Leta i den här bloggen


onsdag 13 mars 2024

Silmäys AGAP2 geeniin Centaurin Gamma 1 (12q14.1) Onkogeenisiäkin ominaisuuksia, superkiihdyttäjien joukkoa.

Tämä Gammakentauriini1 on PI3K  fosfoinositidi-2 kinaasientsyymin kiihdyttäjä tumassa
ja on  syöpäkasvaimissa ylössäätyneenä ja välittää hermon kasvutekijän antiapoptoottisia vaikutuksia , joten se edistää tuumorin invasoitumista.  Vaihtoehtoisesti pleissautuneita variantteja isoformeja on kuvattu tästä geenistä.

 https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=AGAP2&keywords=AGAP2

 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37432454/

aliases for AGAP2 Gene

GeneCards Symbol: AGAP2 2
ArfGAP With GTPase Domain, Ankyrin Repeat And PH Domain 2 2 3 5
CENTG1 3 4 5
Arf-GAP With GTPase, ANK Repeat And PH Domain-Containing Protein 2 3 4
Phosphatidylinositol 3-Kinase Enhancer 3 4
Centaurin, Gamma 1 2 3
GGAP2 3 4
PIKE 3 4
Arf GAP With GTP-Binding Protein-Like, ANK Repeat And PH Domains 2 3
GTP-Binding And GTPase Activating Protein 2 3
GTP-Binding And GTPase-Activating Protein 2 4
Phosphoinositide 3-Kinase Enhancer 3
Centaurin-Gamma-1 4
KIAA0167 4
AGAP-2 4
Cnt-G1 
  • The protein encoded by this gene belongs to the centaurin gamma-like family. It mediates anti-apoptotic effects of nerve growth factor by activating nuclear phosphoinositide 3-kinase. It is overexpressed in cancer cells, and promotes cancer cell invasion. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

 
Geenin koodamaa proteiini omaa AGAP2 on  ArfGAP, jolla on GTPaase-domaani, ankyriinitoisto ja PH-domaani, 2. Tätä esiintyy seuraavissa   biologisissa kohdissa:  Hermojärjestelmän kehityksen alueessa  ja maksasolun kasvuitekijänreseptorin signalointiteissä. Geeniontologian puolelta on teitoja : Tämä geenikoodaa proteiinia, joka omaa  GTP:tä sitovan ja GTPaasia aktivoivan  aktiivisuuden. Geenin tärkjeä  paralogi on AGAp1.

  • GeneCards Summary for AGAP2 Gene  AGAP2 (ArfGAP With GTPase Domain, Ankyrin Repeat And PH Domain 2) is a Protein Coding gene. Among its related pathways are Nervous system development and Hepatocyte growth factor receptor signaling. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include GTP binding and GTPase activator activity. An important paralog of this gene is AGAP1.
 Yhteenvetoa geenistä.  ARF1- ja ARF5 proteiinien tarvitsemaa  GTPaasia  aktivoiva proteiini (GAP), ,jonka  akttivoiva kyky  on vahvaa. 
Isoformi 1 osallistuu neuronaalisen ohjelmoidun solukuoleman eli apoptoosin  ehkäisemiseen  kiihdyttämällä PI3-kinaasientsyymin aktiivisuutta (fosfatidyyli-inositolin- 3-aseman  fosforylointia)  . Se avustaa metabotrooppisen glutamiinireseptorin numero 1 (GRM1)  kytkeytymistä  sytoplasmiseen PI3-kinaasiin tekemällä vuorovaikutuksen  Homer-tukiproteiinijoukon kanssa  ja näyttää siltä, että se myös välittää  NGF- hermonkasvutekijn antiapoptoottisia vaikutuksia aktivoimalla tumankin  puolella olevaa PI3K entsyymiä.
 Isoformi numero 2  ei stimuloi PI3-kinaasia, mutta saattanee suojata soluja apoptoosilta stimuloimalla Akt- entsyymiä . Se säätää myös  adaptoriproteiinista ( AP-1) riippuvaa  proteiinien liikehdintää endosomaalisessa verkostossa. Näyttää siltä,että se on onkogeeni. Se on syöpäsolussa ylössäätynyt, estää apoptoosia ja edistää  syöpäsolun invasoitumista.
UniProtKB/Swiss-Prot Summary for AGAP2 Gene
  • GTPase-activating protein (GAP) for ARF1 and ARF5, which also shows strong GTPase activity. Isoform 1 participates in the prevention of neuronal apoptosis by enhancing PI3 kinase activity. It aids the coupling of metabotropic glutamate receptor 1 (GRM1) to cytoplasmic PI3 kinase by interacting with Homer scaffolding proteins, and also seems to mediate anti-apoptotic effects of NGF by activating nuclear PI3 kinase
  •  Isoform 2 does not stimulate PI3 kinase but may protect cells from apoptosis by stimulating Akt. It also regulates the adapter protein 1 (AP-1)-dependent trafficking of proteins in the endosomal system. 
  • It seems to be oncogenic. It is overexpressed in cancer cells, prevents apoptosis and promotes cancer cell invasion. ( AGAP2_HUMAN,Q99490 )

    Protein attributes for AGAP2 Gene

    Size:1192 amino acids
    Molecular mass: 124674 Da

    Quaternary structure:

    • Isoform 1 interacts with EPB41L1, PLCG1, NF2, HOMER1 and HOMER2 (By similarity).
      Isoform 2 interacts with activated AKT1 in the presence of guanine nucleotides, and with the AP-1 complex.
  
Gene Families for AGAP2 Gene
Protein Domains for AGAP2 Gene
InterPro:
Blocks:
  • Pleckstrin-like
  • Ankyrin repeat signature
  • HIV Rev interacting protein signature
  • Miro-like
Suggested Antigen Peptide Sequences for AGAP2 Gene
GenScript: Design optimal peptide antigens:
  • Phosphatidylinositol-3-kinase enhancer (AGAP2_HUMAN)
UniProtKB/Swiss-Prot:
AGAP2_HUMAN :
  • G domain binds GTP and has GTPase activity.
  • Belongs to the centaurin gamma-like family.
Domain:
  • G domain binds GTP and has GTPase activity.
  • Arf-GAP domain interacts with G domain and may regulate its GTPase activity.
  • Although both PH domains of isoforms 1 and 2 bind phospholipids, they differently regulate subcellular location. PH domain of isoform 1 directs the protein to the nucleus, but PH domain of isoform 2 directs it to the cytosol. PH domain of isoform 2 is required for binding to AP-1.
Family:
  • Belongs to the centaurin gamma-like family.

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar