13.2. 2023 Teen muutamia käännöskorjauksia tähän. Koetan saada vähän sujuvamman suomalaisen tekstin kirjan tiivistelmästä tähän.Tri Karolina Sjöberg Jabbar vuoden 2018 väitöskirjassaan esittää tutkimuksen suolistoalueenmusiiniproteiininkoostumukesta ja siinä ilmenevästä varhaisesta tulehdusvaiheesta ja syövästä. https://gupea.ub.gu.se/handle/2077/56912
Terminologiasta:
https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Smallintestine_layers2.png
Karolina Sjöberg
Jabbar Early stage inflammation and cancer as reflected in the
gastrointestinal mucus composition http://hdl.handle.net/2077/56912 ISBN 978-91-7833-128-4(PDF)
Väitöstilaisuus
12.11.2018)
Suomennosta tiivistelmästä
MUCUS,
musiini,lima-aines, peittää kehon sisäisiä välipintoja
miljöön suuntaan tehden ihmisen kykeneväksi vitaaliin
interaktioon ulkopuolisen maailman kanssa. Musiini rakentuu
musiiniproteiineista, jotka ovat tärkeitä ihmisen
puolustuskyvyssä infektioita ja tulehduksia vastaan, mutta ne
antavat myöskin oman osansa karsinogeneesiin (pahanlaatuisen kasvannaisen) ja tuumorien ( yl. kasvannaisten) kehittymiseen.
Näitä musiinibiologian eri näkökohtia
valaistaan esimerkein tämän väitökirjan osatöissä,
jotka kaikki perustuvat massaspektrometrisiin tutkimuksiin.
Aihepiiri kattaa alueita haimasyövän varhaisdiagnostiikan
musiinibiomerkitsijöistä aivan viimeaikaisiin
löytöihin musiiniin liittyvän bakteerin ja IBS
(irritable bowel syndrome):n kesken vallitsevasta assosioitumisesta.
IBS on ärtyneen suoliston oireyhtymä.
Mucus covers our inner interfaces towards the environment, providing protection while enabling vital interaction with the outside world. The mucus is built around mucin proteins, which are important for our defences against infection and inflammation, but may also contribute to carcinogenesis and tumour progression. These divergent aspects of mucin biology are exemplified in the different studies in this thesis, which are all based on mass spectrometry. The topics covered range from mucin biomarkers for the early diagnosis of pancreatic cancer, to the discovery of a link between a mucus-associated bacterial genus and irritable bowel syndrome.
Haimasyöpä (Pancreatic cancer, bukspottskörtelcancer) on suhteellisen harvinainen tuumorimuoto, mutta on arveltu sen muodostuvan syöpäkuolemien syinä USA:ssa vuonna 2030 toisena johtavaksi. Kehno prognoosi selvittyy suureksi osaksi myöhäisestä havaitsemisesta. Kuvaantamistekniikan edistymisen takia pystytään havaitsemaan haimasyövän kystisiä prekursoreita (edeltäjiä) nousevaan tahtiin ja tästä taas tulee uutta mahdollisuutta preventioon eli ennaltaehkäisemiseen ja parantavaan hoitoon. Epäonnea on kuitenkin sikäli, että saatavilla olevat diagnostiset työvälineet eivät ole riittävän runsaita, jotta voitaisiin suorittaa täsmäinterventiota suuren riskin kystisiin (kasvainrakko-) leesioihin.
Pancreatic cancer is a relatively rare tumour form, but is postulated to become the second leading cause of cancer deaths in the United States by 2030. The poor prognosis is largely explained by late detection. With advances in imaging, cystic precursors of pancreatic cancer are detected with increasing frequency, offering an unprecedented opportunity for prevention and cure. Unfortunately, available diagnostic tools are not sufficiently robust to enable targeted intervention against high-risk cystic lesions.
Tässä työssä kuvataan massapektrometriaan perustuvia musiinin kvantifioimismenetelmiä sekä muita haimakystanestenäytteiden biomerkitsijöitä, niiden kehittymistä ja arviointia. Eräässä prospektiivisessa arviointikohortissa analyysi tunnisti haimasyövän kystisiä prekursoreita 97%;n tarkkuudella. Tämä tulos edustaa merkitsevää kohentumista hyväksyttyihin j akäytössä oleviin ( state of the art-) diagnostisiin metodeihin. Täten analyysin kliininen implementoiminen (käytäntöön soveltaminen) saattaa nopeuttaa haimasyövän varhaista havaitsemista, mikä on edellytys, jotta elossapysymisluvut saadaan kohenemaan.
Here, we describe the development and evaluation of a mass spectrometry based method for quantification of mucins and other biomarkers in pancreatic cyst fluid samples. In a prospective validation cohort, the analysis identified cystic precursors of pancreatic cancer with 97% accuracy. This result represented a significant improvement upon state-of-the-art diagnostic methods. Thus, clinical implementation of the analysis may facilitate early detection of pancreatic cancer, which is a prerequisite for increasing survival rates.
Haavainen paksunsuolentulehdus (UC) on tulehduksellinen suolistotauti, jonka kulku on kroonista ja siinä tapahtuu ajoittaisia pahenemisvaiheita (relapseja). Nykyisen käsityksen mukaan ulseratiivinen ( haavoja muodostava) koliitti (paksunsuolentulehdus) (UC) johtuu epäasianmukaisista vuorovaikutuksista paksunsuolen mikrobioottien (mikrobiomin) ja isäntäkehon immunivasteen kesken geneettisen alttiuden pohjustaessa tilanteen. Normaalisti on suoliontelon (ontelo= lumen) runsas mikrobimäärä eristäytyneenä paksusuolen epiteelistä (pintasolukerroksesta) ja tällaista olotilaa pitää yllä läpäisemätön mukoosaeste (limakalvojärjestelmän antama suojakerros).
Tässä väitöstyössä havaittiin epänormaaliuksia mukoosaproteiinien koostumuksessa haavaista paksunsuolentulehdusta (UC) potevilla henkilöillä niissäkin näytteissä, jotka oli otettu tulehtumattomista kohdista. Tämä viittaa siihen, että paksusuolen mukoosakerroksen rakenteellinen heikentyminen voisi olla taudin kehittymisessä merkityksellinen seikka. Eri potilaiden kesken ulseratiivisen koliitin luonnollinen kulku vaihtelee huomattavasti.
Prognostiset eli ennustetta taudin kulusta antavat merkitsijät voinevat vähentää relapseja eli taudin uusiintumia ja kolektomioita (paksunsuolen poistoa vaativia leikkauksia) ja tarpeetonta lääkkeen käyttöä.
Ulcerative colitis is an inflammatory bowel disease with a chronic and relapsing course. According to the current view, ulcerative colitis results from inappropriate interactions between colonic microbiota and host immunity, against a background of genetic susceptibility. Normally, the abundant luminal microbes are segregated from the colonic epithelium, through an impervious mucus barrier. Here, abnormalities in mucus protein composition were detected in ulcerative colitis patients, also in samples from non-inflamed areas. This implies that structural weakening of the colonic mucus barrier could be important for the development of the disease. The natural history of ulcerative colitis varies considerably between patients. Prognostic markers for the disease course could reduce relapses and colectomies, as well as the unnecessary use of medication.
Tässä työssä tutkijat tunnistivat paksusuolesta kaksi mucus -ryhmän proteiinia, joiden välinen suhde osoittautui vahvaksi ennusteeksi intensiivisemmän lääkityksen tai kirurgian tarpeesta tulevan viiden vuoden aikajaksona. Mielenkiintoinen seikka oli, että nämä kaksi proteiinia säätivät eri tavoin spesifisten mikrobiaalisten ligandiensa tunnistamisen. Muuntunut tasapaino näissä proteiineissa näytti assosioituvan bakteeriendosporien infiltroitumiseen (tunketumiseen) paksunsuolen lamina propriaan. Täten voidaan ajatella, että endosporien ajoittaiset aktivoitumiset saattaisivat antaa oman osansa vaikeaa ulseratiivista koliittia (UC) potevien taudin uusiutumisiin.
Herein, we identified a ratio of two proteins in colonic mucus as a powerful predictor of the requirement for intensified medication or surgery during a five year period. Interestingly, these two proteins differentially regulate the sensing of specific microbial ligands. An altered equilibrium of these proteins was tentatively associated with infiltration of bacterial endospores in the colonic lamina propria. Thus, intermittent activation of endospores may conceivably contribute to relapses in patients with severe ulcerative colitis.
Brachyspira - bakteerisuvussa on useita patogeenisia lajeja. Tässä väitöstyössä havaittiin kolmanneksella IBS- potilaista Brachyspira- kolonisaatiota paksunsuolen epiteelin pinnalla ja sisemmässä musiinikerroksessa, kun taas terveillä tällaista oli harvoin havaittavissa.
Lisäksi liittyi Brachyspira-kolonisaatio selvästi erotettavaan oirekirjoon sekä limakalvon immuunivasteeseen. Tämä viittaisi siihen, että tähän potilasryhmään kohdennetulla antibioottihoidolla voitaisiin vähentää IBS – taudin morbiditeettin painolastia.
Näiden tutkijoiden mukaan kuitenkin antibioottihoito aiheutti paradoksaalisesti Brachyspira-invaasion limasolujen (goblet-solujen) mukoosijyväsiin. Tämä havainto edustanee bakteerin taholta jotain uutta evaasiostrategiaa ja niinpä se selviääkin elinvoimaisena antibiootista.Tämänkin tutkimuksen tulos viittaa sellaisen mahdollisuuden olemassaoloon ottaen huomioon ymmärtämyksemme terapiaresistenteistä infektioista ja patogeenin pinttyneisyydestä suolistoreservoaareissaan.
Brachyspira is a bacterial genus that includes several pathogenic species. In this thesis, Brachyspira colonization of the colonic epithelial surface and inner mucus layer was detected in one third of IBS patients, but rarely observed in healthy individuals. Furthermore, Brachyspira colonization was associated with a distinctive symptom profile and mucosal immune response. This suggests that targeted antibiotic therapy of this patient group may reduce the morbidity burden of IBS. However, in our investigation antibiotic treatment paradoxically resulted in Brachyspira invasion of goblet cell mucus granules. This observation may represent a novel bacterial strategy to evade and survive antibiotic treatment, with potential, broad implications for our understanding of therapy resistant infections and pathogen persistence in the intestinal reservoir.
Työn
otsikkona sisältö: Gastrointestinaalisen musiinin, lima-aineksen, koostumus heijastaa
varhaisasteen tulehdusta ja syöpää ja antaa
viitettä diagnoosista, prognoosista ja patogeneesista.
Karolina Sjöberg Jabbar. Early stage inflammation and
cancer as reflected in the gastrointestinal mucus composition:
implications for diagnosis, prognosis and
pathogenesis
https://gupea.ub.gu.se/handle/2077/56912
Tässä
väitöskirjassa on neljä osatyötä.
Ensimmäisessä
osatyössä selvitettiin haimasyövän kystisiä prekursoreita
tunnistamalla niiden musiinikirjoa. Jabbar KS et al.(2014)
Proteomic mucin profiling for the identification of cystic precursors
of pancreatic cancer.
Toisessa osatyössä kohdennetulla
massaspektrometrisellä tutkimuksella saatiin hyvin tarkasti
tunnistettua haimasyövälle tyypillisiä kystisten
prekursoreiden leesioita (vaurioita; leesio = vaurio).
van der Post, Jabbar KS et al.
(2018). Highly accurate identification of cystic precursor lesions of
pancreatic cancer through targeted mass spectrometry: a phase IIc
diagnostic study.
Kolmannessa osatyössä
selvitettiin haavaisen paksunsuolentulehduksen (UC)
patogeneesin varhaistapahtumaa, paksusuolimusiinien muodostaman
estävän kerroksen rakenteellista heikentymistä.
Jabbar
KS, van der Post et al. Structural weakening of the colonic
mucus barrier is an early event in ulcerative colitis (UC)
pathogenesis (submitted).
Neljännen osatyön
otsikkona on: Kolonin musiiniesteen proteiinikompositio antaa
ennusteen ulseratiivista koliittia (UC) potevien
taudinkulusta.(Paksusuoli on latinaksi Colon).
Jabbar KS, van der Post et al. The
protein composition of the colonic mucus barrier predicts disease
course in ulcerativat colitis (UC) patients. (Manuscript).
Viidennen
osatyön otsikkona on tulokset tutkimuksista
Brachyspira-mikrobilajeista paksusuolen epiteelissä ja sisemmässä
musiinikerroksessa: Tutkijat arvelevat näiden
bakteerien läsnäolon korreloivan taudinkehitykseen
kolmasosalla IBS- potilaista.
Simren M, Hansson GC, Jabbar KS
et al. The presence of Brachyspira species
in the colonic epithelium and inner mucus layer may be linked to
disease development in up to a third of IBS patients.
(Manuscript).
Muistiin 2.11. 2018 ensimmäisen kerran. Päivitystä ja siirto 13.2. 2023 sivulle.