Guaniinipitoiset G-quadruplexes, merkitys? TRIM13 omaa G-quadruplexrakennejaksoja

J Nucleic Acids. 2018 Jan 31;2018:5307106. doi: 10.1155/2018/5307106. eCollection 2018.

Electrochemical and AFM Characterization of G-Quadruplex Electrochemical Biosensors and Applications.

Chiorcea-Paquim AM¹, Eritja R², Oliveira-Brett AM¹.

Author information

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29666699

Tiivistelmä. Abstract

 Guaniinipitoiset  DNA-jaksot pystyvät  tekemään  G-quadruplex-muodostumia  ja ne osallistuvat
tärkeisiin biologisiin prosesseihin ja edustavat  itsestään kokoontuvaa nanomatriaalia, jota lisääntyvästi käytetään DNA-nanoteknologiassa ja biosensoriteknologiassa.  G-quadruplex- elektrokemiallisett  biosensorit ovat saaneet erityistä huomiota, koska
elektrokemiallinen vaste on  erityisen sensitiivinen DNA:n struktuurimuutoksille  ssDNA-, dsDNA- tai hairpin- muodosta  G-quadruplex konfiguraatioon.

• Guanine-rich DNA sequences are able to form G-quadruplexes, being involved in important biological processes and representing smart self-assembling nanomaterials that are increasingly used in DNA nanotechnology and biosensor technology. G-quadruplex electrochemical biosensors have received particular attention, since the electrochemical response is particularly sensitive to the DNA structural changes from single-stranded, double-stranded, or hairpin into a G-quadruplex configuration. 

Lisäksi    G-quadruplex aptameerien  kehittelyssä   määrä kasvaa  ja niissä kombinoidaan G-quadruplexien jäykkyys ja itsestään koostumisen monipuolinen kyky aptameerin  korkeaan spesifiseen sitoutumiskykyyn  erilaisiin molekulaarisiin kohteisiin ja näin mahdollistuu eyhä  selektiivisempien ja sensitiivisempien biosensoreitten  sommittelu.

• Furthermore, the development of an increased number of G-quadruplex aptamers that combine the G-quadruplex stiffness and self-assembling versatility with the aptamer high specificity of binding to a variety of molecular targets allowed the construction of biosensors with increased selectivity and sensitivity. 

 Tässä katsauksessa keskustellaan viimeaikaisista edistymisistä   G-quadruplex-tyyppisten elektrokemiallisten biosensoreiden  metallijonien, G-guadruplexligandien, pienten orgaanisten molekyylien, proteiinien ja solujen   arviointikyvyn   elektrokemiallisessa  luonnehtimisessa , designissa   ja sovellutuksissa.  Esitellään  G-quadruplexkonfiguraatioiden  elektrokemiallinen ja   nanoteknikan alueen  atomivoimamikroskoopilla avulla tehty luonnehdinta.  Pohditaan  inkubaatioajan  ja kationipitoisuuden riippuvuudesta kontrolloitaessa  G-quadruplex laskostumaa, stabiliteettia  ja nanostruktuurimuodostumaa hiilielektrodeilla.  Käydään jälleen läpi  erilaisia G-quadruplex-elektrokemiallisia biosensoridesign strategioita , jotka perustuvat DNA_n laskostumiselle G-quadrulexkonfiguraatioon,  G-quadruplexaptameerien käyttöä ja  hemiini/Q-quadruplex DNAentsyymien käyttöä.

• This review discusses the recent advances on the electrochemical characterization, design, and applications of G-quadruplex electrochemical biosensors in the evaluation of metal ions, G-quadruplex ligands, and other small organic molecules, proteins, and cells. The electrochemical and atomic force microscopy characterization of G-quadruplexes is presented. The incubation time and cations concentration dependence in controlling the G-quadruplex folding, stability, and nanostructures formation at carbon electrodes are discussed. Different G-quadruplex electrochemical biosensors design strategies, based on the DNA folding into a G-quadruplex, the use of G-quadruplex aptamers, or the use of hemin/G-quadruplex DNAzymes, are revisited.

PMID:29666699 PMCID: PMC5831849 DOI: 10.1155/2018/5307106

 

 

Otin tämän artikkelin talteen, koska TRIM-rakenne käyttää tätä  G-quadruplex tekniikkaa ja omaa  ainutlaatuisia  ominaisuuksia.

  https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/55/G-quadruplex_gene_regulation.jpg/400px-G-quadruplex_gene_regulation.jpg

 

 

 

Muistiin 21.4. 2018