Leta i den här bloggen


tisdag 28 maj 2019

ZEB1 , "ZFHEP (10p11.22), "Zn Finger E-box Homeobox1"

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/6935
Tällä sinkkisormi-transkriptiofaktorilla on tehtävää interleukiini2:n vaimentajana. Mutaatiot assosioituvat silmäsairauksiin. Niistä geeni saakin useita nimilyhennyksiä. Rakennenimi ZFHEP kertoo että se on sinkkisormiproteiini jolla on E-box ja Homeo-box.


Also known as BZP; TCF8; AREB6; FECD6; NIL2A; PPCD3; ZFHEP; ZFHX1A; DELTAEF1
Summary This gene encodes a zinc finger transcription factor. The encoded protein likely plays a role in transcriptional repression of interleukin 2. Mutations in this gene have been associated with posterior polymorphous corneal dystrophy-3 and late-onset Fuchs endothelial corneal dystrophy. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described.[provided by RefSeq, Mar 2010]
Expression Ubiquitous expression in endometrium (RPKM 12.8), brain (RPKM 12.1) and 23 other tissues See more Orthologs mouse all
 
Preferred Names
zinc finger E-box-binding homeobox 1
Names
delta-crystallin enhancer binding factor 1;  (DELTAEF1)
negative regulator of IL2;  (NIL2A)
posterior polymorphous corneal dystrophy 3;(PPCD3)
transcription factor 8 (represses interleukin 2 expression); (TCF8)
zinc finger homeodomain enhancer-binding protein; (ZFHEP)

NP_001121600.1  zinc finger E-box-binding homeobox 1 isoform a

See identical proteins and their annotated locations for NP_001121600.1
Description
Transcript Variant: This variant (1) encodes isoform a.
Conserved Domains (5) summary
smart00389
Location:577613
HOX; Homeodomain
COG5048
Location:913966
COG5048; FOG: Zn-finger [General function prediction only]
sd00017
Location:890910
ZF_C2H2; C2H2 Zn finger [structural motif]
pfam00096
Location:224246
zf-C2H2; Zinc finger, C2H2 type
pfam13465
Location:930955
zf-H2C2_2; Zinc-finger double domain

Related articles in PubMed












Sirtuiinitekstin yhteydessä oli sivuhuomautuksena asiaa ZEB1-proteiinista jonka SIRT1 rekrytoi.
KUVA2

Kuva 2 esittää kaavamaisesti Sirtuiinien suorittaman positiivisen ja negatiivisen EMT-säätelyn.
Positiivista( = EMT:tä edistävää): TGF-beeta signalointiin liittyy Sirtuiini1- proteiinin lisääntyminen. SIRT1 rekrytoi ZEB1-proteiinin
( ZEB1 on C2H2- sinkkisormiproteiini ja transkriptiofaktori ja osallistuu tuumorin invaasioon ja metaboliaan. Se on EMT:n mestarisäätelijä. Sitä itseään säätelee usea signaalijärjestelmä kuten Wnt, TGF-beeta, NFkB, HIF ja miRNA. Sen onkogeeninen rooli on E-cadheriini- proteiinin tukahduttaminen, onhan E-Cad  tärkein solu-solu-adheesiomolekyyli. ZEB1 pääsee vaikuttamaan E-Cadheriiniin tekemällä interaktion useiden kromatiinia muokkaavan tekijän kanssa, kuten CtBP ja Swi/SNF-kompleksi. Toisaalta ZEB1 aktivoi suoraan niiden geenien promoottoreita, jotka osallistuvat EMT-ohjelmaan. ZEB1 tekee interaktion joko SMAD- proteiinien tai p300/CAF kanssa ja aktivoi TGFbeetan kohdegeenin CDH2 (N-Cadheriinin, joka on mesenkymaalinen cadheriini ja olennainen tuumorin progressiolle). ZEB1- yli-ilmenemä useissa syöpälinjoissa ( havaittu haima-, keuhko-, maksasyövässä, osteosarkoomassa, rintasyövässä, paksusuolisyövässä) indusoi EMT:tä ja edistää solujen invaasiota. Tieto vuodelta 2017) .
  • Schematic representation of positive and negative regulation of EMT by sirtuins. Positive: TGF‐β signaling is associated with an increase in Sirt1. Sirt1 is recruited by Zeb1 to the E‐cadherin promoter and causes transcriptional repression.

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar