CRL E3 ubikitiiniligaasikompleksien alaryhmät CLR 1-7 . Erityisesti CLR3-alaryhmä.

CRL ubikitiiniryhmän alaryhmiä ovat SCF, VHL, BTB, ASB
Olen jo vähän katsonut VHL ja ASB  Cullin-RING  Ligaaseja.  Nyt  katson BTB- ryhmää.

 Abstraktista tiivistelmää suomeksi.

• CUL3-pohjaiset ubikitiiniligaasit ovat imettäväissoluissa erilaistumisen mestarisäätelijöitä.

 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29249570

Trends Biochem Sci. 2018 Feb;43(2):95-107. doi: 10.1016/j.tibs.2017.11.010. Epub 2017 Dec 14.

Cullin 3-Based Ubiquitin Ligases as Master Regulators of Mammalian Cell Differentiation.Dubiel W¹, Dubiel D², Wolf DA³, Naumann M². Abstract

•  Ubikitiini-proteosomijärjestelmän spesifisyyttä kontrolloivat E3-ubikitiiniligaasit ja niiden pääasiallisimmat edustajat  CLR. monialayksikköiset  cullin-RING ubikitiiniligaasit. Näitä CLR- ryhmäläisiä on  yli 200 ja ne ovat jaettu seitsemään  perheeseen sen perusteella, mitä rakenteellisia tukiyksiköitä niihin kuuluu (CUL1-7).  Parin viimeksikuluneen vuosikymmenen aikana  on selvinnyt, että eri CLR-perheet ovat erilaistuneet  täydellistämään spesifisiä solufunktioita.

Specificity of the ubiquitin proteasome system is controlled by ubiquitin E3 ligases, including their major representatives, the multisubunit cullin-RING ubiquitin (Ub) ligases (CRLs). More than 200 different CRLs are divided into seven families according to their cullin scaffolding proteins (CUL1-7) around which they are assembled. Research over two decades has revealed that different CRL families are specialized to fulfill specific cellular functions.

• CLR1-perusteisista  CRL-ryhmistä moni CRL1 ubikityloi solusyklin säätelijöit.
• CLR2:  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18775313/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18775313/
•  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18187417/
• CLR5:  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18187417/
• CRL4-kompleksit assosioituvat usein  kromatiiniin kontrolloiden DNA-aineenvaihduntaa.

 Whereas many CUL1-based CRLs (CRL1s) ubiquitylate cell cycle regulators, CRL4 complexes often associate with chromatin to control DNA metabolism.

• MSC-solujen erilaistumisohjelmaa koskeviin tutkimuksiin perustuen tutkijat ehdottavat CLR3-kompleksien kehittyneen  täydellistämään  olennaista osuutta nisäkässolujen erilaistumisessa. MSC- on mesenkymaalinen kantasolu, jonka erilaistumisohjelma käsittää myogeneesin, neurogeneesin, kondrogeneesin, osteogeneesin ja adipogeneesin.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5801050/bin/nihms925405f2.jpg
•  
• 

. Based on studies about differentiation programs of mesenchymal stem cells (MSCs), including myogenesis, neurogenesis, chondrogenesis, osteogenesis and adipogenesis, we propose here that CRL3 complexes evolved to fulfill a pivotal role in mammalian cell differentiation.

Copyright © 2017 Elsevier Ltd. All rights reserved.



Lisätieto:
BTB -CLR alaryhmästä  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC394240/

A single polypeptide containing a BTB and a protein–protein interaction domain may bridge Cul3 to the substrate and thus fulfill the function of Skp1/F-box or ElonginC/SOCS-box heterodimers