Sinkkiproteiinien ZXDA ja ZXDC osuutta histokompatibiliteettigeenisäätelyssä

 ZNF896, (Xp11.21), ZXDA,'

 Geeni  koodaa toista  kahdesta  kaksinkertaistuneesta sinkkisormigeenistä: Tämä X-kromosomin geeni (Xp11)  on telomeerinen kopio ja se, joka  on   sentromeerismpänä sijaitseva.  Ne kaksi geeniä omaavat 98%:sen nukleotidisekvenssien samankaltaisuuden  ja  oletetut proteiinit sisältävät 10 peräkkäistä sinkkisormimotiivia. Tähän geeniin ZXDA  liittyy monokromaattinen sinivärisokeus.  Tärkeä paralogi on se toinen geeni   ZXDB ( ZNF905,  X11.21).  

Lisänä tästä geenistä ZNF896 tärkeää tietoa:  Sillä on vaikutusta  immunologiseen  rakenteeseen: Se edistää MHC I ja MHC II luokkien geenitranskriptiota. Proteiinikoko 799 aminohappoa.

ZNF896 (GeneCards tietoa)
Aliases for ZXDA Gene , Zinc Finger X-Linked Duplicated A ^{2 3 5}  , Zinc Finger X-Linked Protein ZXDA ^{3 4} , Zinc Finger Protein 896 ^{2 3}  , ZNF896 ³

https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=ZXDA&keywords=ZNF896

This gene encodes one of two duplicated zinc finger genes on chromosome Xp11. This gene is the telomeric copy; GeneID 158586 ZXDB is the more centromeric copy. The two genes have 98% nucleotide sequence similarity, and the predicted proteins contain 10 tandem zinc finger motifs.

GeneCards Summary for ZXDA Gene
ZXDA (Zinc Finger X-Linked Duplicated A) is a Protein Coding gene. Diseases associated with ZXDA include Blue Cone Monochromacy. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include nucleic acid binding and C2H2 zinc finger domain binding. An important paralog of this gene is ZXDB  (= ZNF905, Xp11.21).

UniProtKB/Swiss-Prot Summary for ZXDA Gene:Cooperates with CIITA to promote transcription of MHC class I and MHC class II genes ZXDA_HUMAN,P98168

[provided by RefSeq, Nov 2009]
Protein attributes for ZXDA Gene: Size:799 amino acids. Molecular mass: 84771 Da

Quaternary structure: Self-associates. Interacts with ZXDC (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=ZXDC&keywords=ZXDC )  and CIITA (https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=CIITA&keywords=CIITA)

 

Tämä CIITA  (NOD like A) vasta erikoinen  geeni on.Siihen tekee interaktion sinkkisormiproteiinit  ZXD geenit  sekä A että  C.  ZXDA  edistää MCH luokkien I ja II geenien transkriptiota  ja ZXDC repressoi MCH luokka II transkriptiota, ainakin eräs sen  isoformi 3 tekee niin.    CIITA  taas edistää MHC II transkriptiota. 

Nämä Histokompatibiliteettiin   vaikuttavat taustalla olevat säätelevät   geenitekijät sijaitsevat  eri kromosomeissa.  ZXDA sijaitsee  siinä tuplageenissä X-kromosomissa  ja sen läheinen ZXDB:n  ehkä  ilmeinen tukitekijä tärkeän ZXDA:n  olemassaololle.

 

  Repressorityyppinen  ZXDC sijaitsee  kromosomissa 3q21.3.

Sekä  ZXDA:n että  ZXDC:n   molempien  interaktiopartneri  CIITA  (NODA)   "Master Control Factor"  on  tumassa toimiva ja   koodautuu kromosomista  16p13.13.

 

(UniProtKB/Swiss-Prot Summary for CIITA Gene

Tästä on  tietoa on  sen oman  otsikon alla enemmän: 

• Essential for transcriptional activity of the HLA class II promoter; activation is via the proximal promoter. No DNA binding of in vitro translated CIITA was detected. May act in a coactivator-like fashion through protein-protein interactions by contacting factors binding to the proximal MHC class II promoter, to elements of the transcription machinery, or both. Alternatively it may activate HLA class II transcription by modifying proteins that bind to the MHC class II promoter. Also mediates enhanced MHC class I transcription; the promoter element requirements for CIITA-mediated transcription are distinct from those of constitutive MHC class I transcription, and CIITA can functionally replace TAF1 at these genes. Activates CD74 transcription (PubMed:32855215). Exhibits intrinsic GTP-stimulated acetyltransferase activity. Exhibits serine/threonine protein kinase activity: can phosphorylate the TFIID component TAF7, the RAP74 subunit of the general transcription factor TFIIF, histone H2B at 'Ser-37' and other histones (in vitro). Has antiviral activity against Ebola virus and coronaviruses, including SARS-CoV-2. Induces resistance by up-regulation of the p41 isoform of CD74, which blocks cathepsin-mediated cleavage of viral glycoproteins, thereby preventing viral fusion (PubMed:32855215).

  • C2TA_HUMAN,P33076