Leta i den här bloggen

onsdag 14 februari 2018

TRIM4, RNF87, kr. 7q22.1, Oxidatiivinen stressi ja mitokondria.

TRIM4
Mitä tiedetään TRIM-4 proteiinista? Geeni TRIM4 eli RNF87 sijaitsee kromosomissa  t, q22.1. Porteiini lokalisoituu sytoplasmisesti.  Funktio ei oltu  vielä 2010  määritelty.  Antiviraalia funktiota   on osoitettu.   E3 ubikitinaatiolla on   myös  solusignalointiin vaikuttavaa merkitystä.  TRIM4 näyttää osallistuvan oxidatiivisen stressin  vaikuttamaan  apoptoosiin.

Suomennosta alla olevasta artikkelista 

"On lisääntyvää näyttöä siitä, että kohdeproteiinien modifioituminen ubikitiinillä ei ainoastaan toimi turnover -koneistona ubikitiini-proteiinisilppurijärjestelmässä (UPS) , vaan se on myös kriittinen säätelijä erilaisissa signaaliteissä. Ubikitinaation aikana E3ligaasi tunnistaa kohdeproteiinin ja päättää ubikitiiniketjujen topologiasta. Tässä artikkelin työssä tutkijat selvittivät TRIM4-proteiinin osuuttaa vetyperoksidin (H2O2) indusoiman solukuoleman säätelyssä. 

TRIM4 esiintyy eri tavalla kehon eri kudoksissa ( kuten eri TRIM-proteiinit tapaavatkin tehdä. Jokaisella nisitä on tyypillinen kirjonsa) , ja  TRIM4 esiintyy useimmissa syöpäkudoslinjoissa . Kun on selvitetty sen subsellulaarista sijoittautumista , on osoittautunut, että TRIM4 muodostaa selvästi erillisen sytoplasmisen täplikkään struktuurin, joka ohimenevästi tekee vuorovaikutusta mitokondriaan. TRIM4:n ilmenemä aiheuttaa mitokondrioitten aggrekoitumisen ja mitokondriaalisten vapaitten radikaalien pitoisuuden nousua, jos vetyperoksidia on läsnä.
 TRIM4 herkistää solut vetyperoksidin aiheuttamalle solukuolemalle, apoptoosille, kun taas TRIM4-poistogeenisyys oli vaikutukseltaan palauttava. TRIM4 vahvistaa mitokondrian kalvojenvälisen (tärkeän) potentiaalin katoamista ja mitokondrian "hengen", sytokromi c:n irtoamista mitokondriasta vetyperoksidin H2O2  vaikutuksesta.
 
Analysoitaessa TRIM4- proteiinin kanssa vuorovaikutuksessa olevia proteiineja todetaan peroxiredoxiini1 (PRX1) ja muita mitokondriaaliseen ja REDOX- tasapainon säätelyyn osallistuvia proteiinia niiden joukossa. TRIM4-proteiinin interaktio peroxiredoxiini-1:n kanssa on kriittinen vetyperoksiidin indusoimassa solukuolemassa.
Kaiken kaikkiaan tämä tutkimus viittaa TRIM4-proteiinilla olevan osaa oxidatiivisen stressin indusoimassa solukuolemassa.

Free Radic Biol Med. 2015 Dec;89:1036-48. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2015.10.425. Epub 2015 Oct 31.
TRIM4; a novel mitochondrial interacting RING E3 ligase, sensitizes the cells to hydrogen peroxide (H2O2) induced cell death.
The emerging evidences suggest that posttranslational modification of target protein by ubiquitin (Ub) not only regulate its turnover through ubiquitin proteasome system (UPS) but is a critical regulator of various signaling pathways. During ubiquitination, E3 ligase recognizes the target protein and determines the topology of ubiquitin chains. In current study, we studied the role of TRIM4, a member of the TRIM/RBCC protein family of RING E3 ligase, in regulation of hydrogen peroxide (H2O2) induced cell death.
TRIM4 is expressed differentially in human tissues and expressed in most of the analyzed human cancer cell lines. The subcellular localization studies showed that TRIM4 forms distinct cytoplasmic speckle like structures which transiently interacts with mitochondria. The expression of TRIM4 induces mitochondrial aggregation and increased level of mitochondrial ROS in the presence of H2O2. It sensitizes the cells to H2O2 induced death whereas knockdown reversed the effect. TRIM4 potentiates the loss of mitochondrial transmembrane potential and cytochrome c release in the presence of H2O2.
The analysis of TRIM4 interacting proteins showed its interaction with peroxiredoxin 1 (PRX1), including other proteins involved in regulation of mitochondrial and redox homeostasis. TRIM4 interaction with PRX1 is critical for the regulation of H2O2 induced cell death. Collectively, the evidences in the current study suggest the role of TRIM4 in regulation of oxidative stress induced cell death.

KEYWORDS:

Cell death; H(2)O(2); Mitochondria; PRX1; TRIM4; Ubiquitin E3 ligase

Muistiin suomennos 14.2. 2018

TRIM4 geenitieto:
 PubMed haku klo 22:51
Official Symbol
TRIM4provided by HGNC
Official Full Name
tripartite motif containing 4provided by HGNC
Gene type
protein coding

Organism
Homo sapiens
Also known as
RNF87
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to cytoplasmic bodies. Its function has not been identified. Alternatively spliced transcript variants that encode different isoforms have been described.[provided by RefSeq, Jul 2010]
Expression
Ubiquitous expression in ovary (RPKM 16.5), thyroid (RPKM 12.9) and 25 other tissues See more
Orthologs
all

Related articles(3) in PubMed


    (Ylläoleva artikkli suomeksi. . Vuodelta 2014)

MITEN TRIM4 on antiviraali?

Tämäkin artikkeli on vuodelta 2014.
  1. RIG-I is a pivotal cytoplasmic sensor that recognizes different species of viral RNAs. This recognition leads to activation of the transcription factors NF-κB and IRF3, which collaborate to induce type I interferons (IFNs) and innate antiviral response. In this study, we identified the TRIM family protein TRIM4 as a positive regulator of RIG-I-mediated IFN induction.
    Overexpression of TRIM4 potentiated virus-triggered activation of IRF3 and NF-κB, as well as IFN-β induction, whereas knockdown of TRIM4 had opposite effects. Mechanistically, TRIM4 associates with RIG-I and targets it for K63-linked polyubiquitination. Our findings demonstrate that TRIM4 is an important regulator of the virus-induced IFN induction pathways by mediating RIG-I for K63-linked ubiquitination.

Upplagd av kl.
Etiketter: , , , ,

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar

Prenumerera på: Kommentarer till inlägget (Atom)