Syklofiliinigeenejä, FKBP-PPIasigeenejä , pseudogeenejä. SARS2 interaktioproteiineja neljä ainakin.

Tätä luetteloa tein tuossa maaliskuussa, joten  siirrän tässä sitä ensin vihosta mappiin ja siten kun on aikaa, katson  geeneistä enemmän tietoa jos niitä ilmenee  joissain artikkeleissa, sitä mukaan.  vain muutamsta syklofiliinigeenistä on  tässä  blokissa  edellisissä artikkeleissa geenitietoa: CYPA, CYPB ja CYPD.  Lisäksi  Sars2 interaktiogeeneissäkin on aikaisemmin  mainintaa erikseen:   FKBP15 ,FKBP7, PPIL3, FKBP10.   Mitään erityisen hyvää  karttaa  näistä ei ole, joissa kaikkia tekijöitä näkisi yhtä aikaa ja niitä on  käsittääkseni aika  paljon soluissa ja niitä erittyy soluista joissain yhteyksissä.

 

Kromosomi1
PPIE, (Cyp33), syklofiliini 33.
PPIH,  (CypH, Cyp20), syklofiliini 20).
PPIAL4A, (PPIAL4, COAS-1).
PPIAL4E, (COAS-2).
PPIAL4C, (COAS-2).
PPIAL4F.
PPIAL4D .
 Neljä pseudogeeniä, yksi nimeltään profiliini)
Kromosomi 2
PPIL3, (CYPJ, syklofiliini J) . Tämä  syklofiliini on Sars2 viruksen nsp12 proteiinin interaktioproteiini).
PPIG, (CARS-Cyp).
 FKBP7( ppiase, FKBP23,  PPIase) . Tämä on SARS2  ORF8 interaktioproteiini 
 Kaksi pseudogeeniä.

Kromosomi3
 Seitsemän pseudogeeniä.

Kromosomi4
PPID,  (CYPD), Syklofiliini D.
 Yksi pseudogeeni.

Kromosomi 5
PPIC,(CYPC),  Syklofiliini C.
PPiWD1.
CWC27, (spliseosomiin assosioitunut syklofiliini, NY-CO-10,  syöpäantigeeni).
Neljä pseudogeeniä.

 Kromosomi 6
PPIL1, (CYPL1, CGI-124; PPIase hCyPX).
PPIL4.
PPIL6, (PPiASE).
Kaksi pseudogeeniä.

Kromosomi 7.
PPIA (CypA, CYPA), syklofiliini A.
FKBP14, peptidyyliprolyyli cis-trans isomerase 14
Kolme pseudogeeniä.
Kromosomi 8.
--
Kromosomi 9
FKBP15  ( Sars2 viruksen nsp2 interaktioproteiini) 

 (Kaksi pseudogeeniä)

Kromosomi 10
PPIF ( CYP3, Cyp-M, Cyp-D).
 (Viisi pseudogeeniä)

Kromosomi 11. 
FKBP2 (peptidyylprolyyli-cis-trans- isomeraasi 2;  FKBP13, FKBP-13, PPIase.
(Kolme pseudogeenia) 

Kromosomi12 
FKBP11 (peptidyylprolyyli cis-trans isomeraesi PPIase, FKBP19) 
Kaksi pseudogeeniä

Kromosomi 13
Viisi  pseudogeenia

Kromosomi 14
 LRR1 (PPIL5)

Ainakin  kaksi pseudogeeniä.

Kromosomi 15
PPIB, (B), CCYPB, S-cyclophilin, SCYLP, OI9, syklofiliini B).   
Kaksi pseudogeeniä.

Kromosomi 16
Yksi pseudogeeni.

Kromosomi 17
FKBP10 (PPIAse)  Tämä on Srs2 ORF8 interaktioproteiini.

Kolme pseudogeeniä.

Kromosomi 18
Yksi pseudoeeni.

Kromosomi 19
Kolme pseudogeeniä.

Kromosomi20
Viisi pseudogeeniä

Kromosomi21
Kaksi pseudogeeniä.

Kromosomi22
PPIL2 (Cyp4, Cyp60, UBOX,  rotamase 2, Ring type ubiquitin PPIL2).

Kromosomi X
Pseudogeenejä  kaksi.

Y

IMMUNOFIILI-suurperheen geenien asettuma kromosomistoon lkaa hahmottua. 
Tämä geeniluettelo on kesken FKBP geenien osalta, joita pitäisi olla 18 ainakin.
 Syklofiliinigeenejä  hain  ehkä kaikki ja pseudogeenit myös mitä löysin PubMed hakuna.
 Hain sekä koodaavat geenit että pseudogeenit. 
Parvuliinit eivät ole tässä.  in  katsoa näitä  alkuvuodesta  maaliskuun alussa, mtua siten tuo  koronaviruksen interaktioproteiinien hakeminen   otti ajan. Luettelosta löytyi  kuitenkin muutamia  (332 interaktioakandidaatin joukosta poimittuina)
  yksi PPIL3(CYPJ)    syklofiliinin kaltainen proteiini  CypJ. ( Sars 2 nsp 13 interaktioproteiini).
Lisäksi  kolme  FKBD- perheen jäsentä:
FKBP15  ( Sars2 viruksen nsp2 interaktioproteiini)
FKBP7, (Sars2 ORF8 interaktioproteiini) 
FKBP10 (PPIAse)  Tämä on Srs2 ORF8 interaktioproteiini