Kun E1 on monoubikitinoitunut, rekrytoituu spesifinen deubkitinaasikin (DUB), joka irrottaa aktivoituneen ubikitinaasiin seuraaviin entsyym tapahtumiin. Deubikitinaaseja on hyvin runsaasti, ja ne ovat lajiteltu 5 eri ryhmään.
Deubikitinaasien vaikutuksesta muodostuu myös erikokoisia ubikitiinejä ja monoubikitiiniä, joten se on toinen tie ubikitiinin mudoostumseen de novo syntessin ohella.
Kaavakuva tästä ubikitiinialtaasta , jonka kokoon vaikutaa DUB-entyymien joukko. Ubikitiini on ainenvaihdunnallinen funktionaalinen tuote, työkalu, moduli, modifioiva molekyyli, jota käytetään aikansa, kunnes se virttyy itsekin kuten kaikki työkaluproteiinit virttyvät ja vanhenevat ja siten se hajoitetaan myös tai yritetään ainakin hajoitata. (Tällainen hajoituskohde analogisedsti on mm kolesteroli, sekin toimii aikansa ja sitten sitä keotetaan purkaa ja erittää pois kehosta, mutta koska se taas on niin vaikea molekyylirengas, se ei käyty loppuvaiheissaankaan energiaksi eikä muiden rakennusaineiden osiksi). Ubikitiini taas on aminohapoista ,joita voidaan sitten vielä hyödyntää aikansa ja jopa käyttää enrgiaksi tarvittaessa osia siitä, sillä se on kuitenkin vain proteiiniketjua. Toisissa ubikitiineisssä kuitenkin muodostuu kidemäinen rakenne sinkki-struktuurien takia helposti, joten niiden eritys tai metabolinen hajoittuminen voi kompromittoitua ja havaitaan sitten aggresomeissa myös ubikitiiniä. Toinen monoubikitiini- sinkkipitoinen fuusioproteiini on C-terminaalin osalta sinkkipitoinen, mikä ilmeisesti mahdollistaa ei lineaarisia hahmoja, joissa vaikuttaa olevan rubredoxiinin kaltaisen ( Zn-ribbon) kulman vaikuttamaa heijastusta, arvelen.
https://ai2-s2-public.s3.amazonaws.com/figures/2017-08-08/502e7ab3db4438511bd316d0bab6efec474cb684/4-Figure3-1.png
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar