Ubikitiinin de novo synteesi . Esimerkkinä UBA52 geeni (19p13.11) Fuusioproteiini, monoubikitiini

Ubikitiini A laji UBA52..

Asetan tähän PubMed linkit geeneistä  Ensin geeni UBA 52. jo tähän yhteyteen.

Geeni   UBA52 (19p13.11))

• UBA52 ubiquitin A-52 residue ribosomal protein fusion product 1 [ Homo sapiens (human) ]

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7311

Peptidin historiasta ja rakenteest;  isoformi 1 prekursoriproteiini,  fuusioproteiini, jossa on  yksi ubikitiinialue (1-76 a.a. ) ja sitten ribosomaalinen  L40 alue (78-126). Peptidin pituus on 128.

• ubiquitin-60S ribosomal protein L40 isoform 1 precursor [Homo sapiens]

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_001029102.1

Isoformin yhteydessä oleva  teksti antaa selityksen tämän geenin muille  synonyymisille nimille:
RPL40, L40, CEP52, HUBCEP52

ORIGIN      
        1 mqifvktltg ktitleveps dtienvkaki qdkegippdq qrlifagkql edgrtlsdyn
       61 iqkestlhlv lrlrggiiep slrqlaqkyn cdkmicrkcy arlhpravnc rkkkcghtnn
      121 lrpkkkvk

Onpa lysiinipitoinen  proteiini!  Huomaa lysiini (K) 98. Siihen  voi tulla  metylaatio: trimetyllysiini. Muita lysiinikohtia  kuten K27, K48, K63. Lysiiniä näkyy muutenkin runsaasti: K6, K11, K33, K88, KKK 112,113, 114, KKK124, 125, 126, ja päädyssä on lysiini K128.
TÄSTÄ GEENISTÄ  SYNTYVÄ UBIKITIINI ON  VAIN YHDEN UB-ALUEEN SISÄLTÄVÄ, siis monounikitiini.

                /chromosome="19"
                     /map="19p13.11"
     Protein         1..128
                     /product="ubiquitin-60S ribosomal protein L40 isoform 1
                     precursor"
                     /note="ubiquitin-52 amino acid fusion protein; ubiquitin
                     carboxyl extension protein 52; ubiquitin-CEP52;
                     ubiquitin-60S ribosomal protein L40"
                     /calculated_mol_wt=14597