Leta i den här bloggen


tisdag 28 maj 2019

ZHX2 "Sinkkisormi ja homeobox" ZHX2 , alfafetoproteiininsäätelijä1, RAF

 Sinkkisormi ja homeobox- proteiinit on ryhmitelty samaan  rakenteelliseen sinkkisormiproteiiniryhmään, jossa on myös pseudogeenejä;  yhteensä  15 geeniä ja niistä 10 on transkriptionaalisia tekiöitä . Mutta tässä koetan löytää ensin  toimivia (repressori)geenejä,  jotka ovat vain " Zf  and Homeobox containing " , ZHX.  Tässä katson  tietoja ZHX2 ja ZHX1 geeneistä. ZEB1 kuuluu myös näihin (ZFHX1A). Siitä erikseen.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/22882

  •  ZHX2
 Tämä homeobox2- sinkkisormiproteiini ZHX2 on toiselta nimeltä RAF tai AFR1 ja tarkoittaa alfafetoproteiinisäätelijää 1. ZHX2-geeni säätelee myös Glypikaania (GPC3) vaimentamalla sen geenä. ZHX2 siirtyy tumaan ja GPC3-geenipromoottoriin. Mutta jos ZHX2 on vaimentunut, pääsee glypikaanieeni aktivoitumaan. Esim maksasyöpä aktivoi sen ja niin glypikaani3 on eräs  diagnostinen markkeri, muta ei niin hyvä kuin alfafetoproteiini, muta yhdessä niiden diagnostinen täsmällisyyson vielä suurempi.

ZHX2 (8q24.13)  "Zinc Finger and Homeobox 2"

RAF= Regulator of Alphafetoprotein
AFR1= Alfa-fetoproteiini säätelijä 1

Also known as RAF; AFR1
Summary The members of the zinc fingers and homeoboxes gene family are nuclear homodimeric transcriptional repressors that interact with the A subunit of nuclear factor-Y (NF-YA) and contain two C2H2-type zinc fingers and five homeobox DNA-binding domains. This gene encodes member 2 of this gene family. In addition to forming homodimers, this protein heterodimerizes with member 1 of the zinc fingers and homeoboxes family. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Expression Ubiquitous expression in ovary (RPKM 12.8), lymph node (RPKM 11.9) and 25 other tissues See more Orthologsmouse all
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31113610
Serum GPC3 is inferior to AFP in the differential diagnosis between HCC and LC. However, the combination of GPC3 and AFP exhibited a much better performance.

B-hepatiittivirus säätää alas ZHX2-geenin ilmentymistä mikä taas edistää maksasolusyävän proliferoitumista.

Hodginin lymfoomassa on transkriptionaalinen deregulaatio, viallinen säätyminen ZHX2-geenissä. 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar