Leta i den här bloggen


torsdag 6 juni 2019

ZNF proteiini neurodegeneratiivisissa taudeissa ZNF179 (RNF112, neurolastiini, BFP), ZNF749 (PARIS,parkin interacting) ja ZPR1(ZNF259)

M.Cassandri  (2017) ottaa näistä proteiineista esimerkiksi  ZNF179 ja ZNF746 ja ZPR1 (ZNF259) sinkkisormiproteiinit.
PubMed tietolähde näistä:


BFP; ZNF179. This gene encodes a member of the RING finger protein family of transcription factors. The protein is primarily expressed in brain. The gene is located within the Smith-Magenis syndrome region on chromosome 17. [provided by RefSeq, Jul 2008]. Preferred Names: RING finger protein 112.
Names: brain finger protein,
neurolastin,
zinc finger protein 179.

Related articles in PubMed
GeneRIFs: Gene References Into Functions

Our results showed that Znf179 interacted with Plzf, resulting in its translocation from cytoplasm to the nucleus and increase of Plzf protein abundance. Although the precise nature and role of the Znf179-Plzf interaction remain to be elucidated, both of these two genes are involved in the regulation of neurogenesis. Our finding provides further research direction for studying the molecular functions of Znf179. 

Suomennosta  6.6. 2019 M. Casasndrin artikkelista ( 2017) .
ZNF 179  (neurodegeneratiivisdessa taudissa . Aivospesifinen  dynamiiniperheen GTPaasi neurolastiini RNF112/ZNF179).

"ZNF179 on C4-tyyppinen , ei transkriptiofaktori sinkkisormiproteiini, joka kuuluu RING-finger- alaluokkaan.  Sen ilmentymä on rajoittunut aivoon, mikä viittaisi sen osuuteen keskushermostojärjeselmässä.  Sillä näyttääkin olevan  hermostoon viittaava nimikin: neurolastiini.
ZNF179:n ilmentymän  estäminen  vähentää neuronien erilaistumista, differentioitumista, . P19-soluissa ja pikkuaivojen granulaaristen solujen primaariviljelmässä , koska estyy solusyklin progredioituminen - vlittäviä tekijöitä ovat p35 säätely ja p27-proteiinin kertyminen. Viime aikoina on myös osoitettu ZNF179:n olevan antiapoptoottinen hiiren AD - mallissa , APPTg-astrosyyteissä. Tämä vaikutus johtuu osaksi IGB3:n ja Bik- expressioiden  estymisestä."  



C4- type  ZNF, non-transcriptional factor.  , KRAB (Krüppel-Associated Box) and ZNF  protein
Preferred Names: zinc finger protein 746.
Names: parkin-interacting substrate,
ZNF259. The protein encoded by this gene is found in the cytoplasm of quiescent cells but translocates to the nucleolus in proliferating cells. The encoded protein interacts with survival motor neuron protein (SMN1) to enhance pre-mRNA splicing and to induce neuronal differentiation and axonal growth.
Defects in this gene or the SMN1 gene can cause spinal muscular atrophy. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2015]
Preferred Names: zinc finger protein ZPR1
Names: zinc finger protein 259.

Related articles in PubMed.  (Näissä  allaolevissa  artikkeleissa en havaitse mainintaa SMA1 taudista, joten katson myös  viitteen SMA1 geenistä).
GeneRIFs: Gene References Into Functions
(6.6. 2019 Suomennosta M. Cassandrin tekstistä.)  ZPR1 neurodegeneratiivsessa taudissa:

"Sinkkisormiproteiinien on osoitettu olevan tärkeitä myös  neuraalisten tautien patogeneesissä. SMA, spinaalinen lihasatrofia, on harvinainen tauti, jota luonnehtii alfa-motoristen  neuronien kato selkäytimen  etusarvesta sekä progressiivinen liahsten kuihtuminen. Tauti saataa johtaa usein  varhaiseen menehtymiseen.  Taudin syynä on mutaatio SMN1- geenissä, jonka nimi on Survival Motor Neuron 1.  Mutatoitumisesta johtuu täyspitkän SMN-proteiinin alentunut ilmentymä. SMN-proteiini on välttämätön motoristen neuronien elossapysymiselle. Ensimmäinen näyttö   sinkkisormiproteiinin ZPR1(ZNF259) mahdollisesta osuudesta SMA-tautiin saatiin kokeellisesta havainnosta: Nähtiin SMN-proteiinin tekevän interaktiota  ZPR1:n kanssa. ZPR1 on C4- tyyppinen  sinkkisormiproteiini, joka ei ole transkriptiofaktori. 
Tämän interaktion seurauksena kompleksi sijoitautui uudelleen sytoplasman puolelta tuman puolelle. havaittiin, että tämä prosessi oli haittaantunut 1-tyypin SMA-tautia potevilla.  Havainto sai lisävahvistusta, kun  saatiin osoitettua, että vaikeaa SMA-tautia  sairastavilla oli ZPR1-pitoisuudet matalia. Edelleen  saatiin raporttia hiirikokeista:  ZPR1- mutaatiot aiheuttivat hiirialkioiden kuolleisuutta.  Myös ZPR1-ilmentymän vähenemä tuotti hiirillä lisääntyvää spinaalisten motoristen neuronien katoa, samanlaista fenotyyppiä kuin niillä hiirillä, joiden smn-geeni oli vähentynyt.. Tämä viittaisi siihen, että SMA-potilailla esiintyvistä  matalammista ZPR1- ilmentymistä
 voi seurata vaikutusta SMA-taudin vaikeusasteeseen".
SMA1 tauti on harvinainen. 

SMA1 geenin tilanteen osuus:
Also known as  SMA; SMN; SMA1; SMA2; SMA3; SMA4; SMA@; SMNT; BCD541; GEMIN1; TDRD16A; T-BCD541
Summary  This gene is part of a 500 kb inverted duplication on chromosome 5q13. This duplicated region contains at least four genes and repetitive elements which make it prone to rearrangements and deletions. The repetitiveness and complexity of the sequence have also caused difficulty in determining the organization of this genomic region. The telomeric and centromeric copies of this gene are nearly identical and encode the same protein. However, mutations in this gene, the telomeric copy, are associated with spinal muscular atrophy; mutations in the centromeric copy do not lead to disease. The centromeric copy may be a modifier of disease caused by mutation in the telomeric copy. The critical sequence difference between the two genes is a single nucleotide in exon 7, which is thought to be an exon splice enhancer. Note that the nine exons of both the telomeric and centromeric copies are designated historically as exon 1, 2a, 2b, and 3-8. It is thought that gene conversion events may involve the two genes, leading to varying copy numbers of each gene. The protein encoded by this gene localizes to both the cytoplasm and the nucleus. Within the nucleus, the protein localizes to subnuclear bodies called gems which are found near coiled bodies containing high concentrations of small ribonucleoproteins (snRNPs). This protein forms heteromeric complexes with proteins such as SIP1 and GEMIN4, and also interacts with several proteins known to be involved in the biogenesis of snRNPs, such as hnRNP U protein and the small nucleolar RNA binding protein. Multiple transcript variants encoding distinct isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2014]
Expression  Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 24.8), testis (RPKM 21.9) and 25 other tissues See more
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31138677
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31060440
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30842449

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar