Leta i den här bloggen


söndag 26 november 2023

CD38, GeneCards tieto ja alternatiivit nimet

 https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=CD38&keywords=cd38

Aliases for CD38 Gene

  • GeneCards Symbol: CD38 2
  • CD38 Molecule 2 3 5
  • ADP-Ribosyl Cyclase 1 2 3 4
  • CADPR1 2 3 5
  • ADP-Ribosyl Cyclase/Cyclic ADP-Ribose Hydrolase 1 3 4
  • 2'-Phospho-Cyclic-ADP-Ribose Transferase 3 4
  • 2'-Phospho-ADP-Ribosyl Cyclase 3 4
  • Cyclic ADP-Ribose Hydrolase 1 3 4
  • NAD(+) Nucleosidase 2 3
  • CD38 Antigen (P45) 2 3
  • ADPRC 1 3 4
  • 2'-Phospho-ADP-Ribosyl Cyclase/2'-Phospho-Cyclic-ADP-Ribose Transferase 4
  • Ecto-Nicotinamide Adenine Dinucleotide Glycohydrolase 3
  • Cluster Of Differentiation 38 3
  • CADPR Hydrolase 1 4
  • CD38 Antigen 4
  • EC 2.4.99.20 4
  • EC 3.2.2.- 4
  • EC 3.2.2.6 4
  • ADPRC1 3
  • T10 4


NCBI Gene Summary for CD38 Gene

  • The protein encoded by this gene is a non-lineage-restricted, type II transmembrane glycoprotein that synthesizes and hydrolyzes cyclic adenosine 5'-diphosphate-ribose, an intracellular calcium ion mobilizing messenger. The release of soluble protein and the ability of membrane-bound protein to become internalized indicate both extracellular and intracellular functions for the protein. This protein has an N-terminal cytoplasmic tail, a single membrane-spanning domain, and a C-terminal extracellular region with four N-glycosylation sites. Crystal structure analysis demonstrates that the functional molecule is a dimer, with the central portion containing the catalytic site. It is used as a prognostic marker for patients with chronic lymphocytic leukemia. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2015]

GeneCards Summary for CD38 Gene

CD38 (CD38 Molecule) is a Protein Coding gene. Diseases associated with CD38 include Prolymphocytic Leukemia and Leukemia, Chronic Lymphocytic 2. Among its related pathways are NAD metabolism and Metabolism of water-soluble vitamins and cofactors. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include transferase activity and hydrolase activity, acting on glycosyl bonds. An important paralog of this gene is BST1.

UniProtKB/Swiss-Prot Summary for CD38 Gene

Synthesizes cyclic ADP-ribose (cADPR), a second messenger for glucose-induced insulin secretion (PubMed:8253715, 7961800). Synthesizes the Ca(2+) mobilizer nicotinate-adenine dinucleotide phosphate, NAADP(+), from 2'-phospho-cADPR and nicotinic acid, as well as from NADP(+) and nicotinic acid.

 At both pH 5.0 and pH 7.4 preferentially transforms 2'-phospho-cADPR into NAADP(+), while preferentially cleaving NADP(+) to cADPR and ADPRP rather than into NADDP(+) (PubMed:16690024). Has cADPR hydrolase activity (PubMed:8253715, 7961800). ( CD38_HUMAN,P28907 )

NAD biosynteettisen tien geenikirjo: Sirtuiinit, PARP sinkkisormiproteiinit ja CD38

 NAD ja NADP  molekyylejä muokkaavia entsyymejä ovat mm.

PARP, jotka tekevät polyADP ribooseja;   PARG,  polyADP riboosin  glygohydrolaasi, joka tekee ADP riboosia.

 Siitä taas ARP-1 entsyymi saa aikaan  tärkeää Riboosi-5-fosfaattia,  joka taas voidaan  ATP:llä nostaa PRPP muotoon fosforibosylpyrofosfaatiksi ja hyödyntää  asteittan (NMN vaiheen kautta takaisin NAD+ muotoon);

 MART, joka on mono-ADP riboositransferaasi ja hydrolaasi. ja johtaa myös ADPr muotoon jne kohti NAD+ muotoa takaisin PRPP vaiheen kautta. 

NAD voidaan kinaasin NADK  ja ATP:n avulla  muuttaa NADP muotoon. 

Substraattia PARP entsyymille on NAD+ muoto.

Sen sijaan CD38 voi toissijaisesti myös modifioida NADP muotoa  kuten  edellisessä  tiedossa on.  Sillä on preferenssissä reaktioiden suhteen.  On mainittu, että sen funktiovalintaa vaikuttaa ATP:n saatavuus. ATP inhiboi sen hydrolaasitietä . Tie voi  konvergoitua myös NAD+  uudelleen muodostumiseen lopulta. 

Sirtuiineissa on niitä, jotka ovat NAD+  muodosta riippuvaisia.  Sirtuiinit ovat deasetylaaseja aineenvaihdunnassa ja myös histonideasetylaaseissa  on niitä.  Niitä on ainakin 7 ja jokaisella on  oma  toimintakarttansa. Niiden kompleksi osallistuu geenien säätelyyn tumassa muun muassa. Osa nisitä toimii mitokondriassa ja osa sytoplasmassa.

Riboosi on  viiden hiilen sokeri, jonka aineenvaihdunnan kartta on tärkeä  ja  häiriöaltis.  Sinänsä Na nikotiinihappo on  B-vitamiini, jota saadaan ravinnossa ja jota muodostuu myös hieman kehon metaboliassa essentiellistä  aminohaposta  tryptofaanista , mutta katsotaan  essentiellien vitamiinien luokkaan ja sitä on  B-kombiinivalmisteissa aina mukana.   Vaikka riboosion "sokeri"  siihen ei voi vaikuttaa varsinaisesti  ravinnolla, sillä se on metabolian eräs tärkeä  tuote  esim  geenimateriaalin  rakenneosiksi. Sitä  suojaa erilaiset   fosforylaatiomuodot  metabolisessa kartassa.  Normaali  metabolia  edistää sen normaalia muodostusta. Verensokerin hallinta, energian optimointi  ja liikunta ovat  avain tekijöitä näissä asioissa.  Geenivirheillä varsinaisesti  ei ole niin paljon osuutta verrattuna elintapavirheitten vaikutuksiin hyvinvointiyhteiskunnassa.  

Genes in the NAD+ biosynthetic pathways Pathway
ACMSD BST1 CD38 IDO1 NADSYN1 NAMPT NAPRT NMNAT1
PARP1 PARP2 PARP4 QPRT SIRT1 SIRT2 SIRT3 SIRT4
SIRT5 SIRT6 SIRT7 TDO2 TNKS TNKS2

CD38 toimintatapa

Molecular function for CD38 Gene according to UniProtKB/Swiss-Prot

Function:
  • Synthesizes cyclic ADP-ribose (cADPR), a second messenger for glucose-induced insulin secretion (PubMed:8253715, 7961800).
    Synthesizes the Ca(2+) mobilizer nicotinate-adenine dinucleotide phosphate, NAADP(+), from 2'-phospho-cADPR and nicotinic acid, as well as from NADP(+) and nicotinic acid.
    At both pH 5.0 and pH 7.4 preferentially transforms 2'-phospho-cADPR into NAADP(+), while preferentially cleaving NADP(+) to cADPR and ADPRP rather than into NADDP(+) (PubMed:16690024).
    Has cADPR hydrolase activity (PubMed:8253715, 7961800). CD38_HUMAN,P28907
CatalyticActivity:
BiophysicochemicalProperties:
EnzymeRegulation:

Molecular function for CD38 Gene according to GENATLAS

Biochemistry:
  • cell differentiation antigen CD38 (T10),45kDa,membrane glycoprotein,integral,identified by monoclonal antibody OKT10,HB-7,homolog to Aplysia ADRC gene,involved in insulin secretion through mobi-calcium of mobilisation CD38

Enzyme Numbers (IUBMB) for CD38 Gene