USP41 (22q11.21) ubikitiinispesifinen peptidaasi 41 (DUB perhettä)

USP41, (22q11.21) Ubikitiinispesifinen proteaasi 41.

Tästä geenistä ja proteiinista on niukasti tietoa. Kuitenkin peptidisekvenssi on saatu ja kromosomisijainti. Se sijaitsee kromosomissa 22q11.21 , siis  juuri siinä jaksosssa, mikä on yleisesi tunnettu  deleetiokohta ja deletoituvan  kohdan proksimaalisen osan geenien joukossa se sijaitsee aika keskisesti, ( sen   lähellä on  ZNF proteiini ZNF74. Toinen DUB proteiini on aivan deleetioalueen kyljessä (USP18).
 Tähän 22q11.21 kohtaan on merkitään myös tärkeä UFD1, ubikitiiniä tunnistavan ERAD faktorin geeni ja UBE2L3 konjugaasin geeni) .

https://www.researchgate.net/figure/Genetic-landscape-of-the-human-22q112-region-The-typical-25-Mb-22q112DS-deletion_fig1_279232656



Peptide sequence:

putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41 [Homo sapiens]

NCBI Reference Sequence: XP_016884653.1
Identical Proteins FASTA Graphics

Go to:

LOCUS       XP_016884653             336 aa            linear   PRI 26-MAR-2018
DEFINITION  putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41 [Homo sapiens].
ACCESSION   XP_016884653
VERSION     XP_016884653.1
DBLINK      BioProject: PRJNA168
DBSOURCE    REFSEQ: accession XM_017029164.1
KEYWORDS    RefSeq; includes ab initio.
SOURCE      Homo sapiens (human)
  ORGANISM  Homo sapiens
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
            Catarrhini; Hominidae; Homo.
COMMENT     MODEL REFSEQ:  This record is predicted by automated computational
            analysis. This record is derived from a genomic sequence
            (NC_000022.11) annotated using gene prediction method: Gnomon,
            supported by EST evidence.
            Also see:
                Documentation of NCBI's Annotation Process
            
            ##Genome-Annotation-Data-START##
            Annotation Provider         :: NCBI
            Annotation Status           :: Full annotation
            Annotation Name             :: Homo sapiens Annotation Release 109
            Annotation Version          :: 109
            Annotation Pipeline         :: NCBI eukaryotic genome annotation
                                           pipeline
            Annotation Software Version :: 8.0
            Annotation Method           :: Best-placed RefSeq; Gnomon
            Features Annotated          :: Gene; mRNA; CDS; ncRNA
            ##Genome-Annotation-Data-END##
            
            ##RefSeq-Attributes-START##
            ab initio :: 9% of CDS bases
            ##RefSeq-Attributes-END##
            COMPLETENESS: full length.
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..336
                     /organism="Homo sapiens"
                     /db_xref="taxon:9606"
                     /chromosome="22"
     Protein         1..336
                     /product="putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
                     41"
                     /calculated_mol_wt=38732
     CDS             1..336
                     /gene="USP41"
                     /coded_by="XM_017029164.1:1..1011"
                     /db_xref="GeneID:373856"
                     /db_xref="HGNC:HGNC:20070"
ORIGIN      
        1 mdgvlfrahq cqyvhpcvhv yvtvglmdpl clvglhnigq tcclnsliqv fvmnvdfari
       61 lkritvprga deqrrsvpfq mllllekmqd srqkavwple layclqkynv plfvqhdaaq
      121 lylklwnlik dqiadvhlve rlqalymirm kdslicldca messrnssml tlrlsffdvd
      181 skplktleda lhcffqprel sskskcfcen cgkktrgkqv lklthlpqtl tihlmrfsir
      241 nsqtrkichs lyfpqsldfs qilpmkresc daeeqsggqy elfaviahvg madsghycvy
      301 irnavdgkwf cfndsniclv swediqctyg npnyhw
//