geenin pitkän ei-koodaavan RNA:n antisense-1 johdannaisen  vaikutuksesta). Ihmisen synoviaalinesteestä (SF) peräisin olevat  mesenkymaalit kantasolut (MSC)   (SFMSC) omaavat   erinomaisen kyvyn  ruston induktioon ja ne ovat lupaava  soluperusteinen strategia  nivelruston korjaamiseen. Monet pitkät ei-koodaavat RNA:t (lncRNA)  säätelevät  mesenkymaalisten  kantasolujen kondrogeneesiä. Tutkijat tekivät oletuksen, että  divergoituva   lncRNA ZBED-AS1, joka kiinnittyy paikallisesti  kromatiiniin, voisi edistää zbed3;  ilmentymistä, mikä  on uusi axiinin kanssa interaktion tekevä proteiini, joka  aktivoi  kondrogeneesiin kuuluvaa Wnt/beta-kateniini-signalointia  Kuitenkaan ei  ollut aiemmin tiedossa, miten ZBED-AS1- toimisi  SFMSC-soluissa. Tutkijat  saivat selville, että ZBED-AS1 edistää kondrogeneesiä ja saattoi   suoraan lisätä zbed3 ilmentymistä .
 Wnt-estäjä DKK1  pystyi  poistamaan ZBED3-AS1:n  kondrogeneesiä stimuloivan vaikutuksen  Täten voitiin osoittaa uuden lncRNA:nm  ZBED-AS1,   osuus  SFMSC-kondrogeneesissä  ja näin saatetaan  parantaa osteoartriitin hoitoa.
 
 
 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar