PHYSIOLOGICAL ROLE OF ZNFs. Skin.
- Sinkkisormiproteiinien osuudesta ihossa
Sinkkisormiproteiinit osallistuvat moniin fysiologisiin prosesseihin, koska ne pystyvät säätelemään geenien ilmentymistä. Näitä prosesseja ovat solujen proliferoituminen, erilaistuminen ja apoptoosi, joilla ne osallistuvat kudosten homeostaasin ylläpitoon. Esimerkkinä ZFP36, joka on RING-tyyppinen, mutta ei transkriptiotekijöitä, tunnetaan myös nimellä Tristetrapoliini , sekä ZFP36L1. Niillä on osuutta keratinosyytin biologian usean eri kohdan säätelyssä, kuten solujen proliferoitumisessa, erilaistumisessa ja ohjelmoidussa solukuolemassa eli apoptoosissa. Jos viljellyistä keratinosyyteistä estetään näiden kahden proteiinin ilmentyminen, aiheutuu apoptoosi ja solusyklin pysähtyminen G2/M-vaiheeseen. Jos tehdään näissä soluissa Zfp36 geenivaikutuksen poisto) (KO), aiheutuu soluissa lisäksi differentioitumisen merkkarin Keratiini-10:n lisääntynyt ilmentyminen, mikä viittaisi tämän proteiinin mahdolliseen osuuteen keratinosyyttien erilaistumisessa.
ZC3H -ryhmästä ZFP36 ja ZFP36L1
ZFP36 (19q13.2), https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7538Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)
TTP; G0S24; GOS24; TIS11; NUP475; zfp-36; RNF162A
Expression Ubiquitous expression in gall bladder (RPKM 274.6), bone marrow (RPKM 248.5) and 25 other tissues.Preferred Names: mRNA decay activator protein ZFP36
Names:
G0/G1 switch regulatory protein 24.
growth factor-inducible nuclear protein NUP475,
tristetraprolin,
tristetraproline,
zinc finger protein 36 homolog,
zinc finger protein 36, C3H type, homolog,
zinc finger protein, C3H type, 36 homolo.
ZFP36L1 (14q24.1), https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/677 BRF1; ERF1; cMG1; ERF-1; Berg36; TIS11B; RNF162B This gene is a member of the TIS11 family of early response genes, which are induced by various agonists such as the phorbol ester TPA and the polypeptide mitogen EGF. This gene is well conserved across species and has a promoter that contains motifs seen in other early-response genes. The encoded protein contains a distinguishing putative zinc finger domain with a repeating cys-his motif. This putative nuclear transcription factor most likely functions in regulating the response to growth factors. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2011]ExpressionUbiquitous expression in endometrium (RPKM 164.2), ovary (RPKM 123.6) and 25 other tissues
Preferred Names: mRNA decay activator protein ZFP36L1.
Names: EGF-response factor 1,
TPA-induced sequence 11b,
ZFP36-like 1,
butyrate response factor 1,
early response factor Berg36,
zinc finger protein 36, C3H type-like 1,
zinc finger protein 36, C3H1 type-like 1,
zinc finger protein, C3H type, 36-like 1.
ZNF (C2H2-tyyppiset KLF4 ja ZNF750
Eräs toinen sinkkisormiproteiini omaa ratkaisevan osuuden keratinosyyttien erilaistumisessa. Se on KLF4, C2H2-tyyppinen transkriptiofaktori. Epidermiksessa KLF4 todellakin ilmenee pääasiassa suprabasaalisissa kerroksissa, joissa se moduloi sellaisten geenien ilmentymistä, jotka osallistuvat keratinosyyttien erilaistumiseen (ECM1, SPINK5, CDSN, FLG ja LCE3). Kuva 2a selventää asiaa. Hiirellä KLF4-/-,tämän sinkkisormiproteiinin puuttuminen, johtaa ihon suojavallimuodostuksen muuntumiseen ja siitä seuraa sikiön kuolema pian syntymän jälkeen. Ja päinvastoin taas KLF4:n ektooppinen ilmentäminen transgeenisen hiiren epidermiksen basaalisissa keratinosyyteissä nopeuttaa erilaistumisprosessia johtaen varhaiseen epidermaaliseen barrierimuodostukseen.
Sinkkisormiproteiini ZNF750 (C2H2-tyyppinen ja transkriptiofaktori) vaikuttaa myös essentiellinä säätelijänä keratinosyyttien erilaistumisessa.
Epidermaalisen erilaistumisen aikana TP63:n transkriptio säätelee ZNF750:n ilmentymistä. josta sitten jatkossa suoraan aktivoituu KLF4:n ilmentyminen.
Kuitenkin tähän perusmekanismiin, jossa ZNF750 säätelee keratinosyyttien terminaalisen differentioitumisen, on viime vuosina lisätty kompleksisuuden kerrostumaa:
ZNF750 vaimentaa progeniittorigeenien (RBBP8, HOMER3) ilmentymistä tekemällä interaktion kromatiinia muokkaavien proteiinien kanssa (joita ovat RCOR1, REST ko-repressori 1; KDM1A, lysiinidemetylaasi 1A; CTBP1/2, C-terminaalinen sitova proteiini 1/2 ) aktivoiden erilaistumisgeenit (PPL, PKP1) tekemällä interaktion RCOR1:n, KLF4:n ja CTBP1/2:n kanssa.
Tästä on kuva 2a.
On havaittu ZNF750:n mutaatioiden aiheuttavan muuntumisia ZFN750:n transkription säätelyverkostoon keratinosyyttien erilaistumisen aikana ja tällaista muuntumista on osallisena tautien kehittymisessä kuten psoriaasissa.
KLF4, (9q31.2), Krüppel like factor 4 ; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/9314, EZF; GKLF.
This gene encodes a protein that belongs to the Kruppel family of transcription factors. The encoded zinc finger protein is required for normal development of the barrier function of skin. The encoded protein is thought to control the G1-to-S transition of the cell cycle following DNA damage by mediating the tumor suppressor gene p53. Mice lacking this gene have a normal appearance but lose weight rapidly, and die shortly after birth due to fluid evaporation resulting from compromised epidermal barrier function. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Sep 2015].
Preferred Names Krüppel-like factor 4.
Names:
Kruppel-like factor 4 (gut),
endothelial Kruppel-like zinc finger protein,
epithelial zinc finger protein EZF,
gut Kruppel-like factor, (GKLF)
gut-enriched krueppel-like factor.
ZNF750 (17q25.3), ZFP750
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/79755 ,
ZFP750. This gene encodes a protein with a nuclear localization site and a C2H2 zinc finger domain. Mutations in this gene have been associated with seborrhea-like dermatitis with psoriasiform elements. [provided by RefSeq, Jul 2008] Expression Biased expression in esophagus (RPKM 37.2), skin (RPKM 25.3) and 5 other tissues See more
Preferred Names: zinc finger protein 750.
Names: protein ZNF750.
Käännös 2.6. 2019
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar