Leta i den här bloggen


tisdag 9 juli 2019

KDM2A (CXXC2) on H3K79 -demetylaasi ja indusoi SIRT1 välitteisen hiljennyksen ja transkription repression (2018)

Tämä histonidemetylaasi  ( di -ja trimetylaasi)  pystyy poistamaan kaksi  tai kolme metyyliä histoneista H3K79 ja H3K36.
Tämä CXXC2 eli KDM2B pystyy hiljentämään  transkriptiota HOXA7 ja MEIS1 geeneistä demetylaatiokyvyillään. Jos tämä  CXXC2 poistetaan solusta, metyylien poisto  vähenee ,
Jos taas tehdään vakaa poistogeenisyys  ja KDM2B vaikutus jää kokonaan pois, irtoaa myös hileentäjä  (deasetylaasi)    Sirtuiini1  kromatiinilta ( Se on  NAD+.sta riippuva) . Silloin histoni H3K79  metyloituu ja histoni H4K16 asetyloituu.   ( transkriptio tietysti  aktivoituu) Tämä tutkimus assosioi KDM2B (CXXC2):n  demetyloivan  toiminnan SIRT1- välitteiseen kromatiinin hiljentämiuseen. 

2018 Oct;32(10):5737-5750. doi: 10.1096/fj.201800242R. Epub 2018 May 15.

KDM2B is a histone H3K79 demethylase and induces transcriptional repression via sirtuin-1-mediated chromatin silencing.

The methylation of histone H3 lysine 79 (H3K79) is an active chromatin marker and is prominent in actively transcribed regions of the genome;
 however, demethylase of H3K79 remains unknown despite intensive research.

 Here, we show that KDM2B (CXXC2 ) also known as FBXL10 and a member of the Jumonji C family of proteins (JHDM1B) known for its histone H3K36 demethylase activity, is a di- and trimethyl H3K79 demethylase. We demonstrate that KDM2B induces transcriptional repression of HOXA7 and MEIS1 via occupancy of promoters and demethylation of H3K79. Furthermore, genome-wide analysis suggests that H3K79 methylation levels increase when KDM2B is depleted, which indicates that KDM2B functions as an H3K79 demethylase in vivo.
 Finally, stable KDM2B-knockdown cell lines exhibit displacement of NAD+-dependent deacetylase sirtuin-1 (SIRT1) from chromatin, with concomitant increases in H3K79 methylation and H4K16 acetylation. Our findings identify KDM2B as an H3K79 demethylase and link its function to transcriptional repression via SIRT1-mediated chromatin silencing.-Kang, J.-Y., Kim, J.-Y., Kim, K.-B., Park, J. W., Cho, H., Hahm, J. Y., Chae, Y.-C., Kim, D., Kook, H., Rhee, S., Ha, N.-C., Seo, S.-B. KDM2B is a histone H3K79 demethylase and induces transcriptional repression via sirtuin-1-mediated chromatin silencing.
KEYWORDS:
H3K79 methylation; SIRT1; histone demethylase; transcription PMID: 29763382 DOI:10.1096/fj.201800242R [Indexed for MEDLINE]

Kommentti: Haen yhteyttä  ! CXXC2 ja CXXC8 ,  Wnt, Sirtuiini , kromatiinin hiljennys" ;  Nämä CXXC sinkkisormiset ovat molemmat lysiini metyylitransferaasi 2 lajeja A/B.  Joista ei  erityisesti mainita  vaikutusta Wnt signalointiin  pubmed yleiskappaleessa, ehkä siksi että kromatiinin  hiljennys vaikutuksessa on mukana sirtuiinitkin ( soluenergiarippuvuus).

KDM2A/B , Wnt signaling 

Lu L, Gao Y, Zhang Z, Cao Q, Zhang X, Zou J, Cao Y.
Dev Cell. 2015 Jun 22;33(6):660-74. doi: 10.1016/j.devcel.2015.04.006. Epub 2015 May 21.PMID:

Best matches for Wnt signaling, Sirtuin:


Kommenttejani: 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar