Kromosomi 1
USP1 (UBP);
USP21;
USP24;
USP33;
USP48.
UCHL5
OTUD2/YOD1/DUBA8/HIN7
OTUD7B/CEZANNE/ZA20D1
Kromosomi 2
USP34;
USP37 ;
USP39 (65K,CGI-21, HSPC332,SAD1, SNRNP65);
USP40
Kromosomi 3
USP4 (UNP, Unph);
USP13 (ISOT3, IsoT-3);
USP19 (ZMYND9).
BAP1/UCHL2
Kromosomi 4
USP17L9P pseudo (USP17, USP17A, USP17H, USP17I, USP17J, USP17K,USP17L, USP17M, PS447);
USP38 (HP43.8KD);
USP46;
USP53.
UCHL1
OTUD4/DUBA7
Kromosomi 5
(Ei USP tyyppistä DUB)
Kromosomi 6
USP45;
USP49.
OTUD7C/A20
Kromosomi 7
USP42.
Kromosomi 8
USP17 (protein coding; USP17L2, DUB-3, DUB3)
OTUD6B/DUBA5
VCP1P1/DUBA3
Kromosomi 9
USP22 (USP3L)
Kromosomi10
USP54 (C10Orf29, bA137L10.3, bA137L10.4)
OTUD1/DUBA7
TRABID/ZRANB1
Kromosomi 11
USP2(UBP41);
USP28;
UPS35;
USP47 (TRFP; TATA-binding protein-related factor) proximal homolog deub.47)
OTUB1
OTUD3(DUBA4)
Kromosomi 12
USP5 (I-SOT);
USP15 (UNPH-2, UNPH4) ;
USP30 (mitochondrial);
USP44;
USP52 (Poly(A)specific ribonuclease subunit PAN2 ).
OTUD4P1/HIN1L pseudo
Kromosomi 13
USP12 (UBH1, USP12L1);
USPL1( C13orf22, D13S106E, bA121O19.1).
UCHL3
Kromosomi 14
OTUB2
Kromosomi 15
USP3 (SIH003, UBP);
USP8 (HumORF8, PITA4, SPG59, UBPY);
USP50.
OTUD7A/CEZANNE2
Kromosomi 16
USP7 (HAUSP, TEF1);
USP10 (UBPO);
USP31 ;
USPL2 (CYLD, EAC, NFT, SBS, TEM,CDMT, MFT1, CYLD1, CYLDI)
Kromosomi 17
USP6 (HRP1, TRE17, TRE2,USP6-short , TRSMCR, Tre-2)
USP22 (USB3L);
USP32 (NY-REN-60);
USP32P2pseudogeeni (TL132);
USP36 (DUB1);
USP43.
Kromosomi 18
USP14 (TGT).
Kromosomi 19
USP29 (HOM-TES-84/86).
Kromosomi 20
---
Kromosomi 21
USP16 (UBPM, UBP-M);
USP25. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28619731/
Kromosomi 22
USP18 (ISG43, PTORCH2, UBP43)
Kromosomi X
USP9X (DFFRX, FAM, MRX99,FAF, MRXS99F);
USP11 (UHX1);
USP26;
USP27X (USP27, MRX105,USP22L);
USP51.
OTUD5/DUBA
OTUD6A/ DUBA2/HIN6.
KromosomiY
USP9Y (DFFRY, SPGFY2).
Muistiin 13.5.2019 Deubikitinaasien 5 alaperheestä USP- perhe, jossa on 57 jäsentä.
USP tarkoittaa "Ubiquitin Specific Peptidase".
Kaikki noin 90 deubikitinaasia (DUB) jaetaan kolmeen toiminnalliseen luokkaan, mikä ei tässä pelkästään kromosomaalista asettumista osoittavassa luettelossa vielä selviä, vaikka alternatiiveistä nimistä saa vihjettä funktioista).
tarkemmat tiedot olen koonnut edellä seuraavien otsikkojen alle:
USP deubikitinaasit DUB 1- 30
USP -deubikitinaaseja DUB 31-57.
Myöhemmin:
Lisään kromosomeihinsa 4 UCH -geeniä tummalla painotuksella ja 14 OTU deubikitinaasigeeniä. kursiivilla .
UCH tarkoittaa "Ubiquitin C-terminal Hydrolase",
OTU tulee sanoista "Ovarian Tumor proteases" ja OTUD; "OTU deubiquitinases".
Tässä on nyt kromosomeissaan noin 75 deubikitinaasia. ( ryhmät USP, UCH ja OTUD) .
Vielä puuttuu MJD ja JAMM. 4 ja 11 vastaavasti.
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar