Leta i den här bloggen


tisdag 13 februari 2018

TRIM3 kuuluu p53 säätelyverkostoon. BERP- myös aivoissa

TRIM3  osalta löytyy  merkitseviä kliinisiä tietoja
TRIM3 kuuluu ryhmään TRIM-NHL. 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=TRIM3
Kaikki elimet joissa sitä ilmenee on kuvattu pylväin, eniten suolistossa, vähiten  haimassa. 

BERP; HAC1; RNF22; RNF97
Summary
The protein encoded by this gene is a member of the tripartite motif (TRIM) family, also called the 'RING-B-box-coiled-coil' (RBCC) subgroup of RING finger proteins. The TRIM motif includes three zinc-binding domains, a RING, a B-box type 1 and a B-box type 2, and a coiled-coil region. This protein localizes to cytoplasmic filaments. It is similar to a rat protein which is a specific partner for the tail domain of myosin V, a class of myosins which are involved in the targeted transport of organelles. The rat protein can also interact with alpha-actinin-4. Thus it is suggested that this human protein may play a role in myosin V-mediated cargo transport. Alternatively spliced transcript variants encoding the same isoform have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Expression
Ubiquitous expression in duodenum (RPKM 6.6), small intestine (RPKM 6.1) and 25 other tissues See more

GeneRIFs: Gene References Into FunctionsWhat's a GeneRIF?

Nivelreumassa TRIM 3 omaa  antiproliferatiivisen tehtävän. JosTRIM3 esiintymä vahvennettaan yliexpressioon, p53 ja p21 säätyvät  ylös. TNFalfa, Il1b, IL6 ja p38 säätyvät alas,  samoin sykliini D1 ja PCNA, jotka ovat  solusykliproliferaation edistäjiä.  Solusyklin  negatiivisia  säätelijöitä ovat p53ja p21.  
TRIM3 sitoutuu  nukleaariseen importiinikompleksiin ja pitää yllä kantasolun tasapainoa; tuumorikasvua se vaimentaa säätelemällä NICD , aktiivin NOTC1:n tumaankuljetusta - syöpäsolupuolestaan  häiritsee kantasolun uudistumisen  ja multipotenssin solun  erilaistumisen  sekä  asymmetrisen soluerilaistumisen keskeistä tasapainoa. 
 

Cancer stem cells exert enormous influence on neoplastic behavior, in part by governing asymmetric cell division and the balance between self-renewal and multipotent differentiation. Growth is favored by deregulated stem cell division, which enhances the self-renewing population and diminishes the differentiation program......tripartite motif-containing protein 3 (TRIM3), similarly suppressed NOTCH1 signaling and markedly attenuated the stem cell component. We also found that TRIM3 suppressed nuclear transport of active NOTCH1 (NICD) in glioblastoma and demonstrated that these effects are mediated by direct binding of TRIM3 to the Importin complex. Together, our results support a novel role for Brat/TRIM3 in maintaining stem cell equilibrium and suppressing tumor growth by regulating NICD nuclear transport.
TRIM3 stabiloi  p53:n  ja siten voisi vaikuttaa colon tuumorin suppressiota mutta on  tutkituissa  colonkarsinomasoluissa alassäätyneenä.  
TRIM kuuluu NHL-domeenin omaaviin  TRIM- perheen jäseniin.
Tutkimusten johtopäätös on, että  TRIM3 on maksasyövässä alassäätyneenä. Marköörinä  sen alassäätymä on huonon prognoosin merkki. TRIM3 on mahdollinen  terapeuttinen kohde   hepatosellulaarisessa syövässä.
  In conclusion, this study suggests that TRIM3 may play a significant role in HCC progression and acts as a valuable prognostic marker and potential therapeutic target for HCC.
 Cancer stem cells, capable of self-renewal and multipotent differentiation, influence tumor behavior through a complex balance of symmetric and asymmetric cell divisions. Mechanisms regulating the dynamics of stem cells and their progeny in human cancer are poorly understood.asymmetrically rather than symmetrically.
.... We conclude that TRIM3 acts as a tumor suppressor in GBM by restoring asymmetric cell division.


 TRIM-perheen merkitys syöpäbiologiassa on kasvamaan päin. Tämä TRIM3 omaa NHL-domaanin ja  sen kautta saattaa olla nisäkästuumoreitten vaimentaja. Jos TRIM3 ilmenemää vähennetään koehiirissä, niissä kiihtyy PDGF:n aiheuttama  glioomakasvu. TRIM3 voi sitoutua  CDK1-estäjään  p21 ja kerryttää sitä, jolloin  estyy CykliiniD1-CDK4   akkumulaatio . 

 reducing TRIM3 expression increased the incidence of and accelerated the development of platelet-derived growth factor -induced glioma in mice.  Furthermore, TRIM3 can bind to the cdk inhibitor p21(WAF1/CIP1). Thus, we conclude that TRIM3 is a tumor suppressor mapping to chromosome 11p15.5 and that it might block tumor growth by sequestering p21 and preventing it from facilitating the accumulation of cyclin D1-cdk4.
 
p53 on keskeinen tekijä soluperäisessä stressivasteessa ja useimpien kasvannaisten  vaimentajana. Kun on tunnistettu p53-signalointitien ainutlaatuisten molekyylien  verkosto,  voidaan saada selville   tämän tärkeän transkriptiotekijän  toimintoja . 
Tässä artikkelissa kuvataan aivojen BERP  tekijää (se on TRIM3).   Sen geeni-ilmenemä on riippuvainen p53:sta, genomin suojelijasta.  Niin ihmisessä kuin hiiressäkin. Poistogeenisillä tutkimuksilla  todettiin , että  aivoelektrisyydessä  näkyi vaikutusta GABA-järjestelmän  alueessa: postsynaptiset inhibitoriset virrat olivat  alempiamplitudisia ja reseptorialayksikkömäärä väheni. Pääteltiin, että BERP (=aivojen ilmentämä  RING finger proteiini, TRIM3)  saattaa toimia posttranskriptionaalisella tasolla GABAreseptoreiden solunsisäisen   liikehtimisen säätelyssä, sillä BERP- poisto ei kuitenkaan vähentänyt itse  GABA- reseptorien  mRNA:n määrää. Tutkijat  pitävät TRIM3/BERP geenituotetta ainutlaatuisena p53:a säätelevänä tekijänä  ja täten aivoissakin olisi   osatehtävää p53:lle. 

p53 is a central player in responses to cellular stresses and a major tumor suppressor. The identification of unique molecules within the p53 signaling network can reveal functions of this important transcription factor. Here, we show that brain-expressed RING finger protein (BERP) is a gene whose expression is up-regulated in a p53-dependent manner in human cells and in mice. We generated BERP-deficient mice by gene targeting and demonstrated that they exhibit increased resistance to pentylenetetrazol-induced seizures. Electrophysiological and biochemical studies of cultured cortical neurons of BERP-deficient mice showed a decrease in the amplitude of GABA(A) receptor (GABA(A)R)-mediated miniature inhibitory postsynaptic currents as well as reduced surface protein expression of GABA(A)Rs containing the gamma2-subunit. However, BERP deficiency did not decrease GABA(A)Rgamma2 mRNA levels, raising the possibility that BERP may act at a posttranscriptional level to regulate the intracellular trafficking of GABA(A)Rs. Our results indicate that BERP is a unique p53-regulated gene and suggest a role for p53 within the central nervous system 

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar