TRIML1 (Kr.4q35.1),RNF209.

Tällä TRIML1  proteiinilla on E3-ubikitiini-proteiiniligaasin kaltaisuutta. Sen funktiota ei ole määritelty. Ortologisella hiiren proteiinilla   on havaittu sitoutumista ubikitiinispesifiseen proteaasiin 5 (USP5) ja se osallistuu blastokystikehitysvaiheeseen. Sitä esiintyy rajoitetusti vain testiksessä.

TRIML1 proteiinissa on 468 aminohappoa. Rakenteestä on havaittu  130-184 kohdasa NDUFB10, NADH-ubikitiini oxidoreduktaasin alayksikkö 10. 
Kohdassa 16-56 on N-terminaalinen   Zf-C3HC4_N, Zinc finger C3H4-tyyppinen  RING struktuuri.
Kohdassa  287-462 SPRY-PRY-C-1 .
 Samanlaista  PRY/SPRY domeenia on lukuisissa TRIM-proteiineissa (5,6,7,10,11,17,20,21,27,35,38,41,50,58,60,62,69,72 ).
(CIV alaluokan Bromodomeeni  B30.2 on toiselta nimeltä  PRYSPRY).
Alla on TRIML1  peptidijärjesteys ja siinä on merkattu CC kohdat ( Coiled coil).

Tähän yhteyteen PubMed esittää ylistaä  ubikitinaation alueelta. 

Related articles in PubMed

1. Characterization and potential function of a novel pre-implantation embryo-specific RING finger protein: TRIML1. Tian L, et al. Mol Rep
   

• od Dev, 2009 Jul. PMID 19156909

• Citalopram and escitalopram plasma drug and metabolite concentrations: genome-wide associations. Ji Y, et al. Br J Clin Pharmacol, 2014 Aug. PMID 24528284, Free PMC Article

• Systematic analysis of dimeric E3-RING interactions reveals increased combinatorial complexity in human ubiquitination networks. Woodsmith J, et al. Mol Cell Proteomics, 2012 Jul. PMID 22493164, Free PMC Article

• Interactions of pathological hallmark proteins: tubulin polymerization promoting protein/p25, beta-amyloid, and alpha-synuclein. Oláh J, et al. J Biol Chem, 2011 Sep 30. PMID 21832049, Free PMC Article

• Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Kimura K, et al. Genome Res, 2006 Jan.
  

TRIML1 Rakenteesta yksityiskohta Coiled Coil (133-158) ja (184-237)

• https://www.uniprot.org/blast/?about=Q8N9V2[184-237]&key=Coiled%20coil
  
• PMID 16344560, Free PMC Article
         10                    20                  30                  40                  50
  

MSTADLMENL REELTCFICL DYFSSPVTTE CGHSFCLVCL LRSWEEHNTP 
        60         70         80         90        100
LSCPECWRTL EGPHFQSNER LGRLASIARQ LRSQVLQSED EQGSYGRMPT 
       110        120        130        140        150
TAKALSDDEQ GGSAFVAQSH GANRVHLSSE AEEHHREKLQ EILNLLRVRR 
       160        170        180        190        200
KEAQAVLTHE KERVKLCQEE TKTCKQVVVS EYM KMHQFLK EEEQLQLQLL 
       210        220        230        240        250
EQEEKENMRK LRNNEIKLTQ QIRSLSKMIA QIESSSQSSA FESLEEVRGA 
       260        270        280        290        300
LERSEPLLLQ CPEATTTELS LCRITGMKEM LRKFSTEITL DPATANAYLV 
       310        320        330        340        350
LSEDLKSVKY GGSRQQLPDN PERFDQSATV LGTQIFTSGR HYWEVEVGNK 
       360        370        380        390        400
TEWEVGICKD SVSRKGNLPK PPGDLFSLIG LKIGDDYSLW VSSPLKGQHV 
       410        420        430        440        450
REPVCKVGVF LDYESGHIAF YNGTDESLIY SFPQASFQEA LRPIFSPCLP 
       460 
NEGTNTDPLT ICSLNSHV