OTUD3 1p36.13. DUBA4

https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2016.03.009
Havaitsin  OTUD3 proteiinin ja sen toinen nimi on DUBA4.
Asema on 1p36.13.
Jossain yhteydessä jo vuosi sitten huomasin OTUD3:n mutta en saanut vahvistusta siitä, että OTU-ryhmää olisi ollut jo 15 kpl.  Tämä olisi viidestoista OTU.
Katson mitä siitä on PubMed tietueessa, joka on juuri päivitetty 12.5. 2019. Katson historiikkiosan.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/23252

GeneRIFs: Gene References Into Functions

1. OTUD3 is an essential regulator of PTEN and the OTUD3-PTEN signalling axis plays a critical role in tumour suppression.
2. Single-nucleotide polymorphism in OTUD3 gene is associated with ulcerative colitis.

Submit: New GeneRIF Correction

 

"Knockdown of OTU domain containing 3 (OTUD3) by siRNA inhibits HIV-1 replication in HeLa-derived TZM-bl cells"

 

OTUD3-proteiinista  koottu 10 referenssiä:
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_056022.1

Vuodelta 2015

REFERENCE   1  (residues 1 to 398)
  AUTHORS   Yuan L, Lv Y, Li H, Gao H, Song S, Zhang Y, Xing G, Kong X, Wang L,
            Li Y, Zhou T, Gao D, Xiao ZX, Yin Y, Wei W, He F and Zhang L.
  TITLE     Deubiquitylase OTUD3 regulates PTEN stability and suppresses
            tumorigenesis
  JOURNAL   Nat. Cell Biol. 17 (9), 1169-1181 (2015)

REMARK    GeneRIF: OTUD3 is an essential regulator of PTEN and the OTUD3-PTEN
            signalling axis plays a critical role in tumour suppression. 

2013

 REFERENCE   2  (residues 1 to 398)
  AUTHORS   Mevissen TE, Hospenthal MK, Geurink PP, Elliott PR, Akutsu M,
            Arnaudo N, Ekkebus R, Kulathu Y, Wauer T, El Oualid F, Freund SM,
            Ovaa H and Komander D.
  TITLE     OTU deubiquitinases reveal mechanisms of linkage specificity and
            enable ubiquitin chain restriction analysis
  JOURNAL   Cell 154 (1), 169-184 (2013)

(2013 Tässä geenitutkimuksessa  UC-geenitaustan selvittelyssä havaittiin

kromosomisijainnissa 1p36.13 RNF186-OTUD-PLA2G2E. 

 RNF186 on eräs transmembraanisen sijainnin omaava 

RING-fingerproteiini E3 ubikitiiniligaasijoukkoa sekin).Se sijaisee

 endoplasmisessa retikulumissa ja 

 stressitilanne vaikuttaa siihen. Sitä itseään säätelevä oma monoubi-

kitylaatio estyy stressistä  ja niin se ei mene silppuriin, vaan kertyy. 

Silloin  se tekee substraattiinsa (Bcl2 jäseneen BNip1) diubikitinaation, joka 

johtaa aktivoituneen susbtraatin  mitokondriaan).  Mutta ilmeissesti (?) lähellä

oleva DUB, OTUD3 joka osaa  tehdä   diubikitinaatiota, 

  voi vähentää RNF186:n substraatin  aktivaatiotilaa- jos ehtii-BNip1 kertymistä

tapahtuu kun RNF186 kertyy- ( vaikutuksesta  kliinisesti 

havaitaan UC). Oletettavasti OTUD3 mutaatiot voivat  aiheuttaa UC. 

Loogisesti päätellen. Kts. hyvä artikkeli  vuodelta 2013. Olen  näissä

 molekyyleissä etsinytkin ohut- ja paksusuoleen vaikuttavia tekijöitä) Tämä 

suomalainen  välikpl. on oma ref.  ja  kommenttini allaolevasta)

REFERENCE   3  (residues 1 to 398)
  AUTHORS   Yang SK, Hong M, Zhao W, Jung Y, Tayebi N, Ye BD, Kim KJ, Park SH,
            Lee I, Shin HD, Cheong HS, Kim LH, Kim HJ, Jung SA, Kang D, Youn
            HS, Liu J and Song K.
  TITLE     Genome-wide association study of ulcerative colitis in Koreans
            suggests extensive overlapping of genetic susceptibility with
            Caucasians
  JOURNAL   Inflamm. Bowel Dis. 19 (5), 954-966 (2013)
   PUBMED   23511034 

2009

REFERENCE   7  (residues 1 to 398)
  AUTHORS   Silverberg MS, Cho JH, Rioux JD, McGovern DP, Wu J, Annese V,
            Achkar JP, Goyette P, Scott R, Xu W, Barmada MM, Klei L, Daly MJ,
            Abraham C, Bayless TM, Bossa F, Griffiths AM, Ippoliti AF, Lahaie
            RG, Latiano A, Pare P, Proctor DD, Regueiro MD, Steinhart AH,
            Targan SR, Schumm LP, Kistner EO, Lee AT, Gregersen PK, Rotter JI,
            Brant SR, Taylor KD, Roeder K and Duerr RH.
  TITLE     Ulcerative colitis-risk loci on chromosomes 1p36 and 12q15 found by
            genome-wide association study
  JOURNAL   Nat. Genet. 41 (2), 216-220 (2009)
   PUBMED   19122664