TRIM5alfa rakenteesta. C-IV alaryhmä

Tämä on ehkä kaikkein kuvatuin ja tutkituin TRIM ja herättänyt kiinnsotusta siksi kun sillä on retroviruksen vastaista aktiivisuutta

https://www.semanticscholar.org/paper/Restriction-factors-of-retroviral-replication%3A-the-Kajaste-Rudnitski-Pultrone/7a9f7c50955a578c11b72a6896653015e0cf53f1


Alla on kaavakuva  kolmesta TRIM alaluokasta

C_IV alaluokassa on C-terminaalissa PRY/SPRY tai  SPRY tai PRY.
RING domeeni on tässä kuvattu punaisena.
B-Box 1 ja Bbox 2 on vihreitä
Helikaalinen Coiled coil domaani  on kuvattu keltaisena.
 keskimmäinen TRIM- kaava  pätee  moneen C_IV alaluokan  TRIM molekyyliin kuten TRIM5alfa ja TRIM22.  

Alaluokka määräytyy C-terminaalista. Tässä kuvassa C-terminaali on  B30.2 SPRY.
 TRIM5alfa rakenteessa on vain yksi Bbox ja se on  Bbox2.  Samaa tyyppiä ovat TRIM22, 34,45, 64, 65.
Alin kaava:  Luokittelematon  TRIM-PRY/SPRY on TRIM on 14, koska siinä ei ole RING domeenia ja sitä ei myöskään ole TRIM20:llä, mutta sillä on N-terminaali  pyrin-domeeni.  Myös TRIM16 on ilman RING-domeenia,  samoin  51 SPRYDS. 

Ylin motiivi on N-terminaalia, joka  esiintyy   monessa luokassa  (C-I, C_III, C_VI,C_IX, C_X.)
C-V ei omaa muita domeeneja kuin nuo mitä ylärivillä näkyy, vähimmillään vain RING ja yksi Bbox riittää  luokan C_V tunnukseksi.

Fig. 1 Schematic structure of the domains present in the C-IV class of TRIM/RBCC family. The TRIM/RBCC proteins share RING, B1, B2 and coiled-coil domains whereas the C-terminals are variable. The C-terminal domains determine the classification of the 72 human TRIM proteins in 11 subfamilies while one group (including TRIM14 and TRIM20) remains unclassified due to the lack of a RING domain (Carthagena et al. 2009). The C-IV subfamily that includes the TRIM5 and TRIM22 members is characterized by the presence of the only B-box 2