DNA synteesi vaatii paljon energiaa (dNTP) ja kun nukleotidi on liitetty runkoon, jokaisesta liitännästä jää yksi PPi, pyrofosfaatti, joten repliakaatio tuottaa runsaasti pyrofosfaatia. Ja päinvastoin: Neuroni, joka ei jakaudu , ei niin tuota pyrofosfaattia normaalisti ellei siinä ole jokin virus jakaantumassa.
https://en.wikipedia.org/wiki/Pyrophosphate
Mikä on replikaation yhteydessä syntyvän pyrofostaatin (PPI) jatkotie?
Tästä sivutuotteesta löytyy tekstiä:
PPi määrä inhiboi nukleiinihapposynteesiä pyrofosforolyysi-tietä , joka reversoi polymeraasireaktiota ja rajoittaa DNA/RNA-synteesiä. Inorgaanisen pyrofosfaattin (PPi) tuottuminen on osa DNA/RNA synteesin kehossa tapahtuvasta tiestä, jossa polymerisaatio on essentiellisti palautumatonta laatua pyrofosfaatin (PPi) irrottua. Inorgaanista pyrofosfaattia (PPi) hajoittava entsyymi PPaasi katalysoi PPi:n hydrolyysin, jolloin muodostuu kaksi ortofosfaattia. Inorgaanisen pyrofosfataasin tehtävänä lienee pyrofosfaatin poissaaminen paikalta ja niitten mekanististen tulosten kohentaminen, jotka ovat erittäin herkkiä pyrofosfaatin akkumuloitumiselle kuten SBE, yksittäisen emäksen poistaminen ja Sangerin sekventoiminen, ottaen erityisesti huomioon selektiivinen juosteen heikkous. Inorgaanisen pyrofosfaatin hajoittajaentsyymi voi suuresti lisätä in vitro transkriptioreaktion tuotteita.
P2O7-4 H2O → 2HPO4-2
http://www.affymetrix.com/catalog/131330/USB/Pyrophosphatase+Inorganic+Recombinant#1_1
SITAATTI:
Source:
Purified from E. coli cells expressing the cloned ppa gene(1) from Saccharomyces cerevisiae (Baker’s Yeast).
Description:DNA and RNA polymerase reactions, as well as other enzymatic reactions, generate inorganic pyrophosphate as a by-product. This by-product inhibits nucleic acid synthesis through a process called pyrophosphorolysis which reverses the polymerization reaction and limits DNA/RNA synthesis. Inorganic pyrophosphatase is part of the DNA/RNA synthesis pathway in vivo, rendering polymerization essentially irreversible by removing pyrophosphate(2). Inorganic pyrophosphatase (PPase) catalyzes the hydrolysis of inorganic pyrophosphate to form two molecules of orthophosphate(3):
P2O7-4 H2O → 2HPO4-2
Inorganic pyrophosphatase may be used to remove pyrophosphate and improve the results of techniques that are particularly sensitive to its accumulation such as single-base extension (SBE)(4) and Sanger sequencing, especially with regard to selective band weakening(5,6). Also, inorganic pyrophosphatase can greatly increase the yield of in vitro transcription reactions(7).
Purified from E. coli cells expressing the cloned ppa gene(1) from Saccharomyces cerevisiae (Baker’s Yeast).
Description:DNA and RNA polymerase reactions, as well as other enzymatic reactions, generate inorganic pyrophosphate as a by-product. This by-product inhibits nucleic acid synthesis through a process called pyrophosphorolysis which reverses the polymerization reaction and limits DNA/RNA synthesis. Inorganic pyrophosphatase is part of the DNA/RNA synthesis pathway in vivo, rendering polymerization essentially irreversible by removing pyrophosphate(2). Inorganic pyrophosphatase (PPase) catalyzes the hydrolysis of inorganic pyrophosphate to form two molecules of orthophosphate(3):
P2O7-4 H2O → 2HPO4-2
Inorganic pyrophosphatase may be used to remove pyrophosphate and improve the results of techniques that are particularly sensitive to its accumulation such as single-base extension (SBE)(4) and Sanger sequencing, especially with regard to selective band weakening(5,6). Also, inorganic pyrophosphatase can greatly increase the yield of in vitro transcription reactions(7).
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar