Mitä ovat ETS-geenit? Tämä geeniperhe on yksi suurimmista transskriptiofaktoreiden joukossa. Wikipedian mukaan niitä on ihmisellä 29 geeniä. hiirellä 28 , banaanikärpäsellä vain 9. ETS -nimi tulee englantilaisista sanoista " erytroblastitransformaatiospesifinen". Geeniperheen jäseniä on havaittu useiden kudosten kehityksessä ja myöskin syövän etenemisessä.Wikipedia taulukoi 12 alaperhettä joihin ihmisen 29 geeniä sijoittautuu. ETS-perheen jäsenillä on rakenteessaan tunnusomaista DNA:ta sitova ETS-domeeni, joka voi tehdä myös proteiini-proteiini-interaktioita.
Eräiden sarkoomatyyppien yhteydessä mainittin osatekijänä ETS-proteiinin kanssa fuusion muodostaneita geenejä, fuusiogeenejä, joten tarkistan tämän ETS-ryhmän ensinnäkin.
https://en.wikipedia.org/wiki/ETS_transcription_factor_family
In the field of molecular biology, the ETS (E26 transformation-specific[2] or E-twenty-six. (Erythroblast Transformation Specific)[3]) family is one of the largest families of transcription factors and is unique to animals. There are 29 genes in humans, 28 in the mouse, 10 in Caenorhabditis elegans and 9 in Drosophila.
The founding member of this family was identified as a gene transduced
by the leukemia virus, E26. The members of the family have been
implicated in the development of different tissues as well as cancer
progression.
Subfamily | Mammalian family members | Invertebrate orthologs |
---|---|---|
ELF | ELF1, ELF2 (NERF), ELF4 (MEF) |
|
ELG | GABPα | ELG |
ERG | ERG, FLI1, FEV |
|
ERF | ERF (PE2), ETV3 (PE1) |
|
ESE | ELF3 (ESE1/ESX), ELF5 (ESE2), ESE3 (EHF) |
|
ETS | ETS1, ETS2 | POINTED |
PDEF | SPDEF (PDEF/PSE) |
|
PEA3 | ETV4 (PEA3/E1AF), ETV5 (ERM), ETV1 (ER81) |
|
ER71 | ETV2 (ER71) |
|
SPI | SPI1 (PU.1), SPIB, SPIC |
|
TCF | ELK1, ELK4 (SAP1), ELK3 (NET/SAP2) | LIN |
TEL | ETV6 (TEL), ETV7 (TEL2) | YAN |
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar