Leta i den här bloggen


lördag 25 maj 2019

Sfingomyeliinin metabolian ja katabolian alueesta ja sen pullonkaula . Entsyymi ASAH1 (8p22) ja ASAH2 (10q11.23)

Sfigomyeliini kuuluu kehon fosfolipidien joukkoon tärkeänä  molekyylinä, joka valmistuu DE NOVO soluntuottamista aineista entsyymien avulla:  (B6 vitamiinin aktivoimasta seriiniaminohaposta ja soluntuottamasta aktivoidusta  palmitiinihaposta,  jotka kondensoituvat K1-vitamiinin toimiessa kofaktorina   yhdeksi molekyyliksi joka käy läpi muutoksia ) dihydrosfingosiini dhSo  eli  sfinganiini Sa) ja Sfingosiini (So) kohden  keramideja. kuten N-Acyl-Sfingosiini ( ceramidi). Siitä käsin voi muodostuu sekä glykolipidejä että sfingomyeliiniä.
Sfingomyeliini taas katabolisella tiellään  muodostaa SMM, sfingomyeliinimetaboliitteja.
 Niitä on  perustavasti neljää:
(1).  takaisinpäin lysosomissa  muodostuvaa keramidia   N-acyl-sfingosiiniä.
(2)  siitä edelleen  taaksepäin:    sfingosiinia (So)
tai  (3) Sfingosiinin  fosforylaatiotuotetta Sfingosiini-1-fosfaattia( So-1-P)
tai   lysosomin avulla SPL, sfingosyylifosfaryylikoliinia. (SphingosylPhospharyl Cholin) .
Sfingomyeliinin säästötie SALVAGE on uudestaan  NAcyl-keramidin muodostamista ja siitä edellen glykolipidejä tai Sfingomyeliinejä.

Kataboliatie onkin sitten  vaikeammin hahmotettavissa.
Sanotaan että  sfingomyeliinin verkostosta pääsee pois (EXIT)  ainoastaan siten, että So-1-P muuttuu  fosfatidyletanolamidiksi ja rasvahappoaldehydiksi.
Sitten onkin paljon selvitelty, mitä kaikkea voi tällä reittiytyneellä alueella  tapahtua.
On havaittu että So, sfingosiini voi  suorittaa kolmea  aineenvaihdunnallista  jatkoreittiä:
Se voi uudestaan (1) N-asyloitua keramidiksi (  SALVAGE tie).
Se voi (2) fosforyloitua So-1-P- muotoon.  On havaittu, että on SPP1 ja SPP2-entsyymit, jotka ovat sfingosiinifosfaattifosfataaseja ja voivat palauttaa  takaisin  tärkeään sfingosiinimuotoon (So).
Sitten on havaittu myös (3) N-metyloituminen  ja tällä tiellä löytyy N-Me-So, N,N-2MeSo ja N,N,N-3MeSo  ja nämä ovat vaikuttavia  molekyylejä eikosanoidikaskadin alueella .
Sanotaan.että tumasäätö vaikuttuu myös - tästä joskus erikseen. En ole tästä nähnyt kovin montaa artikkelia.
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8621258
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1657377?dopt=Abstract&holding=npg

Tässä  mainitsen  yleensä   kuvatun  kataboliseen kohdan:  jossa  joko Sfinganiinifosfaatti (Sa-P)  tai Sfingosiinifosfaatti  (So-P) joutuvat lyaasin kohteeksi ja muuttuvat etanolamiinifosfaatiksi ja  rasvahappoaldehydiksi (trans-2-hexanaali).
-------

Löysin  joukon  entsyymeitä, joita nyt katson.ASAH1 (aCDase, pH 4-5) ), ASAH2 (nCDase, pH 7-9)
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/427
Niiden tehtävä on tuottaa  sfingosiinia (SO) . Esim ASAH2 on ruoansulatuksellinen entsyymi ja hajoitata sfingomyeliinejä,  joita ravinnosta tulee. 
  • ASAH1 (8p22) asidinen keramidaasi , aCDase , lysosomaalinen
N-acylsphingosine (Cer)  amidohydrolase 1 [ Homo sapiens (human) ]
Also known as
AC; PHP; ASAH; PHP32; ACDase; SMAPME
Summary  This gene encodes a member of the acid ceramidase family of proteins. Alternative splicing results in multiple transcript variants, at least one of which encodes a preproprotein that is proteolytically processed. Processing of this preproprotein generates alpha and beta subunits that heterodimerize to form the mature lysosomal enzyme, which catalyzes the degradation of ceramide (Cer) into sphingosine  (So) and free fatty acid (FFA) . This enzyme is overexpressed in multiple human cancers and may play a role in cancer progression. Mutations in this gene are associated with the lysosomal storage disorder, Farber lipogranulomatosis, and a neuromuscular disorder, spinal muscular atrophy with progressive myoclonic epilepsy. [provided by RefSeq, Oct 2015]  Expression  Broad expression in thyroid (RPKM 225.8), heart (RPKM 191.4) and 24 other tissues See more  Orthologs  mouse all
 
Preferred Names
acid ceramidase
Names
N-acylethanolamine hydrolase ASAH1
N-acylsphingosine amidohydrolase (acid ceramidase) 1
acid CDase
acylsphingosine deacylase
putative 32 kDa heart protein
Conserved Domains (2) summary
cd01903
Location:128373
Ntn_AC_NAAA; AC_NAAA This conserved domain includes two closely related proteins, acid ceramidase (AC, also known as N-acylsphingosine amidohydrolase), and N-acylethanolamine-hydrolyzing acid amidase (NAAA). AC catalyzes the hydrolysis of ceramide to sphingosine and fatty acid. Ceramide is required for the biosynthesis of most sphingolipids and plays an important role in many signal transduction pathways by inducing apoptosis and/or arresting cell growth. An inherited deficiency of AC activity leads to the lysosomal storage disorder known as Farber disease. AC is considered a "rheostat" important for maintaining the proper intracellular levels of these lipids since hydrolysis of ceramide is the only source of sphingosine in cells. NAAA is a eukaryotic glycoprotein that hydrolyzes bioactive N-acylethanolamines, including anandamide (an endocannabinoid) and N-palmitoylethanolamine (an anti-inflammatory and neuroprotective substance), to fatty acids and ethanolamine at acidic pH. NAAA shows structural and functional similarity to acid ceramidase, but lacks the ceramide-hydrolyzing activity of AC.
pfam15508
Location:68133
NAAA-beta; beta subunit of N-acylethanolamine-hydrolyzing acid amidase
Related articles in PubMed
GeneRIFs: Gene References Into Functions

  •  ASAH2 (10q11.23)  neutraali keramidaasi  (nCDase)

ASAH2 N-acylsphingosine amidohydrolase 2 [ Homo sapiens (human) ]

Also known as
HNAC1; BCDase; LCDase; NCDase; N-CDase
Summary
Ceramidases (EC 3.5.1.23), such as ASAH2, catalyze hydrolysis of the N-acyl linkage of ceramide, a second messenger in a variety of cellular events, to produce sphingosine. Sphingosine exerts both mitogenic and apoptosis-inducing activities, and its phosphorylated form functions as an intra- and intercellular second messenger (see MIM 603730) (Mitsutake et al., 2001 [PubMed 11328816]).[supplied by OMIM, Mar 2008]
Expression
Biased expression in duodenum (RPKM 35.9), small intestine (RPKM 31.0) and 1 other tissue See more
Orthologs
Preferred Names
neutral ceramidase
Names
N-acylsphingosine amidohydrolase (non-lysosomal ceramidase) 2
acylsphingosine deacylase 2
mitochondrial ceramidase
neutral/alkaline ceramidase
non-lysosomal ceramidase
Conserved Domains (3) summary
PTZ00487
Location:100743
PTZ00487; ceramidase; Provisional
pfam04734
Location:102573
Ceramidase_alk;
Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase, N-terminal
This family represents N-terminal domain of a group of neutral/alkaline ceramidases found in both bacteria and eukaryotes. The EC classification is EC:3.5.1.23. The enzyme hydrolyzes ceramide to generate sphingosine and fatty acid. The enzyme plays a regulatory role in a variety of physiological events in eukaryotes and also functions as an exotoxin in particular bacteria. This N-terminal domain carries two metal-binding sites, the first for Zn2+ residing within the domain, and the second, for Mg2+/Ca2+ lying at the interface between the two domains.
pfam17048
Location:575742
Ceramidse_alk_C; Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase, C-terminalThis family represents C-terminal domain of a group of neutral/alkaline ceramidases found in both bacteria and eukaryotes. The EC classification is EC:3.5.1.23. The enzyme hydrolyzes ceramide to generate sphingosine and fatty acid. The enzyme plays a regulatory role in a variety of physiological events in eukaryotes and also functions as an exotoxin in particular bacteria. This C-terminal tail of the enzyme is highly conserved across all species and may play a role in the interaction of the enzyme with the plasma membranes. The tail is also vital for the stabilization of the enzyme as a whole.
Related articles in PubMed
GeneRIFs: Gene References Into Functions
  •   Suoliston  neutraalin keramidaasin merkitys terveydessä 19 hakulöytöä sanoilla "intestinal ceramidase". Pidän tätä tärkeänä entsyyminä ja otan kaikki löydöt tähän netistä:

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=intestinal+neutral+ceramidase%2C

Nilsson Å, Duan RD.
Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2019 Apr 1;316(4):G425-G445. doi: 10.1152/ajpgi.00320.2018. Epub 2018 Dec 21.
2.
García-Barros M, Coant N, Kawamori T, Wada M, Snider AJ, Truman JP, Wu BX, Furuya H, Clarke CJ, Bialkowska AB, Ghaleb A, Yang VW, Obeid LM, Hannun YA.
FASEB J. 2016 Dec;30(12):4159-4171. Epub 2016 Sep 8.
3.
Snider AJ, Wu BX, Jenkins RW, Sticca JA, Kawamori T, Hannun YA, Obeid LM.
Prostaglandins Other Lipid Mediat. 2012 Dec;99(3-4):124-30. doi: 10.1016/j.prostaglandins.2012.08.003. Epub 2012 Aug 31.
4.
Maltesen HR, Troelsen JT, Olsen J.
J Cell Biochem. 2010 Dec 1;111(5):1330-6. doi: 10.1002/jcb.22862.
5.
Duan RD, Nilsson A.
Prog Lipid Res. 2009 Jan;48(1):62-72. doi: 10.1016/j.plipres.2008.04.003. Epub 2008 Nov 8. Review.
6.
Ohlsson L, Hjelte L, Hühn M, Scholte BJ, Wilke M, Flodström-Tullberg M, Nilsson A.
J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2008 Nov;47(5):547-54. doi: 10.1097/MPG.0b013e3181826daf.
7.
Ohlsson L, Palmberg C, Duan RD, Olsson M, Bergman T, Nilsson A.
Biochimie. 2007 Aug;89(8):950-60. Epub 2007 Mar 19.
8.
Duan RD, Cheng Y, Jönsson BA, Ohlsson L, Herbst A, Hellström-Westas L, Nilsson A.
Pediatr Res. 2007 Jan;61(1):61-6.
9.
Duan RD, Verkade HJ, Cheng Y, Havinga R, Nilsson A.
Biochim Biophys Acta. 2007 Feb;1771(2):196-201. Epub 2006 Dec 15.
10.
Tani M, Ito M, Igarashi Y.
Cell Signal. 2007 Feb;19(2):229-37. Epub 2006 Sep 11. Review.
11.
Kono M, Dreier JL, Ellis JM, Allende ML, Kalkofen DN, Sanders KM, Bielawski J, Bielawska A, Hannun YA, Proia RL.
J Biol Chem. 2006 Mar 17;281(11):7324-31. Epub 2005 Dec 27.
12.
Nilsson A, Duan RD.
J Lipid Res. 2006 Jan;47(1):154-71. Epub 2005 Oct 26. Review.
13.
Olsson M, Duan RD, Ohlsson L, Nilsson A.
Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2004 Oct;287(4):G929-37. Epub 2004 Jun 24.
14.
15.
16.
17.
Duan RD, Cheng Y, Yang L, Ohlsson L, Nilsson A.
Lipids. 2001 Aug;36(8):807-12.
PMID:
11592731
18.
Lundgren P, Nilsson A, Duan RD.
Dig Dis Sci. 2001 Apr;46(4):765-72.
PMID:
11330410
19.
Hertervig E, Nilsson A, Nyberg L, Duan RD.
Cancer. 1997 Feb 1;79(3):448-53.
PMID:
9028353









Inga kommentarer:

Skicka en kommentar