Leta i den här bloggen


fredag 6 september 2019

Zf-C2H2 on iso ryhmä ja siitä löytyy ZSCAN geenejä joukosta

https://www.genenames.org/data/genegroup/#!/group/28
SCAN ja  Krabb sekä SCAN  domeeneja sisältäviä geenejä havaitsin  yli 50.    Näillä geeneillä oli  ryhmänimiä  ZNF-luettelossa jossa saattoi olla   jo numero 990  olemassa.
ZFP- ryhmnimiä  ilmeni myös  ja numerot olivat useita kymmeniä, .
ZSCAN -numeroita  havaitsin  ainakin 54.ään asti
ZKSCAN numeroita ilmeni 24:ään asti.
Sinkkisormiproteiinit ilmenivät klustereina.

Tässä tarkkasin tuon myeloisen sinkkisormiproteiini MZF1:n geenin  sijaintikohtaa  19q13.43 ja huomasin että hyvin usea  ZSCAN ja ZKSCANgeeni lokalisoitui  siihen kohtaan ja  niiden lisäksi  hyvin moni ZNF- proteiini, jolla ei ollut Krab tai  SCAN domeenia.

SNAIL  ja SLUG kuuluvat tähän  Zf- C2H2 ryhmään.

2.11. 2019:
Lisäys, SCAn, KRABB domeeneihin  lisätään myös POZ-(BTB) eräissä C2H2- sinkkisormiproteiineja kuvaavassa artikkelissa.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC86980/
Näistä tarkemmin Kelch superperhettä koskevissa muistiinpaoissa. 
BTB/POZ- domaaneja on KLHL ja KBTBD- alaperheissä  Kelch-superperheen perheen proteiineilla


Inga kommentarer:

Skicka en kommentar