USP21 deubikitinaasista edelleen ja sen kohdemolekyylistä BRCA2, DNA repair associated

KAtselin  niitä molekyylejä, joiden kanssa  USP21 tkee interaktion ja tähän kerään niistä tietoa. Ne ovat hyvin keskeisissä osissa olevi  geenejä ja proteiineja.

BRCA3 on yksi  USP21:n  deubikitinaatiokohteita. 
Mitä tämä BRCA2 on? Peptidi on hyvin pitkä verrattuna  kohtalaisen pieniin ubikitiinijärjestlmän jadeubikitiinijärjstelmän proteiineihin. 
BRCA2 on avainvälittäjämolekyli DNA:n korjausjärestelmässä jonka nimi on homologinen rekombinaatio. Jos USP21 deubkititinaasin  vajetta on,  tämä homologinen DNA:n korjausjärjestemä toimii huonosti.  ja DNA-vauriokuorma kasvaa.
  Normaalin BRCA1 ja BRCA2 geenien tuotteiden  tarkoitus on  osallistua genomisien stabiliteetin ylläpitoon, varsinkin  DNA:n kaksoisjuosteen  katkon ( DSB, double strand  brake)  korjauksessa.  BRCA2 proteiinisssa on hyvin monta  BRC-toistojaksoa jotka  ovat  funktionaalisia tässä  DNA-korjausjärjesetlmässä. Niitä on 8  konservoitua  n35 aminohapon motiivia.  Niillä on omat speisfiset  funktionsa.   

( Tässä vähän ihmetelin tämän BRCA2 molekyylin suurta kokoa.  Katsoin BRCA1 molekyylin kokoa,  sehän  taas on E3 ubikitiiniligaasi ja tunnetaan  RNF proteiineista , joissa on RING ja sinkkiä ja se on vain puolet tämän BRCA2 koosta mutta osllistuu tehokkaasti DNA- korjausjärjestelmään... )  

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2669112/figure/F1/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2669112/figure/F1/

Geeni:

BRCA2, DNA repair associated (13q13.1)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/675
 Synonyms  FAD; FACD; FAD1; GLM3; BRCC2; FANCD; PNCA2; FANCD1; XRCC11; BROVCA2

Summary. Inherited mutations in BRCA1 and this gene, BRCA2, confer increased lifetime risk of developing breast or ovarian cancer. Both BRCA1 and BRCA2 are involved in maintenance of genome stability, specifically the homologous recombination pathway for double-strand DNA repair. The BRCA2 protein contains several copies of a 70 aa motif called the BRC motif, and these motifs mediate binding to the RAD51 recombinase which functions in DNA repair. BRCA2 is considered a tumor suppressor gene, as tumors with BRCA2 mutations generally exhibit loss of heterozygosity (LOH) of the wild-type allele. [provided by RefSeq, Dec 2008]

Expression- Broad expression in bone marrow (RPKM 2.9), testis (RPKM 2.2) and 17 other tissues See more

Preferred Names

breast cancer type 2 susceptibility protein

Names

BRCA1/BRCA2-containing complex, subunit 2

Fanconi anemia group D1 protein

breast and ovarian cancer susceptibility gene, early onset

breast and ovarian cancer susceptibility protein 2

breast cancer 2 tumor suppressor

breast cancer 2, early onset

mutant BRCA2

truncated breast cancer 2

 Peptide3418 aminoacids.

Conserved Domains (5) summary

 

cd04494
Location:2804 → 3054

BRCA2DBD_OB2; BRCA2DBD_OB2: A subfamily of OB folds corresponding to the second OB fold (OB2) of the 800-amino acid C-terminal ssDNA binding domain (DBD) of BRCA2 (breast cancer susceptibility gene 2) protein, called BRCA2DBD. BRCA2 participates in homologous ...

pfam00634
Location:1518 → 1549

BRCA2; BRCA2 repeat

pfam09103
Location:2670 → 2793

BRCA-2_OB1; BRCA2, oligonucleotide/oligosaccharide-binding, domain 1

pfam09104
Location:3057 → 3186

BRCA-2_OB3; BRCA2, oligonucleotide/oligosaccharide-binding, domain 3

pfam09169
Location:2481 → 2667

BRCA-2_helical; BRCA2, helical