Artikkeli vuodelta 2003 Aivon kalvoista löytyi palmityloitunut RING finger ubikitiiniligaasi ja sen homologi.
Neurochem. 2003 Aug;86(3):749-62. A palmitoylated RING finger ubiquitin ligase and its homologue in the brain membranes.
Araki K1, Kawamura M, Suzuki T, Matsuda N, Kanbe D, Ishii K, Ichikawa T, Kumanishi T, Chiba T, Tanaka K, Nawa H. Abstract
SUOMENNOSTA:
Aktiivissa proteiiniaineenvaihdunnassa ja solunsisäisellä liikennöinnissä tapahtuu ubikitiiniligaatiota ja tämän funktion vikatoimintaa on useissa neurologisissa taudeissa. Jyrsijäaivosta tunnistettiin tämän vuosituhannen alussa kaksi uutta Ubikitiiniligaasia, Momo ja sakura, joissa oli kaksoissinkkisormi ja RING-finger domeeni Momo ilmentyi eniten aivojen harmaassa aineessa ja sakura taas enemmän aivojen valekassa aineessa ja kehon periferiassa. Molemmat proteiinit liittyivät solukalvoihin hermossoluissa ja/tai gliasoluissa. Tutkitatjas selvittivä niiden ubikitiiniligaasiaktiivisuuden . Kummankin yli-ilmenemä sinänsä kortikaalisissa aivokudosviljelmissä lisäsi polyubikitinaatiotasoja. Havaittiin , että reaktio vaati kombinaation Momo, UbcH4 ja H5c tai Sakura, Ubc4, Hc ja H6.
RING finger sijaitsi näissä molekyyleissä C-terminaalissa ja E3 ubikitiiniligaasiaktiivisuus riippui siitä . N-terminaali taas vaikutti kalvoon liittymisessä Sakuran liittymä kalvoon oli spesifisesti palmityloitu. Näiden ubikitiiniligaasien kohdemolekyylejä ei vielä 2003 tiedetty, mutta todettiin että oli löydetty eräs uusi palmityloitujen E3 ubikitiiniligaasien funktio.
- Ubiquitin (Ub) ligation is implicated in active protein metabolism and subcellular trafficking and its impairment is involved in various neurologic diseases. In rat brain, we identified two novel Ub ligases, Momo and Sakura, carrying double zinc finger motif and RING finger domain. Momo expression is enriched in the brain gray matter and testis, and Sakura expression is more widely detected in the brain white matter as well as in many peripheral organs. Both proteins associate with the cell membranes of neuronal and/or glial cells. We examined their Ub ligase activity in vivo and in vitro using viral expression vectors carrying myc-tagged Momo and Sakura. Overexpression of either Momo or Sakura in mixed cortical cultures increased total polyubiquitination levels. In vitro ubiquitination assay revealed that the combination of Momo and UbcH4 and H5c, or of Sakura and UbcH4, H5c and H6 is required for the reaction. Deletion mutagenesis suggested that the E3 Ub ligase activity of Momo and Sakura depended on their C-terminal domains containing RING finger structure, while their N-terminal domains influenced their membrane association. In agreement, Sakura associating with the membrane was specifically palmitoylated. Although the molecular targets of their Ub ligation remain to be identified, these findings imply a novel function of the palmitoylated E3 Ub ligase(s).
- PMID:
- 12859687
- "MOMO" on CARP-1, RNF34, RF1, RIF, hRFI Caspase -8 and -10 associated RING finger protein 1 .
- Amino acid sequence
- https://www.prospecbio.com/RNF34_HumanMGSSHHHHHH SSGLVPRGSH MGS MRKAGAT SMWASCCGLL NEVMGTGAVR GQQSAFAGAT GPFRFTPNPE FSTYPPAATE GPNIVCKACG LSFSVFRKKH VCCDCKKDFC SVCSVLQENL RRCSTCHLLQ ETAFQRPQLM RLKVKDLRQY LILRNIPIDT CREKEDLVDL VLCHHGLGSE DDMDTSSLNS SRSQTSSFFT RSFFSNYTAP SATMSSFQGE LMDGDQTSRS GVPAQVQSEI TSANTEDDDD DDDEDDDDEE ENAEDRNPGL SKERVRASLS DLSSLDDVEG MSVRQLKEIL ARNFVNYSGC CEKWELVEKV NRLYKENEEN QKSYGERLQL QDEEDDSLCR ICMDAVIDCV LLECGHMVTC TKCGKRMSEC PICRQYVVRA VHVFKS
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2587165/bin/nihms-50564-f0007.gif
- "SAKURA" on CARP-2, RNF189, RNF34L, FRING, RFFL, RIFIFYLIN, Caspase -8 and -10 associated RING protein2
https://www.researchgate.net/figure/Understanding-of-complex-prion-diseases-Identification-of-genes-and-genetic-markers_fig2_235393109
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar