Leta i den här bloggen


onsdag 27 juni 2018

Ubikitiinin de novo synteesi . UBA80 (2p16.1) , RPS27A , Monoubikitiini, fuusioproteiini, Solustressisensori

( Ubikitiini A laji )Tästä geenistä on aika runsaasti merkitsevää kliinistä  tietoa. Näyttää siltä että tätä ubikitiinilaatua syntyy  solustressin ja DNA vaurion  indusoimana p53:n toimesta.
 Tämä ubikitiinigeeni koodaa fuusioproteiinia, jonka N-terminaalissa on yksi ubikitiini-alue ja C-terminaalissa ribosomaalinen proteiini S27a. Hiivassa  tämä konservoitunut geeni tuottaa vapaan  monoubikitiinin ja ribosomaalisen proteiinin  S27a. (  S27a on komponettina  ribosomin 40S alayksikössä). Tässä prekursoriproteiinissa on useita  asetyloituneita lysiinejä C-terminaalisessa jaksossa. Kuvassa ylin on  tämän UBA80 kaava.

https://www.researchgate.net/profile/Choongseob_Oh/publication/256489807/figure/fig1/AS:213970884534276@1428026042193/a-Schematic-representation-of-the-4Ub-genes-Rps27a-and-Uba52-encode-Ub-as-a-fusion.png

PubMeD  lähde käyttää mieluiten geeninimeä RPS27A, ( mikä on ymmärrettävää, että  ei tule sekaannusta, koska  tässä järejstelmsäsä on tosiaan paljon  näitä UB nimiä) 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/6233
also known as
UBC; S27A; CEP80; UBA80; HEL112; UBCEP1; UBCEP80
Summary
Ubiquitin, a highly conserved protein that has a major role in targeting cellular proteins for degradation by the 26S proteosome, is synthesized as a precursor protein consisting of either polyubiquitin chains or a single ubiquitin fused to an unrelated protein.
 This gene encodes a fusion protein consisting of ubiquitin at the N terminus and ribosomal protein S27a at the C terminus. 
When expressed in yeast, the protein is post-translationally processed, generating free ubiquitin monomer and ribosomal protein S27a. Ribosomal protein S27a is a component of the 40S subunit of the ribosome and belongs to the S27AE family of ribosomal proteins. It contains C4-type zinc finger domains and is located in the cytoplasm.
 Pseudogenes derived from this gene are present in the genome. As with ribosomal protein S27a, ribosomal protein L40 is also synthesized as a fusion protein with ubiquitin; similarly, ribosomal protein S30 is synthesized as a fusion protein with the ubiquitin-like protein fubi. Multiple alternatively spliced transcript variants that encode the same proteins have been identified.[provided by RefSeq, Sep 2008]
Expression
Ubiquitous expression in ovary (RPKM 575.2), lymph node (RPKM 347.6) and 25 other tissues See more
Orthologs

Related articles in PubMed

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar