Leta i den här bloggen


fredag 15 mars 2024

ETS-geenien perhe WIKIPEDIASSA

 Mitä ovat ETS-geenit? Tämä geeniperhe on yksi suurimmista transskriptiofaktoreiden joukossa. Wikipedian mukaan niitä on ihmisellä 29 geeniä. hiirellä 28 , banaanikärpäsellä vain 9. ETS -nimi tulee  englantilaisista sanoista " erytroblastitransformaatiospesifinen".  Geeniperheen jäseniä on havaittu useiden kudosten kehityksessä ja myöskin syövän etenemisessä.Wikipedia taulukoi 12  alaperhettä joihin ihmisen 29 geeniä sijoittautuu. ETS-perheen jäsenillä on  rakenteessaan tunnusomaista  DNA:ta sitova  ETS-domeeni, joka voi tehdä myös proteiini-proteiini-interaktioita. 

Eräiden sarkoomatyyppien yhteydessä mainittin osatekijänä  ETS-proteiinin kanssa  fuusion muodostaneita geenejä, fuusiogeenejä, joten tarkistan tämän ETS-ryhmän ensinnäkin.

https://en.wikipedia.org/wiki/ETS_transcription_factor_family

 In the field of molecular biology, the ETS (E26 transformation-specific[2] or E-twenty-six. (Erythroblast Transformation Specific)[3]) family is one of the largest families of transcription factors and is unique to animals. There are 29 genes in humans, 28 in the mouse, 10 in Caenorhabditis elegans and 9 in Drosophila. The founding member of this family was identified as a gene transduced by the leukemia virus, E26. The members of the family have been implicated in the development of different tissues as well as cancer progression.

Subfamily Mammalian family members Invertebrate orthologs
ELF ELF1, ELF2 (NERF), ELF4 (MEF)
ELG GABPα ELG
ERG ERG, FLI1, FEV
ERF ERF (PE2), ETV3 (PE1)
ESE ELF3 (ESE1/ESX), ELF5 (ESE2), ESE3 (EHF)
ETS ETS1, ETS2 POINTED
PDEF SPDEF (PDEF/PSE)
PEA3 ETV4 (PEA3/E1AF), ETV5 (ERM), ETV1 (ER81)
ER71 ETV2 (ER71)
SPI SPI1 (PU.1), SPIB, SPIC
TCF ELK1, ELK4 (SAP1), ELK3 (NET/SAP2) LIN
TEL ETV6 (TEL), ETV7 (TEL2) YAN
Structure All ETS (Erythroblast Transformation Specific) family members are identified through a highly conserved DNA binding domain, the ETS domain, which is a winged helix-turn-helix structure that binds to DNA sites with a central GGA(A/T) DNA sequence. As well as DNA-binding functions, evidence suggests that the ETS domain is also involved in protein-protein interactions. There is limited similarity outside the ETS DNA binding domain. Other domains are also present and vary from ETS member to ETS member, including the Pointed domain, a subclass of the SAM domain family.

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar