Exosomal shuttle RNA
GENOMIMATERIAALITUTKIMUKSEN ALALTA on uutta väitöskirjaa tulossa tässä kuussa (www.ub.gu.se)
Ekström, Karin (2008) Exosomes, exosomal, shuttle
RNA, esRNA, RNA, vesicles, mast cell, gene transfer, microRNA.Sahlgrenska Academy. (24.5.208) ISBN:
978-91-628-7455-1
Mitä asiaa väitöskirja selvittää? hahmottelua asiasta suomeksi:
TAUSTA:
EXOSOMIT ovat pieniä kalvoja omaavia nanorakkuloita, joiden alkuperä on endosyyttinen. Monet erilaiset solut kykenevät vapauttamaan näitä rakkuloita solun ulkopuoliseen miljööseen.
EXOSOMEJA löytyy useista kehonesteistä, kuten veriplasmasta, rintamaidosta, bronkoalveolaarisesta huuhtelunesteestä ja virtsasta, joten tästä näkyy niiden tärkeys kehossa.
EXOSOMEILLA on sanottu olevan monia eri funktioita ja niiden uskotaan osallistuvan solujen väliseen kommunikatioon.
EXOSOMIEN uskottiin aiemmin muodostuvan vain lipidikaksoiskelmusta ja proteiineista, mutta ei nukleiinihapoista.
VÄITÖSKIRJATYÖN TARKOITUKSENA oli ensin selvittää mast-solujen ( syöttösolujen) EXOSOMIEN rakenne ja toiminta fokusoiden juuri niitten nukleohappopitoisuuteen ja solu-solu-(C-C) kommunikatioon.
METODI:
Tutkijat käyttivät kahdesta eri mast-solulinjasta vapautuvia EXOSOMEJA sekä koe-eläimen (hiiren) luuytimen mast-soluja. EXOSOMIT eristettiin ja niiden havaittiin olevan pieniä 40-80 nm kalvorakkuloita, joissa oli havaittavissa positiiviset (+) merkitsijät tetraspaniinit CD9, CD63 ja CD81 elektronimikroskopialla ja virtaussytometrialla tutkien.
Ensimmäistä kertaa tässä voitiin osoittaa, että mastsolujen EXOSOMIT sisälsivät RNA- ainesta , mutta ei DNA ainesta.
EXOSOMAALINEN RNA erosi donorisolun RNA:sta.
EXOSOMIT sisälsivät hyvin vähän tai ei ollenkaan ribosomaalista RNA-ainesta, mutta huomattavan määrän pientä RNA:ta ( small RNA).
RNA luonnehdittiin käyttäen tekniikkana Affymetrix DNA microarray-menetelmää ja mikro-RNA-analyysiä (microRNA array analysis).
Havaittiin, että EXOSOMIT sisälsivät valikoiman sekä mikro-RNA:ta että mRNA:ta.
EXOSOMEISTA havaittiinkiin joukko mRNA- materiaa, jonka kaltaista ei ollut niitten donorisoluissa.
Kokeiltaessa kulkeutumisia (transfer), havaittiin että EXOSOMAALINEN RNA sukkuloi toisiin mast-soluihin ja CD34(+) -progeniittorisoluihin.
EXOSOMAALINEN RNA on funktionaalista, mikä osoitettiin sekä translaatioilla koeputkitasossa että hiiren EXOSOMAALISEN RNA:n translaatiolla hiiren proteiiniksi ihmisen mastsoluun siirtämisen ( transfer) jälkeen.
YHTEENVETONA tutkija kirjoittaa, että mast-solujen EXOSOMIT sisältävät lähettiRNA (mRNA)- ja mikroRNA- peräistä nukleiinihapporakennetta, mitä solut voivat vapauttaa toiseen soluun.
EXOSOMAALINEN RNA sukkulointi ( shuttle) saattaa olla vahva kommunikaatiotapa solujen kesken joko mikromiljöön tasossa tai etävaikutuksena.
Tutkijat ehdottavat, että tällaista RNA-materiaalia kutsuttaisiin nimellä EXOSOMAALINEN sukkuloiva RNA, esRNA,
Exosomal RNA shuttle may be a powerful mode of communication between cells, either in the microenvironment or over a distance. We propose that this RNA be called “exosomal shuttle RNA” (esRNA).
Muistiin18/04/2008 07:48
KOMMENTTI:
Näin genomitutkimuksen huiman kehityksen aikana näyttää löydettävän aina uutta nukleiinihappomateriaalia ja kun tietää sen monipolviset replikaatio- ja toistumis- ja translaatio taipumukset, on oletettavaa että sillä on oma silppurilaitteensa, koska ihmiset kuitenkin ovat jokseenkin hahmonsa pitäviä koko ikänsä ajan. ( kvaliteettikontrolli, degradaatiotie)
Genominen defensiivisyyskin on alue mikä ei ole vielä täysin hallinnassa, koska se on alue missä esim genomin tulisi pystyä erottamaan provirukset itsestään global genomin referenssille vieraina. Jossain solumuodossa niillä voisi piillä olla tarolla genominen referenssi.
Tällä alueella joudutaan näihin pienten RNA- materiaalien tasoon, josta tämä tutkimus toi jälleen yhden pienen tekijän lisää esRNA. Mistä se ottaa koodinsa? Mitä DNA:ta se heijastaa. Mikä määrää sen tavan koostua?
Koska kyse on mastsolusta, joka kuuluu puolustusarsenaaliin, näistä tekijöistä voi löytää sellaisia puolustuksellisia interferenssikykyisiä kappaleita kuka ties, e h k ä korjauslukukoodin säilyttäviä minimaalisia jaksoja. tai tuskin jos periaate on immunologinen monipuolinen vaste. Enpä tiedä. Uskon ainakin että näissä on jotain hyvää funktiota. Mikä on esRNA- materiaalin distanssivaikutus ei tietystikään ole vielä selvillä. kun ajattelee ihmissolua jossa on tuma, DNA ja mitokondriot ja mtDNA sulassa sovussa, niin näyttää olevan alaintegraatioitakin analogisesti.
Väitöstilaisuus on tulevaisuudessa. Tästä abstaktista ei käy ilmi mitä tutkija itse arvelee esRNA- funktioiksi.
VIITEKUVA LAADUNKONTROLLI
EXOSOMI KONTROLLOI RNA laadun.
