Leta i den här bloggen


fredag 8 juni 2018

Kun löydettiin MOMO ja SAKURA

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12859687/
Artikkeli vuodelta 2003 Aivon  kalvoista löytyi palmityloitunut RING finger  ubikitiiniligaasi ja sen homologi.
 Neurochem. 2003 Aug;86(3):749-62. A palmitoylated RING finger ubiquitin ligase and its homologue in the brain membranes.
SUOMENNOSTA:  
Aktiivissa proteiiniaineenvaihdunnassa ja solunsisäisellä liikennöinnissä tapahtuu ubikitiiniligaatiota ja  tämän funktion  vikatoimintaa  on useissa neurologisissa taudeissa.  Jyrsijäaivosta tunnistettiin   tämän vuosituhannen alussa  kaksi uutta  Ubikitiiniligaasia, Momo ja sakura, joissa oli  kaksoissinkkisormi ja RING-finger domeeni Momo ilmentyi eniten aivojen harmaassa aineessa ja  sakura taas  enemmän aivojen valekassa aineessa ja kehon periferiassa. Molemmat proteiinit liittyivät solukalvoihin  hermossoluissa ja/tai gliasoluissa.  Tutkitatjas selvittivä niiden ubikitiiniligaasiaktiivisuuden .  Kummankin yli-ilmenemä sinänsä  kortikaalisissa aivokudosviljelmissä lisäsi polyubikitinaatiotasoja. Havaittiin , että reaktio vaati kombinaation  Momo,  UbcH4 ja H5c  tai Sakura,  Ubc4, Hc ja H6.
RING finger sijaitsi näissä molekyyleissä C-terminaalissa  ja   E3 ubikitiiniligaasiaktiivisuus  riippui siitä . N-terminaali taas vaikutti  kalvoon liittymisessä Sakuran liittymä  kalvoon oli  spesifisesti palmityloitu.  Näiden ubikitiiniligaasien kohdemolekyylejä ei vielä 2003 tiedetty, mutta  todettiin että oli löydetty eräs  uusi palmityloitujen E3 ubikitiiniligaasien funktio.

  • Ubiquitin (Ub) ligation is implicated in active protein metabolism and subcellular trafficking and its impairment is involved in various neurologic diseases. In rat brain, we identified two novel Ub ligases, Momo and Sakura, carrying double zinc finger motif and RING finger domain. Momo expression is enriched in the brain gray matter and testis, and Sakura expression is more widely detected in the brain white matter as well as in many peripheral organs. Both proteins associate with the cell membranes of neuronal and/or glial cells. We examined their Ub ligase activity in vivo and in vitro using viral expression vectors carrying myc-tagged Momo and Sakura. Overexpression of either Momo or Sakura in mixed cortical cultures increased total polyubiquitination levels. In vitro ubiquitination assay revealed that the combination of Momo and UbcH4 and H5c, or of Sakura and UbcH4, H5c and H6 is required for the reaction. Deletion mutagenesis suggested that the E3 Ub ligase activity of Momo and Sakura depended on their C-terminal domains containing RING finger structure, while their N-terminal domains influenced their membrane association. In agreement, Sakura associating with the membrane was specifically palmitoylated. Although the molecular targets of their Ub ligation remain to be identified, these findings imply a novel function of the palmitoylated E3 Ub ligase(s).
  •  PMID:
  • 12859687
Nykytietoa: 
  • "MOMO"  on CARP-1, RNF34, RF1, RIF, hRFI Caspase -8 and -10 associated RING finger protein 1 .
  •  Amino acid sequence
  • https://www.prospecbio.com/RNF34_Human
    MGSSHHHHHH SSGLVPRGSH MGS MRKAGAT SMWASCCGLL NEVMGTGAVR GQQSAFAGAT GPFRFTPNPE FSTYPPAATE GPNIVCKACG LSFSVFRKKH VCCDCKKDFC SVCSVLQENL RRCSTCHLLQ ETAFQRPQLM RLKVKDLRQY LILRNIPIDT CREKEDLVDL VLCHHGLGSE DDMDTSSLNS SRSQTSSFFT RSFFSNYTAP SATMSSFQGE LMDGDQTSRS GVPAQVQSEI TSANTEDDDD DDDEDDDDEE ENAEDRNPGL SKERVRASLS DLSSLDDVEG MSVRQLKEIL ARNFVNYSGC CEKWELVEKV NRLYKENEEN QKSYGERLQL QDEEDDSLCR ICMDAVIDCV LLECGHMVTC TKCGKRMSEC PICRQYVVRA VHVFKS
  •  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2587165/bin/nihms-50564-f0007.gif
  • "SAKURA" on CARP-2, RNF189, RNF34L, FRING, RFFL, RIFIFYLIN, Caspase -8 and -10 associated RING protein2 


https://www.researchgate.net/figure/Understanding-of-complex-prion-diseases-Identification-of-genes-and-genetic-markers_fig2_235393109

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar