Leta i den här bloggen


tisdag 3 juli 2018

Tietoja USP5 deubikitinaasista (DUB perheen jäsen USP alaryhmästä))

Jo aiemmin on tiedetty USP5:n  säätelevän p53:n stabiiliutta ankuroitumattomilla ubikitiiniketjuilla muta sen vaikutustavoissa on ollut epäselvyyksiä, joita viime vuosina on  selvitetty. .
  • USP5 Regulates p53 Stability Via Unanchored Ubiquitin Chains
Depletion of USP5 has been reported to cause accumulation of nuclear p53 and increase p53 transcriptional activity. Activation of p53 can be accounted for by the ability of USP5 suppression to inhibit the proteasomal degradation of p53 without affecting the degradation of Mdm2. The differential effect of USP5 depletion on protein stability may be due to the differences in the sensitivities of p53 and Mdm2 to inhibition of proteasomal activity by free/unanchored poly-ubiquitin that accumulates after the USP5 loss [94]. While indirectly linked to the key DNA damage checkpoint factor p53, USP5 has not been strictly identified as a modulator of the DDR and further investigations are needed to assess its roles in DNA damage signalling or repair.
 Vuodelta 2013  tieto;: LÄHDE  https://link.springer.com/article/10.1007/s12013-013-9635-3

  •  Tietoja USP5:stä vuodelta 2016

(Kuin ”takiaiskiistaa:  Ubikitiiniligaasi kiinnittää ”takiaisia”(ub). Deubikitinaasi poistaa ”takiaisia”, mutta joku ubikitiiniligaasi asettaa ”takiaisen” itse deubikitinaasiin muuttaen sen epästabiiliksi- Nyt on löydetty se E3 ligaasi, joka asetata ubikitiinin  USP5:een ja lähettää USP5:n silppuriin) .

  • USP5 destabiloituu Smurf1- E3 ligaasin tekemästä ubikitinaatiosta
LÄHDE: Biochem Biophys Res Commun. 2016 Jun 3;474(3):491-496. doi: 10.1016/j.bbrc.2016.04.135. Epub 2016 Apr 29.

Smurf1 represses TNF-α production through ubiquitination and destabilization of USP5.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27133717 Abstract (Suomennosta tiivistelmästä)

On osoitettu, että ubikitiinispesifinen proteaasi USP5 ( deubikitinaasi DUB) on kriittinen, jotta tuottuisi tuumorinekroosifaktori alfaa (TNFa), joka on keskeinen tulehdusvasteitten välittäjä. Sitäpaitsi USP5 on säätelemässä myös p53 ( genomin suojelijan) aktivaatiota ja DNA-korjausta.
Kuitenkaan ei ole aiemmin tiedetty taustamekanismeista eikä edes siitä vastaavasta ubikitiiniligaasista. Nyt vuonna 2016 tutkijat kertoivat selvittäneensä, että Smad-ubikitinaatiota säätelevä tekijä 1 (Smurf1) sääti alas USP5-proteiinin ilmentymän ja tällaiseen funktioon tarvittiin Smurf1-entsyymin E3 ligaasiaktiivisuuta. Tutkijat selvittivät myös, että Smurf1 teki interaktion USP5:n kanssa ja välitti USP5:n hajoittamisen ubikitiini-proteosomisilppuriteitse. Loogisesti tästä seuraa, että Smurf1 estää TNFalfan tuotannon, kun säätää alas USP5:n. Yhteenvetona tämä tutkimus selvensi ensimmäistä kertaa E3 ligaasientsyymin Smurf1 säätelevän USP5-proteiinin stabiiliutta ja USP5-vältiteistä TNF-alfa tuotantoa ubikitiini-proteosomisippuritietä.

  • Ubiquitin-specific peptidase 5 (USP5) has been demonstrated to be critical for the production of Tumor Necrosis Factor-alpha (TNF-α), a pivotal mediator for inflammatory responses. Besides, USP5 regulates p53 activation and DNA repair. However, the mechanism underlying the regulation of USP5, especially its responsible E3 ligase is still unclear. Here we found that Smad ubiquitination regulatory factor 1 (Smurf1) down regulated protein expression of USP5, and the E3 enzyme activity of Smurf1 was required for this function. We also revealed that Smurf1 interacted with USP5 and mediated its degradation via the ubiquitin proteasome pathway. Consequently, Smurf1 inhibited the production of TNF-α through down-regulation of USP5. Taken together, our study for the first time clarified that the E3 ligase Smurf1 regulates USP5 protein stability and USP5-mediated TNF-α production through the ubiquitin proteasome pathway. KEYWORDS: E3 ligase; Proteasomal degradation; Protein ubiquitination; Smurf1; USP5PMID: 27133717 DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.04.135 [Indexed for MEDLINE]
Mikä on Smad?
tämä on solunsisäinen konservoitunut signaalijärjestelmä, josta on karttakuviakin.   Smadtekijät tarvitsevat ubikitinaationsa ja sitä säätöä tulee Smurfeilta.
Mikä on Smurf ? Smurf on E ubikitiiniligaasien perheestä.
Ylhäällä kuvassa näkyy solupinta ja siinä on reseptori jonne tulee  jokin ligandi ja antaa signaalin solun sisään. Tiedon täytyy päästä etenemään- muta matkan varrella  signaalivirta modifioituu  ja  jossain taapuksessa  tulee signaali  aivan DNA: lle asti ja transkriptiotasoon.  Tässä kuvassa ei varinaisesti näy USP5, sillä se vaikutaa olevan liian heikko  TGFbeta- säätelytien  moduloijaksi, jos Smurf sen romuttaa.

 https://www.qiagen.com/sg/shop/genes-and-pathways/pathway-details/?pwid=412 Tässä lähteessä on yksityiskohtaista tietoa  SMAd-signalointitiestä.


https://mesh.kib.ki.se/term/D051785/smad-proteins

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar