TRIM15 (Kr,6p21.33) RNF95, ZNF178, ( C IV) Fokaaliadheesiokomponentti

TRIM15 (Kr.6p21.33), RNF93, ZNF178, ZNFB7(Alaryhmä C IV PRY/SPRY)

TRIM15 geeni näyttää ilmenevän suolistoalueella sekä eritykseen osallistuvissa elimissä kuten maksa-sappirakko ja munuainen. Rakenne on alaluokan CIV mukainen: RING domaani, B-Box 1 ja B-Box2 , CC ja C-terminaalissa on PRY/SPRY.

• Also known as RNF93; ZNFB7; ZNF178 Summary The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. The protein localizes to the cytoplasm. Alternatively spliced transcript variants have been described, but their biological validity has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] Expression Biased expression in duodenum (RPKM 12.6), small intestine (RPKM 9.2) and 6 other tissues See more

Related articles in PubMed

1. A transcription map of the major histocompatibility complex (MHC) class I region. Gruen JR, et al. Genomics, 1996 Aug 15. PMID 8812418
2. TRIM15 is a focal adhesion protein that regulates focal adhesion disassembly. Uchil PD, et al. J Cell Sci, 2014 Sep 15. PMID 25015296, Free PMC Article
   
   TRIM15  vuorovaikuttaa paxilliiniin ja pystyy täten  negatiivisesti säätelemään solujen leviämistä ja migraatiota.
   
   (Suomennosta:) Fokaalit adheesiot ovat makromolekulaarisia komplekseja, jotka liittävät aktiini-solutukirunkoa solun ulkoiseen matriisiin. Solun migroitumiselle on kriittisesti olennaista näiden fokaaliadheesioiden dynaaminen aineenvaihdunnallinen vaihtelu. Paxilliini on moniadaptoriproteiini, jolla on tärkeä osa fokaaliadheesiodynamiikan säätelyssä. Tässä artikkelissa tutkijat kertovat tunnistaneensa TRIM15- proteiinin sellaiseksi tekijäksi, joka asettuu paxilliinin kanssa vuorovaikutukseen ja on komponenttina fokaaliadheesioissa. TRIM-proteiinit saavat nimensä rakenteensa kolmiosaisuudesta. TRIM15 -proteiinin yksi rakenneosa on helikaalinen (C-C, coiled coil) domeeni ja sen domeenin välityksellä proteiini TRIM15 tekee interaktion paxilliinin N-terminaalisen  LD2-motiiviin näissä fokaalisissa liittymissä- (myosiini-II:sta riippumattomalla tavalla). Siinä TRIM15 poikkeaa muista fokaaliadheesiokomponenteista, että se on stabiili ja sen liikkuvuus on rajoittunutta, koska se pystyy muodostamaan oligomeerejä. Jos TRIM15 puuttuu solusta, ne solut ovat huonoja migroitumaan ja niiden fokaaliadheesioiden muodostumien on alentunutta.  Johtopäätös: TRIM15:n solufunktiona on toimia fokaaliadheesion vaihtuvuuden ja solu migraation säätelykomponenttina

GeneRIFs: Gene References Into FunctionsWhat's a GeneRIF?

1. TRIM15-depleted cells display impaired cell migration and reduced focal adhesion disassembly rates.

• TRIM15 may function as a tumor suppressor of colon cancer. 

( Suomennosta) Tässä  artikkelin työssä tutkijat ovat osoittaneet, että TRIM15 asettuu fokaaliadheesioihin dimerisoitumalla ja merkitsevästi vaimentaa solumigraatiota. B-box2 ja PRY-domeenit ovat essentiellit , jotta TRIM15 pystyy lokalisoitumaan fokaaliadheesioihin ja estämään solujen migroitumisen. Havaittiin myös että TRIM15 tekee interaktioita (integriiniadhesomitutkimuksessa) useaan proteiiniin, joista mainitaan koroniini 1B, kortaktiini, filamiinin sitoutuva LIMproteiini1 ja vasodilataattorilla stimuloituva fosfoproteiini , jotka osallistuvat aktiini-sytoskeleton dynamiikkaan. TRIM15 ilmenemä on kudoksiin rajoittuva ja paksunsuolen syövässä se on alassäätynyt. TRIM15 esiintymispitoisuudet assosioituivat kolonkarsinoomasolujen migroitumiseen ja tuumorin kasvuun. Tämä tutkimus antaa uutta oivallusta TRIM15: n osuuteen integriiniadhesomin lisäkomponenttina, solumigraation säätelijänä viitaten siihen, että TRIM15 saattaa toimia paksunsuolituumorin suppressorina.

• The tripartite motif containing (TRIM) proteins are a large family of proteins that have been implicated in many biological processes including cell differentiation, apoptosis, transcriptional regulation, and signaling pathways. Here, we show that TRIM15 co-localized to focal adhesions through homo-dimerization and significantly suppressed cell migration. Domain mapping analysis indicated that B-box2 and PRY domains were essential for TRIM15 localization to focal adhesions and inhibition of cell migration. Our protein-protein interaction screen of TRIM15 with the integrin adhesome identified several TRIM15 interacting proteins including coronin 1B, cortactin, filamin binding LIM protein1, and vasodilator-stimulated phosphoprotein, which are involved in actin cytoskeleton dynamics. TRIM15 expression was tissue-restricted and downregulated in colon cancer. Level of TRIM15 expression was associated with colon cancer cell migration, as well as both in vitro and in vivo tumor growth. These data provide novel insights into the role of TRIM15 as an additional component of the integrin adhesome, regulating cell migration, and suggest that TRIM15 may function as a tumor suppressor of colon cancer.

2. Clinical trial of gene-disease association and gene-environment interaction. (HuGE Navigator)
3. Observational study of gene-disease association. (HuGE Navigator)
4. Downregulation of TRIM11 and TRIM15 enhanced virus release suggesting that these proteins contribute to the endogenous restriction of retroviruses in cells.
   

Ilmeisesti TRIM15 osallistuu paxilliinin säätelyyn ja paxilliinin ylimääräinen ilmeneminen on tumorogeenista:

Paxilliini on tärkeä adaptorimolekyyli. Katson sen rakennetta ja funktion ulottuvuutta. Sillä voi olla osuutta moniin signaaliteihin. Siinä on monia motiiveja, joiden välityksellä se tekee proteiini-proteiiniliittymiä. LD- motiivin kautta se tekee liittymän TRIM15 proteiiniin. Ja näitten motiiviensa välityksellä se toimii monen sytoskeletaalisen proteiinin alustana ja ne taas rekrytoivat lisää proteiineja tähän fokaalisen adheesiokompleksiin. Paxilliini ilmeisesti osaltaan koordinoi signaaleita , joista sitten aiheutuu lopulta solujen leviäminen ja liikkuvuus. Paxilliini esiintyy laajemmin kudoksissa kuin TRIM15, ( TRIM15 vaikutus on rajoittunut ja on paikallinen rajoittuen lähinnä suolistoon, munuaiseen, sappirakkoon ja maksaan)

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11607845 Paxillin is a focal adhesion-associated, phosphotyrosine-containing protein that may play a role in several signaling pathways. Paxillin contains a number of motifs that mediate protein-protein interactions, including LD motifs, LIM domains, an SH3 domain-binding site and SH2 domain-binding sites. These motifs serve as docking sites for cytoskeletal proteins, tyrosine kinases, serine/threonine kinases, GTPase activating proteins and other adaptor proteins that recruit additional enzymes into complex with paxillin. Thus paxillin itself serves as a docking protein to recruit signaling molecules to a specific cellular compartment, the focal adhesions, and/or to recruit specific combinations of signaling molecules into a complex to coordinate downstream signaling. The biological function of paxillin coordinated signaling is likely to regulate cell spreading and motility. Clinical significanceof paxillin. Paxillin has been shown to have a clinically-significant role in patients with several cancer types. Enhanced expression of paxillin has been detected in premalignant areas of hyperplasia, squamous metaplasia and goblet cell metaplasia, as well as dysplastic lesions and carcinoma in high-risk patients with lung adenocarcinoma.[24] Mutations in PXN have been associated with enhanced tumor growth, cell proliferation, and invasion in lung cancer tissues.[25] During tumor transformation, a consistent finding is that paxillin protein is recruited and phosphorylated.[26] Paxillin plays a role in the MET tyrosine kinase signaling pathway, which is upregulated in many cancers.[27]

Päivitys 4.4. 2018