Kertailen tänään musiinien (mucin proteins) asioita. Päivitän käännöstäni 2.11. 2018 Jabbarin abstraktista

 13.2. 2023 Teen muutamia käännöskorjauksia tähän. Koetan saada vähän sujuvamman suomalaisen tekstin  kirjan  tiivistelmästä tähän.Tri  Karolina  Sjöberg Jabbar   vuoden 2018  väitöskirjassaan esittää tutkimuksen suolistoalueenmusiiniproteiininkoostumukesta ja siinä ilmenevästä  varhaisesta tulehdusvaiheesta ja syövästä. https://gupea.ub.gu.se/handle/2077/56912

Terminologiasta: 

Mucus =lima, lima-aines , musiini,  (saks. Muzin),

Mucous= limainen,  Mucosa (latina), mucous membrane (engl)  = limakalvo,  mucosa

Mucus protein= lima(-aines) proteiini, musiiniproteiini

Pancreatic cancer= haimasyöpä, 

Pancreas = Haima,mahasylkirauhanen;   bukspottskörtel.  

Cancer= syöpä

Tumor = kasvannainen, tuumori.

https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Smallintestine_layers2.png

Ensiksi  kirjoitin tästä  marraskuussa 2018: fredag 2 november 2018

Kirjastopäivä 1.11.2018 Uutta tietoa musiineista (KS Jabber väitöskirja)

Karolina Sjöberg Jabbar Early stage inflammation and cancer as reflected in the gastrointestinal mucus composition http://hdl.handle.net/2077/56912     ISBN 978-91-7833-128-4(PDF)

Väitöstilaisuus 12.11.2018)
Suomennosta  tiivistelmästä

MUCUS, musiini,lima-aines, peittää kehon sisäisiä välipintoja  miljöön suuntaan  tehden ihmisen kykeneväksi vitaaliin interaktioon  ulkopuolisen maailman kanssa. Musiini rakentuu musiiniproteiineista, jotka ovat tärkeitä ihmisen puolustuskyvyssä  infektioita ja tulehduksia vastaan, mutta ne antavat myöskin oman osansa  karsinogeneesiin (pahanlaatuisen kasvannaisen) ja tuumorien ( yl. kasvannaisten)  kehittymiseen.
Näitä musiinibiologian eri näkökohtia  valaistaan esimerkein  tämän väitökirjan  osatöissä, jotka kaikki  perustuvat massaspektrometrisiin tutkimuksiin. Aihepiiri kattaa  alueita haimasyövän varhaisdiagnostiikan  musiinibiomerkitsijöistä  aivan  viimeaikaisiin löytöihin  musiiniin liittyvän bakteerin ja  IBS (irritable bowel syndrome):n kesken vallitsevasta assosioitumisesta. IBS on ärtyneen suoliston oireyhtymä.

• Mucus covers our inner interfaces towards the environment, providing protection while enabling vital interaction with the outside world. The mucus is built around mucin proteins, which are important for our defences against infection and inflammation, but may also contribute to carcinogenesis and tumour progression. These divergent aspects of mucin biology are exemplified in the different studies in this thesis, which are all based on mass spectrometry. The topics covered range from mucin biomarkers for the early diagnosis of pancreatic cancer, to the discovery of a link between a mucus-associated bacterial genus and irritable bowel syndrome.

 Haimasyöpä (Pancreatic cancer, bukspottskörtelcancer) on suhteellisen harvinainen tuumorimuoto, mutta  on arveltu sen muodostuvan  syöpäkuolemien syinä USA:ssa vuonna 2030 toisena johtavaksi. Kehno prognoosi selvittyy  suureksi osaksi myöhäisestä havaitsemisesta. Kuvaantamistekniikan  edistymisen takia  pystytään havaitsemaan  haimasyövän kystisiä prekursoreita (edeltäjiä)   nousevaan  tahtiin ja tästä taas  tulee  uutta   mahdollisuutta preventioon eli ennaltaehkäisemiseen ja parantavaan hoitoon.  Epäonnea on  kuitenkin sikäli, että saatavilla olevat  diagnostiset  työvälineet  eivät ole  riittävän  runsaita,  jotta voitaisiin suorittaa täsmäinterventiota suuren riskin kystisiin (kasvainrakko-) leesioihin.

•  Pancreatic cancer is a relatively rare tumour form, but is postulated to become the second leading cause of cancer deaths in the United States by 2030. The poor prognosis is largely explained by late detection. With advances in imaging, cystic precursors of pancreatic cancer are detected with increasing frequency, offering an unprecedented opportunity for prevention and cure. Unfortunately, available diagnostic tools are not sufficiently robust to enable targeted intervention against high-risk cystic lesions. 

 Tässä työssä  kuvataan massapektrometriaan perustuvia musiinin kvantifioimismenetelmiä sekä muita  haimakystanestenäytteiden biomerkitsijöitä,  niiden kehittymistä ja  arviointia. Eräässä prospektiivisessa  arviointikohortissa analyysi tunnisti  haimasyövän kystisiä prekursoreita  97%;n tarkkuudella. Tämä tulos edustaa  merkitsevää  kohentumista  hyväksyttyihin j akäytössä oleviin ( state of the art-) diagnostisiin metodeihin.  Täten  analyysin kliininen  implementoiminen (käytäntöön soveltaminen) saattaa nopeuttaa  haimasyövän varhaista  havaitsemista, mikä on edellytys, jotta  elossapysymisluvut  saadaan kohenemaan.

• Here, we describe the development and evaluation of a mass spectrometry based method for quantification of mucins and other biomarkers in pancreatic cyst fluid samples. In a prospective validation cohort, the analysis identified cystic precursors of pancreatic cancer with 97% accuracy. This result represented a significant improvement upon state-of-the-art diagnostic methods. Thus, clinical implementation of the analysis may facilitate early detection of pancreatic cancer, which is a prerequisite for increasing survival rates.

 Haavainen paksunsuolentulehdus (UC)  on tulehduksellinen suolistotauti, jonka kulku on  kroonista ja siinä   tapahtuu ajoittaisia  pahenemisvaiheita (relapseja).  Nykyisen käsityksen mukaan ulseratiivinen ( haavoja muodostava) koliitti (paksunsuolentulehdus)  (UC)  johtuu epäasianmukaisista vuorovaikutuksista  paksunsuolen mikrobioottien (mikrobiomin) ja isäntäkehon immunivasteen  kesken geneettisen alttiuden pohjustaessa tilanteen. Normaalisti on suoliontelon (ontelo= lumen)  runsas mikrobimäärä    eristäytyneenä paksusuolen epiteelistä (pintasolukerroksesta)  ja tällaista olotilaa pitää yllä läpäisemätön  mukoosaeste (limakalvojärjestelmän antama suojakerros).

Tässä väitöstyössä  havaittiin  epänormaaliuksia mukoosaproteiinien koostumuksessa haavaista paksunsuolentulehdusta (UC) potevilla henkilöillä niissäkin näytteissä, jotka oli otettu tulehtumattomista kohdista. Tämä viittaa siihen, että paksusuolen mukoosakerroksen rakenteellinen heikentyminen  voisi  olla  taudin kehittymisessä merkityksellinen seikka.  Eri  potilaiden kesken  ulseratiivisen koliitin  luonnollinen kulku vaihtelee huomattavasti. 

Prognostiset eli  ennustetta taudin kulusta  antavat  merkitsijät   voinevat  vähentää relapseja eli taudin uusiintumia ja kolektomioita (paksunsuolen poistoa vaativia leikkauksia) ja tarpeetonta  lääkkeen käyttöä.

•  Ulcerative colitis is an inflammatory bowel disease with a chronic and relapsing course. According to the current view, ulcerative colitis results from inappropriate interactions between colonic microbiota and host immunity, against a background of genetic susceptibility. Normally, the abundant luminal microbes are segregated from the colonic epithelium, through an impervious mucus barrier. Here, abnormalities in mucus protein composition were detected in ulcerative colitis patients, also in samples from non-inflamed areas. This implies that structural weakening of the colonic mucus barrier could be important for the development of the disease. The natural history of ulcerative colitis varies considerably between patients. Prognostic markers for the disease course could reduce relapses and colectomies, as well as the unnecessary use of medication. 

 Tässä työssä tutkijat tunnistivat paksusuolesta  kaksi mucus -ryhmän proteiinia, joiden välinen   suhde osoittautui vahvaksi ennusteeksi   intensiivisemmän lääkityksen tai kirurgian tarpeesta  tulevan  viiden vuoden aikajaksona. Mielenkiintoinen seikka oli, että nämä kaksi proteiinia säätivät   eri tavoin spesifisten  mikrobiaalisten ligandiensa  tunnistamisen. Muuntunut tasapaino näissä proteiineissa näytti assosioituvan   bakteeriendosporien  infiltroitumiseen (tunketumiseen) paksunsuolen lamina propriaan. Täten  voidaan ajatella, että endosporien  ajoittaiset  aktivoitumiset  saattaisivat antaa oman osansa  vaikeaa ulseratiivista koliittia (UC) potevien taudin uusiutumisiin.

•  Herein, we identified a ratio of two proteins in colonic mucus as a powerful predictor of the requirement for intensified medication or surgery during a five year period. Interestingly, these two proteins differentially regulate the sensing of specific microbial ligands. An altered equilibrium of these proteins was tentatively associated with infiltration of bacterial endospores in the colonic lamina propria. Thus, intermittent activation of endospores may conceivably contribute to relapses in patients with severe ulcerative colitis. 

 Brachyspira - bakteerisuvussa on useita patogeenisia lajeja. Tässä väitöstyössä  havaittiin kolmanneksella IBS- potilaista  Brachyspira- kolonisaatiota paksunsuolen epiteelin pinnalla ja sisemmässä  musiinikerroksessa, kun taas terveillä  tällaista  oli   harvoin  havaittavissa.

Lisäksi liittyi Brachyspira-kolonisaatio selvästi erotettavaan  oirekirjoon sekä  limakalvon   immuunivasteeseen.   Tämä viittaisi siihen, että  tähän potilasryhmään kohdennetulla antibioottihoidolla  voitaisiin vähentää IBS – taudin morbiditeettin painolastia.

Näiden tutkijoiden  mukaan  kuitenkin antibioottihoito aiheutti paradoksaalisesti Brachyspira-invaasion  limasolujen (goblet-solujen) mukoosijyväsiin. Tämä havainto edustanee bakteerin taholta jotain uutta evaasiostrategiaa ja  niinpä se selviääkin elinvoimaisena antibiootista.Tämänkin tutkimuksen tulos viittaa sellaisen mahdollisuuden olemassaoloon   ottaen huomioon   ymmärtämyksemme terapiaresistenteistä infektioista ja patogeenin  pinttyneisyydestä   suolistoreservoaareissaan.

Brachyspira is a bacterial genus that includes several pathogenic species. In this thesis, Brachyspira colonization of the colonic epithelial surface and inner mucus layer was detected in one third of IBS patients, but rarely observed in healthy individuals. Furthermore, Brachyspira colonization was associated with a distinctive symptom profile and mucosal immune response. This suggests that targeted antibiotic therapy of this patient group may reduce the morbidity burden of IBS. However, in our investigation antibiotic treatment paradoxically resulted in Brachyspira invasion of goblet cell mucus granules. This observation may represent a novel bacterial strategy to evade and survive antibiotic treatment, with potential, broad implications for our understanding of therapy resistant infections and pathogen persistence in the intestinal reservoir.

 Työn otsikkona  sisältö:  Gastrointestinaalisen musiinin, lima-aineksen,  koostumus heijastaa  varhaisasteen  tulehdusta ja syöpää ja  antaa  viitettä    diagnoosista, prognoosista ja patogeneesista.
Karolina Sjöberg Jabbar.  Early stage inflammation and cancer as reflected in the gastrointestinal mucus composition: implications for diagnosis, prognosis and pathogenesis

https://gupea.ub.gu.se/handle/2077/56912
Tässä väitöskirjassa  on neljä osatyötä.
Ensimmäisessä osatyössä selvitettiin  haimasyövän kystisiä prekursoreita tunnistamalla niiden  musiinikirjoa. Jabbar KS et al.(2014)  Proteomic mucin profiling for the identification of cystic precursors of pancreatic cancer.
Toisessa osatyössä kohdennetulla massaspektrometrisellä tutkimuksella saatiin hyvin  tarkasti tunnistettua  haimasyövälle tyypillisiä  kystisten prekursoreiden leesioita (vaurioita; leesio = vaurio).
van der Post, Jabbar KS et al. (2018). Highly accurate identification of cystic precursor lesions of pancreatic cancer through targeted mass spectrometry: a phase IIc diagnostic study. 
 Kolmannessa osatyössä  selvitettiin  haavaisen  paksunsuolentulehduksen (UC) patogeneesin  varhaistapahtumaa, paksusuolimusiinien muodostaman estävän kerroksen  rakenteellista  heikentymistä.
Jabbar KS, van der Post et al. Structural  weakening of the colonic mucus barrier is an early event in ulcerative colitis (UC) pathogenesis (submitted).
Neljännen  osatyön otsikkona on:  Kolonin musiiniesteen proteiinikompositio antaa ennusteen ulseratiivista koliittia (UC)  potevien taudinkulusta.(Paksusuoli on  latinaksi Colon).
 Jabbar KS, van der Post et al.  The protein composition of the colonic mucus barrier predicts disease course in ulcerativat colitis (UC) patients. (Manuscript).
Viidennen osatyön otsikkona  on tulokset  tutkimuksista Brachyspira-mikrobilajeista paksusuolen epiteelissä ja sisemmässä musiinikerroksessa:  Tutkijat  arvelevat  näiden bakteerien läsnäolon korreloivan   taudinkehitykseen kolmasosalla IBS- potilaista.
Simren M, Hansson GC, Jabbar KS et al.  The presence of Brachyspira species in the colonic epithelium and inner mucus layer may be linked to disease development in up to a third of IBS patients. (Manuscript). 

 
Muistiin 2.11. 2018 ensimmäisen kerran.  Päivitystä  ja  siirto  13.2. 2023 sivulle.