VPS34 on Bekliini1- lipidikinaasikompleksin alayksikkö ja katalysoi fosfoinositidin (PI) 3-kohdan fosforylaatiota. Fosfoinositidia muodostuu sytoplasmassa myoinositolista käsin. Inositolissa on kuuden hiilen syklitolirengas ja se voi esiintyä ravinnosta tullessaan polyolina jossa on kuusi OH ryhmää tai siten eri asteisesti fosforyloituna. Tässä tapauksessa aseman 3- kohtaan tehdään fosforylaatio. Inositoli ( on sitä ennen saanut fosfatidyyli-inositolimuotonsa (PI) jossa fosfaattiryhmä on 1 asemassa, eikä siitä rikastuvissa PI-muodoissa maintia numeroa 1.
Kun on tuottunut PI fosfoinositidistä PI3K-kinaasilla PI(3)P, muotoa sillä on paljon käyttöä ja erilaiset sitä sitovat proteiinit alkavat rekrytoitua endosomaaliseen kalvoon kuten
WIFI1, WIFI2 ja DFCP1s
( Solun plasmakalvossa sen tiedetään rikastuvan fosfaateilla kalvolipidikis ( PIP2, PIP3) riippuen kinaaseista ja siitä tulee erilaisia signaaliaineita ja rikastuvia tai purkaantuvia inositolifosfaatteja tai rikastuneita fosfoinositidejä).
Minkälainen molekyyli on DFCP1?
huomattiin, että kun PI(3) P alkaa muodostua, alkaa ilmentyä omegasomissa/ER.ssä myös molekyyliä DFCP1. Se on "dual FYVE containing protein 1", kaksi FYVE-domaania omaava proteiini 1.
PI(3)P molekyylit pystyvät liittymään proteiinien FYVE-domaaniin. FYVE domaanit ovatkin edellytys ESCRT- kompleksin toimimiselle. ESCRT kompleksilla on FYVE domaani ESCRT-o HRS/ VSP27 molekyylissä ja ESCRT -II EAP45, GLUE-domaanissa. PI(3) P on niiden funktiossa välltämätön kehitettäessä multivesikulaarisia rakkuloita jonne ubikitinoituja kalvo-ja funktioproteiineja siirretään käsiteltäväksi loputal lysosomissa. ellei nyt siten valita kierrätykseen ja lähetetä takaisin plsmakalvoon.
Mutta myös muilla spesifisillä yksiköillä on PI(3) hyödyntävä järjestelmä ja siihen kuuluvia proteiineja kuten tällä trimosomi/omegasomi- fagogori tiellä.
DFCP1 toimii erityisissä "omegasomeissa ", esim Trimosomissa, jossa se lokalisoituu samaan kohtaan TRIM13:n kanssa. Trim13 pystyy johtamaan joitain kuormia autofagiatiehen. DFCP1 sijoittuu samoihin kohtiin TRIM13:n kanssa. TRIM13 omaa quadruplexkonfiguraatiota).
DFCP1 omaa myös toisen nimen ZFYVE (Geeni Kr.14q24.2).
Sillä on muitakin nimiä:PPP1R172, SR3, TAFF1, ZNFN2A1, Zinc Finger FYVE-type containing 1.
DFCP1 omaa eri isoformeja, isoformi 3 on 763 aminohappoa ja 1-isoformi , 771 a.a.
Muutkin tekijät vaikuttavat PI3P kertymistä kalvoon kuten WIPI-proteiinit (WD-repeat PtdIns(3)P effector proteins)
Niiden merkityksenä on valmistaa kuljetettavien spesifisten kuormien siirtymistä autofagosomia kohti, fagoforiin päin.
Näistä proteiineista voi löytä kuvaa hakusanalla: "PI3K-mediated nucleation" ,
Tapahtumaketjua 1-5.
ER/omegasome:
Proteiinien nimiä
1) ULK-kompleksi ULK1, FID200, ATG13
ULK1, seriinitreoniinikinaasi, joka on kriittinen autofagian alulle. (ULK1 on substraatti Cul3-KLHL20 E3 ubikitiiniligaasille. KLHL20 vastaa autofagian terminaatiosta.
ULK1= Unc-51 like autophagy activating kinase ( tämä on spesifinen kinaasi autofagiassa ja vastaa erityisesti aminoahppojen vajeeseen. Sitä tarvitaan autofagosomin biogeneesin alkuvaiheessa. Se tekee interaktion PI3KCIII ja Beclin 1:n kanssa .
FID200, FAK family kinase interacting protein 200kDa (RB1CC1). Säätelyproteiini.
HORMA(Hop/Rev7/Mad2) domain containig protein ATG13. Säätelyproteiini.
2) BEKLIINI-kompleksi VPS34,PI3K, ATG14.
ATG14.induktio rekrytoi Bekliinikompkleksin endoplasmiseen retikulumiinV
Beclin1, lipidikinaasi toimii tukitelineenä-
VPS15, VPS15-alayksikön oletetaan tekevän interaktiota kalvoon ja täten kytkevän (tethering)
VPS34:n asemiinsa.Sen nimi on PIK3R4, (Phosphoinositide-3-kinase Regulatory subunit 4=
VPS34 (PIK3C3) on Bekliini1-kinaasin alayksikkö,.joka katalysoi PI-3- aseman fosforylaatiota.
(Phosphatidyl Inositol -3-Kinase Catalytic subunit 3).
(ATG9 kalvoon sitoutunena)
3) ATG14, BEKLIN-1, VPS15. VPS34, ATG ,
DFCP1 ( alkaa ilmetä omegasomikalvossa)
DFCP1 on kaksi FYVE-domaania omaava sinkkisormiproteiini, joka pystyy kiinnitttymään PI(3)P-molekyylikohtaan.
(4) WIPI1, WIPI2 alkaa ilmetä omegasomikalvossa ja kykenevät myös sitomaan PI (3)P:tä.
(5) DFCP1 ja WIPI1 ja 2 kiinnittyvät PI3P molekyyliin
(6) Phagophore - cargo siirtyy fagoforiin.
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar